| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 366,792 | C→T | N221N (AAC→AAT) | unknown → | PTS system, mannitol‑specific IIC component / PTS system, mannitol‑specific IIB component (EC 2.7.1.197) / PTS system, mannitol‑specific IIA component (EC 2.7.1.197) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 366,792 | 0 | C | T | 100.0% | 223.6 / NA | 80 | N221N (AAC→AAT) | unknown | PTS system, mannitol‑specific IIC component / PTS system, mannitol‑specific IIB component (EC 2.7.1.197) / PTS system, mannitol‑specific IIA component (EC 2.7.1.197) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (41/39); total (41/39) | |||||||||||
ATTCTGGCGATTCTGTTCTTCTTTGTGGTCGGTCCGGTGGTGAAATCCTTAACCGAAGTGTTGGCGGCAGGCGTAAAAGTGTTAGTTGATAACAACTTGTTGCCATTAACCTCCATTTTCGTTGAACCGGCGAAGATTCTGTTCTTAAACAACGCCATTAACCATGGCATTTTCTCACCGCTTGGTATTCAACAATCACAAGAATTTGGTCAGTCCATTTTCTTCTTAATCGAAGCCAACCCGGGTCCGGGCTTGGGCGTGTTGTTAGCCTATATTTTCTTCGGTAAAGGGTCTGCTAAACAAACCGCAGGCGGTGCGGCGGTGATTCACTTCTTCGGCGGTATCCACGAAATCTATTTCCCTTATGTGTTAATGAATCCGCGCTTGTTACTCGCGGTTATTGCAGGCGGTATGTCCGGCGTGTTTACGTTGACTTTATTTAACGCAGGTTTAGTGTCACCGGCATCTCCGGGATCCATCAT > 1/366553‑367034 | atTCTGGCGATTCTGTTCTTCTTTGTGGTCGGTCCGGTGGTGAAATCCTTAACCGAAGTGTTGGCGGCAGGCGTAAAAGTGTTAGTTGATAACAACTTGTTGCCATTAACCTCCATTTTCGTTGAACCGGCGAAGATTCTGTTCTTAAACAACGCCATTAACCACGGCATTTTCTCACCGCTTGGTATTCAACAATCACAAGAATTTGGTCAGTCCATTTTCTTCTTAATCGAAGCCAAtccgggtccggg > 1:802811/1‑251 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aaTCACAAGAATTTGGTCAGTCCATTTTCTTCTTAATCGAAGCCAATCCGGGTCCGGGCTTGGGCGTGTTGTTAGCCTATATTTTCTTCGGTAAAGGGTCTGCTAAACAAACCGCAGGCGGTGCGGCGGTGATTCACTTCTTCGGCGGTATCCACGAAATCTATTTCCCTTATGTGTTAATGAATCCGCGCTTGTTACTCGCGGTTATTGCAGGCGGTATGTCCGGCGTGTTTACGTTGACTTTATTTAAc < 1:485832/251‑1 (MQ=255) tatccaggaagttGGTCAGTCCATTTTCTTCTTAATCGAAGCCAATCCGGGTCCGGGCTTGGGCGTGTTGTTAGCCTATATTTTCTTCGGTAAAGGGTCTGCTAAACAAACCGCAGGCGGTGCGGCGGTGATTCACTTCTTCGGCGGTATCCACGAAATCTATTTCCCTTATGTGTTAATGAATCCGCGCTTGTTACTCGCGGTTATTGCAGGCGGTATGTCCGGCGTGTTTACGTTGACTTTATTTAACg < 1:319334/240‑1 (MQ=255) cacaAGAATTTGGTCAGTCCATTTTCTTCTTAATCGAAGCCAATCCGGGTCCGGGCTTGGGCGTGTTGTTAGCCTATAttt > 1:826909/1‑81 (MQ=255) caAGAATTTGGTCAGTCCATTTTCTTCTTAATCGAAGCCAATCCGGGTCCGGGCTTGGGCGTGTTGTTAGCCTATATTTTCTTCGGTAAAGGGTCTGCTAAACAAACCGCAGGCGGTGCGGCGGTGATTCACTTCTTCGGCGGTATCCACGAAATCTATTTCCCTTATGTGTTAACGAATCCGCGCTTGTTACTCGCGGTTATTGCAGGCGGGATGTCCGGCGTGGTTACGTTGACTTTATTTAACGCAgg > 1:674268/1‑251 (MQ=255) 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ATTCTGGCGATTCTGTTCTTCTTTGTGGTCGGTCCGGTGGTGAAATCCTTAACCGAAGTGTTGGCGGCAGGCGTAAAAGTGTTAGTTGATAACAACTTGTTGCCATTAACCTCCATTTTCGTTGAACCGGCGAAGATTCTGTTCTTAAACAACGCCATTAACCATGGCATTTTCTCACCGCTTGGTATTCAACAATCACAAGAATTTGGTCAGTCCATTTTCTTCTTAATCGAAGCCAACCCGGGTCCGGGCTTGGGCGTGTTGTTAGCCTATATTTTCTTCGGTAAAGGGTCTGCTAAACAAACCGCAGGCGGTGCGGCGGTGATTCACTTCTTCGGCGGTATCCACGAAATCTATTTCCCTTATGTGTTAATGAATCCGCGCTTGTTACTCGCGGTTATTGCAGGCGGTATGTCCGGCGTGTTTACGTTGACTTTATTTAACGCAGGTTTAGTGTCACCGGCATCTCCGGGATCCATCAT > 1/366553‑367034 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |