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cTGCCGATGTGGTTAAAGTTCACTATACCGGTAAATTGCCGGACGGTACCGTATTTGACAGCTCCCGTGAGCGTGGAACGCCTGCTGAGTTTCCATTAAATCAAGTGATTAAAGGTTGGACCGAAGGTCTGCAATTAGTTAAAAAAGGCGGACAAATTGAGTTGGTCATTCCGGCGGACTTGGGGTACGGTGAGGACGGTGCGGGCGATAAAATTCCACCGCATTCCACACTTTACTTTGATATTGAAg < 1:209801/249‑1 (MQ=255) ccGATGTGGTTAAAGTTCACTATACCGGTAAATTGCCGGACGGTACCGTATTTGACAGCTCCCGTGAGCGTGGAACGCCTGCTGAGTTTCCATTAAATCAAGTGATTAAAGGTTGGACCGAAGGTCTGCAATTAGTTAAAAAAGGCGGACAAATTGAGTTGGTCATTCCGGCGGACTTGGGGTACGGTGAGGACGGTGCGGGCGATAAAATTCCACCGCATTCCACACTTTACTTTGATATTGAAGTATTg < 1:681089/251‑1 (MQ=255) aTGTGGTTAAAGTTCACTATACCGGTAAATTGCCGGACGGTACCGTATTTGACAGCTCCCGTGAGCGTGGAACGCCTGCTGAGTTTCCATTAAATCAAGTGATTAAAGGTTGGACCGAAGGTCTGCAATTAGTTAAAAAAGGCGGACAAATTGAGTTGGTCATTCCGGCGGACTTGGGGTACGGTGAGGAc < 1:685734/191‑1 (MQ=255) 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ggTTAAAGTTCACTATACCGGTAAATTGCCGGACGGTACCGTATTTGACAGCTCCCGTGAGCGTGGAACGCCTGCTGAGTTTCCATTAAATCAAGTGATTAAAGGTTGGACCGAAGGTCTGCAATTAGTTAAAAAAGGCGGACAAATTGAGTTGGTCATTCCGGCGGACTTGGGGTACGGTGAGGAc > 1:243683/1‑187 (MQ=255) aaGTTCACTATACCGGTAAATTGCCGGACGGTACCGTATTTGACAGCTCCCGTGAGCGTGGAACGCCTGCTGAGTTTCCATTAAATCAAGTGATTAAAGGt > 1:419136/1‑101 (MQ=255) gTTCACTATACCGGTAAATTGCCGGACGGTACCGTATTTGACAGCTCCCGTGAGCGTGGAACGCCTGCTGAGTTTCCATTAAATCAAGTGATTAAAGGTTGGACCGAAGGTCTGCAATTAGTTAAAAAAGGCGGACAAATTGAGTTGGTCATTCCGGCGGACTTGGGGTACGGTGAGGACGGTGCGGGCGATAAAATTCCACCGCATTCCACACTTTACTTTGATATTGAAGTATTGGACGTCACCCCgg > 1:136620/1‑250 (MQ=255) tCACTATACCGGTAAATTGCCGGACGGTACCGTATTTGACAGCTCCCGTGAGCGTGGAACGCCTGCTGAGTTTc < 1:472048/74‑1 (MQ=255) tCACTATACCGGTAAATTGCCGGACGGTACCGTATTTGACAGCTCCCGTGAGCGTGGAACGCCTGCTGAGTTTCCATTAAATCAAGTGATTAAAGGTTGGACCGAAGGTCTGCAAtt > 1:629551/1‑117 (MQ=255) tCACTATACCGGTAAATTGCCGGACGGTACCGTATTTGACAGCTCCCGTGAGCGTGGAACGCCTGCTGAGTTTCCATTAAATCAAGTGATTAAAGGTTGGACCGAAGGTCTGCAATTAGt > 1:662532/1‑120 (MQ=255) cTATACCGGTAAATTGCCGGACGGTACCGTATTTGTCAGCTCCCGTGAGCGTGGAACGCCTGCTGAGTTTCCATTAAATCAAGTGATTAAAGGTTGGACCGAAGGTCTGCAATTAGTTAAAAAAGGCGGACAAATTGAGTTGGTCATTCCGGCGGACTTGGGGTACGGTGAGGACGGTGCGGGCGATAAAATTCCACCGCATTCCACACTTTACTTTGATATTGAAGTATTGGACGTCACCCCGGCGAAAt > 1:509655/1‑251 (MQ=255) cTATACCGGTAAATTGCCGGACGGTACCGTATTTGACAGCTCCCGTGAGCGTGGAACGCCTGCTGAGTTTCCATTAAATCAAGTGATTAAAGGTTGGACCGAAGGTCTGCAATTAGTTAAAAAAGGCGGACAAATTGAGTTGGTCATTCCGGCGGACTTGGGGTACGGTGAGGACGGTGCGGGCGATAAAATTCCACCGCATTCCACACTTTACTTTGATATTGAAGTATTGGACGTCACCCCGGCGAAAt > 1:778658/1‑251 (MQ=255) ggTAAATTGCCGGACGGTACCGTATTTGACAGCTCCCGTGAGCGTGGAACGCCTGCTGAGTTTCCATTAAATCAAGTGATTAAAGGTTGGACCGAAGGTCTGCAATTAGTTAAAAAAGGCGGACAAATTGAGTTGGTCATTCCGGCGGACTTGGGGTACGGTGAGGACGGTGCGGGCGATAAAATTCCACCGCATTCCACACTTTACTTTGATATTGAAGTATTGGACGTCACCCCGGCGAAATAACCTGa > 1:783685/1‑251 (MQ=255) ttGCCGGACGGTACCGTATTTGACAGCTCCCGTGAGCGTGGAACGCCTGCTGAGTTTCCATTAAATCAAGTGATTAAAGGTTGGACCGAAGGTCTGCAATTAGTTAAAAAAGGCGGACAAATTGAGTTGGTCATTCCGGCGGACTTGGGGTACGGTGAGGACGGTGCGGGCGATAAAATTCCACCGCATTCCACACTTTACTTTGATATTGAAGTATTGGAc < 1:210849/222‑1 (MQ=255) | AAAGAAATCGCCTCTACCTTGCAAGGCATTAATGCCAAGTTAAAAGCGGAAAATGAAAAACGTGTCGCCGCCATGGTGAAAAAAGCGGAAGAAGAAGGCAAAAAATTCACGGCAGAATTTGCTAAGAAAGATGGCGTGAAGAAAACTGCTTCCGGTTTGTTATATCGTGTGGAAAAAGAAGGGTCCGGTGATGCCATTAAAGCTGCCGATGTGGTTAAAGTTCACTATACCGGTAAATTGCCGCACGGTACCGTATTTGACAGCTCCCGTGAGCGTGGAACGCCTGCCGAGTTTCCATTAAATCAAGTGATTAAAGGTTGGACCGAAGGTCTGCAATTAGTTAAAAAAGGCGGACAAATTGAGTTGGTCATTCCGGCGGACTTGGGGTACGGTGAGGACGGTGCGGGCGATAAAATTCCACCGCATTCCACACTTTACTTTGATATTGAAGTATTGGACGTCACCCCGGCGAAATAACCTGA > 2/138935‑139416 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |