| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 2 | 132,481 | C→A | G32G (GGC→GGA) | unknown → | Heterodimeric efflux ABC transporter, permease/ATP‑binding subunit 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 2 | 132,481 | 0 | C | A | 100.0% | 198.2 / NA | 70 | G32G (GGC→GGA) | unknown | Heterodimeric efflux ABC transporter, permease/ATP‑binding subunit 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (38/32); total (38/32) | |||||||||||
GAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTA‑TTTTTTATTTAACCGTTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGCTGATAAATACGGTCGCCAACAGCAAAAAATGGATTGCGATTAATGTATTGTGGAACTGGGTTGCATTAATTGGCGGCATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGCCGTTTGTTTGCAATGGGCGTTTGAGCGTTCGCTTACCCTCCAAAGTGCGGTTATTTTTACCGTCGTTTTAATTGCCTGTTTGGCACTACGTGCCTGGGCGGGCAAAATGGCAGTGAAAGCGTCCTATAAAGCCAGTACGCAGGTGAAACACAAATTACGCACGCTGATTTATCAAAAACTGTCTTCCATGCCGCTTAATCAAGTAAATCAACAAT > 2/132236‑132719 | gAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGCTGATAAATACGGTCGCCAACAGCAAAAAATGGATTGCGATTAATGTATTGTGGAACTGGGTTGCATTAATTGGCGGAatta > 1:451298/1‑251 (MQ=255) 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(MQ=255) gTCGCCAACAGCAAAAAATGGATTGCGATTAATGTATTGTGGAACTGGGTTGCATTAATTGGCGGAATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGCCGTTTGTTTGCAATGGGCGTTTGAGCGTTCg < 1:121777/120‑1 (MQ=255) tGGATTGCGATTAATGTATTGTGGAACTGGGTTGCATTAATTGGCGGAATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGCCGTTTGTTTGCAATGGGCGTTTGAGCGTTCGCTTACCCTCCAAAGTGCGGTTATTTTTACCGTCGTTTTAATTGCCTGTTTGGCACTACGTGCCTGGGCGGGCAAAATGGCAGTGAAAGCGTCCTATAAAGCCAGTACGCAGGTGAAACACAAATTACGCACGCTGATTTATCAAAAACt < 1:92570/251‑1 (MQ=255) gCGATTAATGTATTGTGGAACTGGGTTGCATTAATTGGCGGAATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGCCGTTTGTTTGCAATGGGCGTTTGAGCGTTCGCTTACCCTCCAAAGTGCGGTTATTTTTACCGTCGTTTTAATTGCCTGTTTGGCACTACGTGCCTGGGCGGGCAAAATGGCAGTGAAAGCGTCCTATAAAGCCAGTACGCAGGTGAAACACAAATTACGCACGCTGATTTATCAAAAACTGTCtt > 1:275213/1‑250 (MQ=255) cGATTAATGTATTGTGGAACTGGGTTGCATTAATTGGCGGAATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGCCGTTTGTTTGCAATGGGCGTTTGAGCGTTCGCTTACCCTCCAAAGTGCGGTTATTTTTACCGTCGTTTTAATTGCCTGTTTGGCACTACGTGcc > 1:230398/1‑158 (MQ=255) 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gTATTGTGGAACTGGGTTGCATTAATTGGCGGAATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGCCGTTTGTTTGCAATGGGCGTTTGAGCGTTCGCTTACCCTCCAAAGTGCGGTTATTTTTACCGTCGTTTTAATTGCCTGTTTGGCACTACGTGCCTGGGCGGGCAAAATGGCAGTGAAAGCGTCCTATAAAGCCAGTACGCAGGTGAAACACAAATTACGCACGCTGATTTATCAAAAACTGTCTTCCATGCCg > 1:288462/1‑249 (MQ=255) ttGTGGAACTGGGTTGCATTAATTGGCGGAATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGCCGTTTGTTTGCAATGGGCGTTTg < 1:306411/76‑1 (MQ=255) tgtgGAACTGGGTTGCATTAATTGGCGGAATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGCCGTTTGTTTGCAATGGGCGTTTGAGCGTTCGCTTACCCTCCAAAGTGCGGTTATTTTTACCGTCGTTTTAATTGCCTGTTTGGCACTACGTGCCTGGGCGGGCAAAATGGCAGTGAAAGCGTCCTATAAAGCCAGTACGCAGGTGAAACACAAATTACGCACGCTGATTTATCAAAAACTGTCTTCCATGCCGCTTAAt < 1:63308/251‑1 (MQ=255) tgGAACTGGGTTGCATTAATTGGCGGAATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGCCGTTTGGTTGCAATGGGCGTTTGAGCGTTCGCTTACCCTCCAAAGTGCGGTTATTTTTACCGTCGTTTTAATTGCCTGTTTGGCACTACGTGCCTGGGCGGGCAAAATGGCAGTGAAAGCGTCCTATAAAGCCAGTACGCAGGTGAAACACAAATTACGCACGCTGATTTATCAAAAACTGTCTTCCATGCCGCTTAATCa < 1:462691/251‑1 (MQ=255) gAACTGGGTTGCATTAATTGGCGGAATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGCCGTTTGTTTGCAATGGGCGTTTGAGCGTTCGCTTACCCTCCAAAGTGCGGTTATTTTTACCGTCGTTTTAATTGCCTGTTTGGCACTACGTGCCTGGGCGGGCAAAATGGCAGTGAAAGCGTCCTATAAAGc < 1:438283/180‑1 (MQ=255) gggTTGCATTAATTGGCGGAATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGCCGTTTGTTTGCAATGGGCGTTTGAGCGTTCGCTTACCCTCCAAAGTGCGGTTATTTTTACCGTCGTTTTAATTGCCTGTTTGGCACTACGTGCCTGGGCGGGCAAAATGGCAGTGAAAGCGTCCTATAAAGcc < 1:718305/176‑1 (MQ=255) gggTTGCATTAATTGGCGGAATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGCCGTTTGTTTGCAATGGGCGTTTGAGCGTTCGCTTACCCTCCAAAGTGCGGTTATTTTTACCGTCGTTTTAATTGCCTGTTTGGCACTACGTGCCTGGGCGGGCAAAATGGCAGTGAAAGCGTCCTATAAAGCCAGTACGCAGGTGAAACACAAATTACGCACGCTGATTTATCAAAAACTGTCTTCCATGCCGCTTAATCAAGTAaat > 1:432428/1‑251 (MQ=255) gTTGCATTAATTGGCGGAATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGCCGTTTGTTTGCAATGGGCGTTTGAGCGTTCGCTTACCCTCCAAAGTGCGGTTATTTTTACCGTCGTTTTAATTGCCTGTTTGGCACTACGTGCCTGGGCGGGCAAAATGGCAGTGAAAGCGTCCTATAAAGCCAGTACGCAGGTGAAACACAAATTACGCACGCTGATTTATCAAAAACTGTCTTCCATGCCGCTTAATCAAGTAaatc < 1:14614/250‑1 (MQ=255) aTTAATTGGCGGAATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGCCGTTTGTTTGCAATGGGCGTTTGAGCGTTCGCTTACCCTCCAAAGTGCGGTTATTTTTACCGTCGTTTTAATTGCCTGTTTGGCACTACGTGCCTGGGCGGGCAAAATGGCAGTGAAAGCGTCCTATAAAGCCAGTACGCAGGTGAAACACAAATTACGCACGCTGATTTATCAAAAACTGTCTTCCATGCCGCTTAATCAAGTAaatcaacaat < 1:565008/251‑1 (MQ=255) | GAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTA‑TTTTTTATTTAACCGTTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGCTGATAAATACGGTCGCCAACAGCAAAAAATGGATTGCGATTAATGTATTGTGGAACTGGGTTGCATTAATTGGCGGCATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGCCGTTTGTTTGCAATGGGCGTTTGAGCGTTCGCTTACCCTCCAAAGTGCGGTTATTTTTACCGTCGTTTTAATTGCCTGTTTGGCACTACGTGCCTGGGCGGGCAAAATGGCAGTGAAAGCGTCCTATAAAGCCAGTACGCAGGTGAAACACAAATTACGCACGCTGATTTATCAAAAACTGTCTTCCATGCCGCTTAATCAAGTAAATCAACAAT > 2/132236‑132719 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |