| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 2 | 164,551 | G→A | intergenic (‑233/+663) | unknown ← / ← unknown | Integrase/Uncharacterized protein YnbE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 2 | 164,551 | 0 | G | A | 100.0% | 221.4 / NA | 82 | intergenic (‑233/+663) | unknown/unknown | Integrase/Uncharacterized protein YnbE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (49/33); total (49/33) | |||||||||||
TTGTGCGTGCCATATTGCTTCTTTCTGAGAGTTGAAAACTGTTCTAAATAACTCCGACGGAGATTCAGACTTTTAAAAATTTGGATATAGCTAAAACATGAGCAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTATGGTTTTAGTTATACCGATTTTGTTATACGGCTATCAGTATAACTAAACGTATAACTAAAATTCAAGGATTTTATAGGATTGGGTAGGAACGCTTAGGATATAAAAAAGCCCTTGAGGTTAATATTTTCAAGGGCTTTTGGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGATTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGCTTCGATCCTCAAACGGTGGCTTCCACACGAGCTCGTTTTGGTTTG > 2/164306‑164787 | ttGTGCGTGCCATATCGCTTAGTTCTGAGAGTTGAAAATTATTCTGAATAACTCTGACGGCAATTCAGACTTTTAAAAAATCAGGTATAGCTAAAACATGAGTAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTATGGTTTTAGTTATACCGATTTTGTTATACGGCTATCAGTATAACTAAACGTATAACTAAAATTCAAGGATTTTATAGGATTGGATAGGAACGCTTAGGATAT‑AAAAAGCCCTTAAAGTTAat < 1:147236/251‑1 (MQ=255) 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ataaaaaGCCCTTAAAGTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAG‑TGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGCTTCGATCCTCAAACGGTGGCTTCCACACGAGCTCGTTTTGGTTTg > 1:374889/3‑251 (MQ=255) taaaaaGCCCTTAAAGTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATcc < 1:179831/158‑1 (MQ=255) | TTGTGCGTGCCATATTGCTTCTTTCTGAGAGTTGAAAACTGTTCTAAATAACTCCGACGGAGATTCAGACTTTTAAAAATTTGGATATAGCTAAAACATGAGCAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTATGGTTTTAGTTATACCGATTTTGTTATACGGCTATCAGTATAACTAAACGTATAACTAAAATTCAAGGATTTTATAGGATTGGGTAGGAACGCTTAGGATATAAAAAAGCCCTTGAGGTTAATATTTTCAAGGGCTTTTGGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGATTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGCTTCGATCCTCAAACGGTGGCTTCCACACGAGCTCGTTTTGGTTTG > 2/164306‑164787 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |