| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 2 | 164,321 | T→C | intergenic (‑3/+893) | unknown ← / ← unknown | Integrase/Uncharacterized protein YnbE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 2 | 164,321 | 0 | T | C | 100.0% | 226.7 / NA | 82 | intergenic (‑3/+893) | unknown/unknown | Integrase/Uncharacterized protein YnbE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (37/45); total (37/45) | |||||||||||
TATTCCTCTCTAATTGCTCTTGCCTGCTGTAAGGAAATATCAGGGTATTTGCCAACGCCAATTAACGCCCTTTTCTTTGGTTGCGTGAAAGGCTTGTAATAGTTAAACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAACGGCGTGATTGTGCGTGCCATATTGCTTCTTTCTGAGAGTTGAAAACTGTTCTAAATAACTCCGACGGAGATTCAGACTTTTAAAAATTTGGATATAGCTAAAACATGAGCAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTATGGTTTTAGTTATACCGATTTTGTTATACGGCTATCAGTATAACTAAACGTATAACTAAAATTCAAGGATTTTATAGGATTGGGTAGGAACGCTTAGGATATAAAAAAGCCCTTGAGGTTAAT > 2/164080‑164557 | cccaaaaccctccaaaattctaaaccccaaaataaaaagaacgcagattgaagtggctaaaacaagtgcctttcccccacaagctttaaaaaacctgaaacgggaaACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAGCGGTGTGATTGTGCGTGCCAtatcgcttagttc < 1:677091‑M2/145‑6 (MQ=255) 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gtgcgtgcCATATCGCTTAGTTCTGAGAGTTGAAAATTATTCTGAATAACTCTGACGGCAATTCAGACTTTTAAAAAATCAGGTATAGCTAAAACATGAGTAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTATGGTTTTAGTTATACCGATTTTGTTATACGGCTATCAGTATAACTa < 1:68715/173‑1 (MQ=255) ccATATCGCTTAGTTCTGAGAGTTGAAAATTATTCTGAATAACTCTGACGGCAATTCAGACTTTTAAAAAATCAGGTATAGCTAAAACATGAGTAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTATGGTTTTAGTTATACCGATTTTGTTATACgg > 1:575303/1‑151 (MQ=255) | TATTCCTCTCTAATTGCTCTTGCCTGCTGTAAGGAAATATCAGGGTATTTGCCAACGCCAATTAACGCCCTTTTCTTTGGTTGCGTGAAAGGCTTGTAATAGTTAAACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAACGGCGTGATTGTGCGTGCCATATTGCTTCTTTCTGAGAGTTGAAAACTGTTCTAAATAACTCCGACGGAGATTCAGACTTTTAAAAATTTGGATATAGCTAAAACATGAGCAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTATGGTTTTAGTTATACCGATTTTGTTATACGGCTATCAGTATAACTAAACGTATAACTAAAATTCAAGGATTTTATAGGATTGGGTAGGAACGCTTAGGATATAAAAAAGCCCTTGAGGTTAAT > 2/164080‑164557 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |