| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 2 | 164,559 | T→C | intergenic (‑241/+655) | unknown ← / ← unknown | Integrase/Uncharacterized protein YnbE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 2 | 164,559 | 0 | T | C | 100.0% | 256.6 / NA | 89 | intergenic (‑241/+655) | unknown/unknown | Integrase/Uncharacterized protein YnbE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (53/36); total (53/36) | |||||||||||
CATATTGCTTCTTTCTGAGAGTTGAAAACTGTTCTAAATAACTCCGACGGAGATTCAGACTTTTAAAAATTTGGATATAGCTAAAACATGAGCAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTATGGTTTTAGTTATACCGATTTTGTTATACGGCTATCAGTATAACTAAACGTATAACTAAAATTCAAGGATTTTATAGGATTGGGTAGGAACGCTTAGGATATAAAAAAGCCCTTGAGGTTAATATTTTCAAGGGCTTTTGGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGATTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGCTTCGATCCTCAAACGGTGGCTTCCACACGAGCTCGTTTTGGTTTGACTCCGCTTTATCCC > 2/164316‑164802 | catatcgcttagttctGAGAGTTGAAAATTATTCTGAATAACTCTGACGGCAATTCAGACTTTTAAAAAATCAGGTATAGCTAAAACATGAGTAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTATGGTTTTAGTTATACCGATTTTGTTATACGGCTATCAGTATAACTAAACGTATAACTAAAATTCAAGGATTTTATAGGATTGGATAGGAACGCTTAGGATAT‑AAAAAGCCCTTAAAGTTAATACTTTCAAgg < 1:845765/239‑1 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aagTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGCTTCGATCCTCAAACGGTGGCTTCCACACGAGCTCGTTTTGGTTTGACTCCGCTTTAt > 1:315792/3‑250 (MQ=255) agTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGCtt < 1:110349/193‑1 (MQ=255) gTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGaca < 1:603038/156‑1 (MQ=255) gTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGc < 1:33879/191‑1 (MQ=255) 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CATATTGCTTCTTTCTGAGAGTTGAAAACTGTTCTAAATAACTCCGACGGAGATTCAGACTTTTAAAAATTTGGATATAGCTAAAACATGAGCAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTATGGTTTTAGTTATACCGATTTTGTTATACGGCTATCAGTATAACTAAACGTATAACTAAAATTCAAGGATTTTATAGGATTGGGTAGGAACGCTTAGGATATAAAAAAGCCCTTGAGGTTAATATTTTCAAGGGCTTTTGGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGATTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGCTTCGATCCTCAAACGGTGGCTTCCACACGAGCTCGTTTTGGTTTGACTCCGCTTTATCCC > 2/164316‑164802 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |