| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 2 | 146,716 | G→A | R30Q (CGA→CAA) | unknown → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 2 | 146,716 | 0 | G | A | 100.0% | 175.6 / NA | 66 | R30Q (CGA→CAA) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (36/30); total (36/30) | |||||||||||
GTGTGGCAATTAAGGAACAAAATGTGAAGATACGCATGGTGTATTTACTCAAATTTACAAAGAAAATGGTGGTATACAGTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACGAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGGTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGCAAATTATTAAAGAAAGTGATAAAGATACTCTGTTGTTTTTAGATAAGATCATTGAAATATACGGTAAATT > 2/146475‑146962 | gtgtGGCAATTAAGGAACAAAATGTGAAGATACGCATGGTGTATTTACTCAAATTTACAAAGAAAATGGTGGTATACAGTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAAt > 1:78109/1‑251 (MQ=255)gtgtGGCAATTAAGGAACAAAATGTGAAGATACGCATGGTGTATTTACTCAAATTTACAAAGAAAATGGTGGTATACAGTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAAt > 1:520584/1‑251 (MQ=255) aaGGAACAAAATGTGAAGATACGCATGGTGTATTTACTCAAATTTACAAAGAAAATGGTGGTATACAGTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGc < 1:616027/251‑1 (MQ=255) gAACAAAATGTGAAGATACGCATGGTGTATTTACTCAAATTTACAAAGAAAATGGTGGTATACAGTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAAt > 1:510052/1‑251 (MQ=255) aTGTGAAGATACGCATGGTGTATTTACTCAAATTTACAAAGAAAATGGTGGTATACAGTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGt < 1:581967/232‑1 (MQ=255) aGATACGCATGGTGTATTTACTCAAATTTACAAAGAAAATGGTGGTATACAGTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTaa > 1:652115/1‑251 (MQ=255) aTACGCATGGTGTATTTACTCAAATTTACAAAGAAAATGGTGGTATACAGTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGc < 1:266050/251‑1 (MQ=255) tGGTGTATTTACTCAAATTTACAAAGAAAATGGTGGTATACAGTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATgg > 1:358984/1‑251 (MQ=255) gtgtATTTACTCAAATTTACAAAGAAAATGGTGGTATACAGTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGta < 1:640393/234‑1 (MQ=255) gtATTTACTCAAATTTACAAAGAAAATGGTGGTATACAGTTTTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCTTTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAg > 1:257416/1‑251 (MQ=255) aaaTGGTGGTATACAGTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATAc > 1:611873/1‑197 (MQ=255) ataCAGTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCttt > 1:667228/1‑210 (MQ=255) aCAGTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAg < 1:96971/242‑1 (MQ=255) gTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGt < 1:836847/175‑1 (MQ=255) gTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGt > 1:771359/1‑175 (MQ=255) gTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCtttgtt > 1:632619/1‑221 (MQ=255) gTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAggg > 1:824991/1‑227 (MQ=255) gTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAg < 1:212788/233‑1 (MQ=255) cAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCgg > 1:250505/1‑251 (MQ=255) aaGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCtttgtt < 1:199219/201‑1 (MQ=255) aaGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAAttt > 1:147462/1‑251 (MQ=255) ggTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGta > 1:820268/1‑172 (MQ=255) ggTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCttt < 1:193168/183‑1 (MQ=255) gTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTAc > 1:604731/1‑250 (MQ=255) ataCAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCAt > 1:373883/1‑251 (MQ=255) aTCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGcc > 1:41579/1‑185 (MQ=255) aTCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGtt > 1:639653/1‑251 (MQ=255) attatAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGt > 1:777480/1‑200 (MQ=255) attatAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAAtt > 1:649931/1‑251 (MQ=255) ttatAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGt < 1:641096/241‑1 (MQ=255) aGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATgg < 1:795652/152‑1 (MQ=255) aGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCtttgtt > 1:794367/1‑164 (MQ=255) aaTAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATctct < 1:161934/250‑1 (MQ=255) ggaggTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGcc > 1:396285/1‑151 (MQ=255) gaggTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGttt < 1:612945/249‑1 (MQ=255) aTTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGc < 1:702595/130‑1 (MQ=255) aTTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGaa < 1:723637/165‑1 (MQ=255) aTTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGa > 1:170472/1‑168 (MQ=255) aTTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGa > 1:108876/1‑251 (MQ=255) ttGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGat < 1:866052/251‑1 (MQ=255) gggTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAg < 1:815136/202‑1 (MQ=255) ttATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCGTTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATgg < 1:863150/250‑1 (MQ=255) ttATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATgg < 1:363706/250‑1 (MQ=255) ttATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATgg < 1:154912/250‑1 (MQ=255) ttCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATggggg > 1:754726/1‑250 (MQ=255) catatATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGACAAGACTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCTATGAAACCACAAAAATTAATATTTTATACGCAATCTTGGTGTATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTGCCGGAAATTTACCATGAGTTCAAGACATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATgg < 1:423181/241‑1 (MQ=255) cATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTAc > 1:32345/1‑235 (MQ=255) cATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATgg > 1:122176/1‑245 (MQ=255) cATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGaaa > 1:550887/1‑251 (MQ=255) tCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACa > 1:195772/1‑251 (MQ=255) cTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATgg > 1:792934/1‑242 (MQ=255) cTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAAc > 1:412841/1‑249 (MQ=255) gCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGt < 1:885377/219‑1 (MQ=255) gCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGCAAat > 1:637468/1‑251 (MQ=255) aaCTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATg < 1:273822/175‑1 (MQ=255) aCTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATggggg < 1:252636/230‑1 (MQ=255) cattGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGCAAATTATTaaag > 1:277561/1‑242 (MQ=255) ggCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTTCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTAc < 1:443488/201‑1 (MQ=255) ggCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGCAAATTATTAAAGAAAGTGATAAAg < 1:317538/245‑1 (MQ=255) gagaAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGCAAATTATTAAAGAAAGTGATAAAGATACTCTGTTGttttt < 1:548775/250‑1 (MQ=255) ttAACTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGCAAATTATTAAAGAAAGTGATAAAGATACTCTGTTGTTTTTAGATAAGATCATTGa < 1:376920/251‑1 (MQ=255) cTCCAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGta > 1:591418/1‑46 (MQ=255) ccAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGCAAATTATTAAAGAAAGTGATAAAGATACTCTGTTGTTTTTAGATAAGATCATTGAAAtata > 1:175375/1‑251 (MQ=255) cAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTTCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGt < 1:860371/161‑1 (MQ=255) cAATGAAACTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGCAAATTATTAAAGAAAGTGATAAAGATACTCTGTTGTTTTTAGATAAGATCATTGAAATATAc < 1:62422/251‑1 (MQ=255) cTACAAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGTTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGCAAATTATTAAAGAAAGTGATAAAGATACTCTGTTGTTTTTAGATAAGATCATTGAAATATACGGTAAAtt > 1:643353/1‑251 (MQ=255) | GTGTGGCAATTAAGGAACAAAATGTGAAGATACGCATGGTGTATTTACTCAAATTTACAAAGAAAATGGTGGTATACAGTATTGGTTTATAACAGAGAAAGGTATACAATCCTAAGCCAAATTTTAGTTTATTATAGAATAAGGAGGTAAATTGTGGGTTATTCATCTATTGCTATCGCCAACTCATTCATTGGCAAGGCTAATATTGGAGAAATTTCTAATTTAACTCCAATGAAACTACGAAAATTAATGTTTTATACGCAATCTTGGTATATTAAGCTTTATGGTAAGCCTTTGTTTGAGGGGGGGGTTGAAAGATGGCAATTTGGTCCGGTGCTACCGGAAATTTACCATGAGTTCAAACCATTTGGTTCTCGAATTATCTCTAGTTTTGGTACTGATATATGGGGGAAACAGCAAATTATTAAAGAAAGTGATAAAGATACTCTGTTGTTTTTAGATAAGATCATTGAAATATACGGTAAATT > 2/146475‑146962 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |