| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 2 | 146,784 | G→T | V53F (GTT→TTT) | unknown → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 2 | 146,784 | 0 | G | T | 100.0% | 224.2 / NA | 85 | V53F (GTT→TTT) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (40/45); total (40/45) | |||||||||||
ACAGTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACGAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGGTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGCAAATTATTAAAGAAAGTGATAAAGATACTCTGTTGTTTTTAGATAAGATCATTGAAATATACGGTAAATTTGATGGACCTCAGTTATCTTGGATGACTCATCAACCTGAAACGGCATGGTCTATGGGACGTTTAGGA > 2/146550‑147029 | aCAGTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAg < 1:96971/242‑1 (MQ=255) 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1:24320/190‑1 (MQ=255) gCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGCAAATTATTAAAGAAAGTGATAAAGATACTCTGTTGTTTTTAGATAAGATCATTGAAATATACGGTAAATTTGATGGACCTCAGTTATCTTGGATGACTCATCAACCTGAAACGGCATGGt > 1:380375/1‑248 (MQ=255) ccTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGCAAATTATTAAAGAAAGTGATAAAGATACTCTGTTGTTTTTAGATAAGATCATTGAAATATACGGTAAATTTGATGGACCTCAGTTATCTTGGAt < 1:657322/221‑1 (MQ=255) ttgtttgAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGCAAATTATTAAAGAAAGTGATAAAGATACTCTGTTGTTTTTAGATAAGATCATTGAAATATACGGTAAATTTGATGGACCTCAGTTATCTTGGATGACTCATCAACCTGAAACGGCATGGTCTATggg < 1:185965/251‑1 (MQ=255) ttgtttgAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGCAAATTATTAAAGAAAGTGATAAAGATACTCTGTTGTTTTTAGATAAGATCATTGAAATATACGGTAAATTTGATGGACCTCAGTTATCTTGGATGACTCATCAACCTGAAACGGCATGGTCTATggg < 1:34132/251‑1 (MQ=255) ttgtttgAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGCAAATTATTAAAGAAAGTGATAAAGATACTCTGTTGTTTTTAGATAAGATCATTGAAATATACGGTAAATTTGATGGACCTCAGTTATCTTGGATGACTCATCAACCTGAAACGGCATGGTCTATggg < 1:347087/251‑1 (MQ=255) ttgtttgAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGCAAATTATTAAAGAAAGTGATAAAGATACTCTGTTGTTTTTAGATAAGATCATTGAAATATACGGTAAATTTGATGGACCTCAGTTATCTTGGATGACTCATCAACCTGAAACGGCATGGTCTATggg < 1:544523/251‑1 (MQ=255) 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1:244551/152‑1 (MQ=255) tttgAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGCAAATTATTAAAGAAAGTGATAAAGATACTCTGTTGTTTTTAGATAAGATCATTGAAATATACGGTAAATTTGATGGACCTCAGTTATCTTGGATGACTCATCAACCTGAAACGGCATGGTCTATGGGAc < 1:528750/250‑1 (MQ=255) aGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGc > 1:786843/1‑117 (MQ=255) ggggtTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGCAAATTATTAAAGAAAGTGATAAAGATACTCTGTTGTTTTTAGATAAGATCATTGAAATATACGGTAAATTTGATGGACCTCAGTTATCTTGGATGACTCATCAACCTGAAACGGCATGGTCTATGGGACGTTTAGGa < 1:879832/250‑1 (MQ=255) | ACAGTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACGAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGGTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGCAAATTATTAAAGAAAGTGATAAAGATACTCTGTTGTTTTTAGATAAGATCATTGAAATATACGGTAAATTTGATGGACCTCAGTTATCTTGGATGACTCATCAACCTGAAACGGCATGGTCTATGGGACGTTTAGGA > 2/146550‑147029 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |