| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 2 | 164,574 | G→A | intergenic (‑256/+640) | unknown ← / ← unknown | Integrase/Uncharacterized protein YnbE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 2 | 164,574 | 0 | G | A | 100.0% | 243.7 / NA | 91 | intergenic (‑256/+640) | unknown/unknown | Integrase/Uncharacterized protein YnbE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (55/36); total (55/36) | |||||||||||
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ataaaaaGCCCTTAAAGTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAG‑TGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGCTTCGATCCTCAAACGGTGGCTTCCACACGAGCTCGTTTTGGTTTg > 1:374889/3‑251 (MQ=255) taaaaaGCCCTTAAAGTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATcc < 1:179831/158‑1 (MQ=255) cttaaagTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGCTTCGATCCTCAAACGGTGGCTTCCACACGAGCTCGTTTTGGTTTGACTCCGCtt > 1:402298/7‑251 (MQ=255) cttaaagTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGCTTCGATCCTCAAACGGTGGCTTCCACACGAGCTCGTTTTGGTTTGACTCCGCtt > 1:43334/7‑251 (MQ=255) aagTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGc < 1:875347/191‑1 (MQ=255) aagTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGCTTCGATCCTCAAACGGTGGCTTCCACACGAGCTCGTTTTGGTTTGACTCCGCTTTAt > 1:315792/3‑250 (MQ=255) agTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGCtt < 1:110349/193‑1 (MQ=255) gTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGaca < 1:603038/156‑1 (MQ=255) 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TTTCTGAGAGTTGAAAACTGTTCTAAATAACTCCGACGGAGATTCAGACTTTTAAAAATTTGGATATAGCTAAAACATGAGCAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTATGGTTTTAGTTATACCGATTTTGTTATACGGCTATCAGTATAACTAAACGTATAACTAAAATTCAAGGATTTTATAGGATTGGGTAGGAACGCTTAGGATATAAAAAAGCCCTTGAGGTTAATATTTTCAAGGGCTTTTGGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGATTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGCTTCGATCCTCAAACGGTGGCTTCCACACGAGCTCGTTTTGGTTTGACTCCGCTTTATCCCCGTCTTACG > 2/164327‑164811 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |