| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 2 | 164,518 | G→A | intergenic (‑200/+696) | unknown ← / ← unknown | Integrase/Uncharacterized protein YnbE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 2 | 164,518 | 0 | G | A | 100.0% | 195.3 / NA | 72 | intergenic (‑200/+696) | unknown/unknown | Integrase/Uncharacterized protein YnbE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (40/32); total (40/32) | |||||||||||
TTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAACGGCGTGATTGTGCGTGCCATATTGCTTCTTTCTGAGAGTTGAAAACTGTTCTAAATAACTCCGACGGAGATTCAGACTTTTAAAAATTTGGATATAGCTAAAACATGAGCAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTATGGTTTTAGTTATACCGATTTTGTTATACGGCTATCAGTATAACTAAACGTATAACTAAAATTCAAGGATTTTATAGGATTGGGTAGGAACGCTTAGGATATAAAAAAGCCCTTGAGGTTAATATTTTCAAGGGCTTTTGGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGATTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGCTTCGATCCTCAAACGGTGGCTT > 2/164274‑164764 | tttGTCTATTTTCGTGCTGTTTAGCGGTGTGATTGTGCGTGCCATATCGCTTAGTTCTGAGAGTTGAAAATTATTCTGAATAACTCTGACGGCAATTCAGACTTTTAAAAAATCAGGTATAGCTAAAACATGAGTAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTATGGTTTTAGTTATACCGATTTTGTTATACGGCTATCAGTATAACTAAACGTATAACTAAAATTCAAGGATTTTATAGGATTGGATAGGaa < 1:629674/251‑1 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ttttATAGGATTGGATAGGAACGCTTAGGATAT‑AAAAAGCCCTTAAAGTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGCTTCGATCCTCaaa > 1:702802/1‑251 (MQ=255) ttATAGGATTGGATAGGAACGCTTAGGATAT‑AAAAAGCCCTTAAAGTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGatttaatt < 1:267982/230‑1 (MQ=255) ttATAGGATTGGATAGGAACGCTTAGGATAT‑AAAAAGCCCTTAAAGTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGCTTCGATCCTCAAACg > 1:107541/1‑251 (MQ=255) ttATAGGATTGGATAGGAACGCTTAGGATAT‑AAAAAGCCCTTAAAGTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGGTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGCTTCGATCCTCAAAc > 1:485932/1‑250 (MQ=255) ggATTGGATAGGAACGCTTAGGATAT‑AAAAAGCCCTTAAAGTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGtt > 1:234182/1‑156 (MQ=255) ggATTGGATAGGAACGCTTAGGATAT‑AAAAAGCCCTTAAAGTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGaca > 1:311278/1‑196 (MQ=255) ggATTGGATAGGAACGCTTAGGATAT‑AAAAAGCCCTTAAAGTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTa < 1:333447/207‑1 (MQ=255) ggATTGGATAGGAACGCTTAGGATAT‑AAAAAGCCCTTAAAGTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCt < 1:539839/211‑1 (MQ=255) aTTGGATAGGAACGCTTAGGATAT‑AAAAAGCCCTTAAAGTTAATACTTTCAAGGGCTTTTAGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGTTTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGCTTCGATCCTCAAACGGTGGCtt > 1:796451/1‑251 (MQ=255) | TTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAACGGCGTGATTGTGCGTGCCATATTGCTTCTTTCTGAGAGTTGAAAACTGTTCTAAATAACTCCGACGGAGATTCAGACTTTTAAAAATTTGGATATAGCTAAAACATGAGCAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTATGGTTTTAGTTATACCGATTTTGTTATACGGCTATCAGTATAACTAAACGTATAACTAAAATTCAAGGATTTTATAGGATTGGGTAGGAACGCTTAGGATATAAAAAAGCCCTTGAGGTTAATATTTTCAAGGGCTTTTGGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGATTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGTTGAACCCCCGTCCGAAATTCCTCTGCCGTTAGCACTACACGTTTAGTCCGGTCTTTAAATTCACTTAATCCTGCGGACGGACACGCGACAATTAAGCTAGTTTGATTTAATTTAATGCTTCGATCCTCAAACGGTGGCTT > 2/164274‑164764 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |