| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 2 | 164,301 | C→T | T6T (ACG→ACA) | unknown ← | Integrase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 2 | 164,301 | 0 | C | T | 100.0% | 241.5 / NA | 90 | T6T (ACG→ACA) | unknown | Integrase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (44/46); total (44/46) | |||||||||||
TTCTGCGCAAGTAAAGATAAATATTCCTCTCTAATTGCTCTTGCCTGCTGTAAGGAAATATCAGGGTATTTGCCAACGCCAATTAACGCCCTTTTCTTTGGTTGCGTGAAAGGCTTGTAATAGTTAAACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAACGGCGTGATTGTGCGTGCCATATTGCTTCTTTCTGAGAGTTGAAAACTGTTCTAAATAACTCCGACGGAGATTCAGACTTTTAAAAATTTGGATATAGCTAAAACATGAGCAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTATGGTTTTAGTTATACCGATTTTGTTATACGGCTATCAGTATAACTAAACGTATAACTAAAATTCAAGGATTTTATAGGATTGGGTAGGAACGCTTAGGATATAAAA > 2/164059‑164540 | gcataaaatcgctttatacaacccaaaaccctccaaaattctgaacccccaaaggaaaagaccgcagatggaagtggctaaaacaagtgccttttccccacaagctttaaaaaaactgaaacgggaaACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAGCGGTGTGATtg < 1:194325‑M2/123‑1 (MQ=255) 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TTCTGCGCAAGTAAAGATAAATATTCCTCTCTAATTGCTCTTGCCTGCTGTAAGGAAATATCAGGGTATTTGCCAACGCCAATTAACGCCCTTTTCTTTGGTTGCGTGAAAGGCTTGTAATAGTTAAACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAACGGCGTGATTGTGCGTGCCATATTGCTTCTTTCTGAGAGTTGAAAACTGTTCTAAATAACTCCGACGGAGATTCAGACTTTTAAAAATTTGGATATAGCTAAAACATGAGCAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTATGGTTTTAGTTATACCGATTTTGTTATACGGCTATCAGTATAACTAAACGTATAACTAAAATTCAAGGATTTTATAGGATTGGGTAGGAACGCTTAGGATATAAAA > 2/164059‑164540 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |