| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 2 | 132,279 | T→C | intergenic (+61/‑107) | unknown → / → unknown | Anaerobic C4‑dicarboxylate transporter/Heterodimeric efflux ABC transporter, permease/ATP‑binding subunit 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 2 | 132,279 | 0 | T | C | 100.0% | 162.8 / NA | 59 | intergenic (+61/‑107) | unknown/unknown | Anaerobic C4‑dicarboxylate transporter/Heterodimeric efflux ABC transporter, permease/ATP‑binding subunit 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (28/31); total (28/31) | |||||||||||
GGTAAACGGTTATTTCTTCATTCCGAACTACGGTCCGATCATTGCCTCTATCGACTTTGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTA‑TTTTTTATTTAACCGTTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGCTGATAAATACGGTCGCCAACAGCAAAAAATGGATTGCGATTAATGTATTGTGGAACTGGGTTGCATTAATTGGCGGCATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGCCGTTTGTTTGCAA > 2/132038‑132517 | ggTAAACGGTTATTTCTTCATTCCGAACTACGGTCCGATCATTGCCTCTATCGACTTTGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACg > 1:578459/1‑251 (MQ=255) cGGTTATTTCTTCATTCCGAACTACGGTCCGATCATTGCCTCTATCGACTTTGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATa > 1:48468/1‑250 (MQ=255) cGGTTATTTCTTCATTCCGAACTACGGTCCGATCATTGCCTCTATCGACTTTGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATa > 1:648578/1‑250 (MQ=255) tcttcATTCCGAACTACGGTCCGATCATTGCCTCTATCGACTTTGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTAtttt > 1:434543/1‑251 (MQ=255) tcttcATTCCGAACTACGGTCCGATCATTGCCTCTATCGACTTTGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTAtttt > 1:540130/1‑251 (MQ=255) aCTACGGTCCGATCATTGCCTCTATCGACTTTGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACattattctgcttcttataaa > 1:284666/1‑237 (MQ=255) gATCATTGCCTCTATCGACTTTGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCAt > 1:199386/1‑251 (MQ=255) aTCATTGCCTCTATCGACTTTGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAacac > 1:901392/1‑213 (MQ=255) aTCATTGCCTCTATCGACTTTGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCAtt > 1:802258/1‑251 (MQ=255) ctATCGACTTTGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAg < 1:238157/237‑1 (MQ=255) ttGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGa < 1:412522/251‑1 (MQ=255) tGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGat < 1:611412/251‑1 (MQ=255) tGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGat < 1:813646/251‑1 (MQ=255) tGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGat < 1:886560/251‑1 (MQ=255) tGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGat > 1:371200/1‑251 (MQ=255) cTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGc < 1:338316/251‑1 (MQ=255) cTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGc < 1:459721/251‑1 (MQ=255) aCGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCAc < 1:503305/251‑1 (MQ=255) cGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCa > 1:236269/1‑249 (MQ=255) gggCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACtt > 1:602848/1‑251 (MQ=255) gCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACttt > 1:195269/1‑250 (MQ=255) caccacACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGat > 1:96432/1‑239 (MQ=255) caccacACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCa < 1:658191/251‑1 (MQ=255) aTACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGAc < 1:261713/251‑1 (MQ=255) aTACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGAc < 1:143191/251‑1 (MQ=255) cAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCAc > 1:799621/1‑219 (MQ=255) aaTCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACAt < 1:43708/251‑1 (MQ=255) aaTCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACAt < 1:515958/251‑1 (MQ=255) cTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTatga < 1:344143/248‑1 (MQ=255) ttCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCAc < 1:668310/209‑1 (MQ=255) ggCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCAc > 1:578467/1‑197 (MQ=255) ggCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAgg < 1:186408/218‑1 (MQ=255) aTTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACg < 1:226229/146‑1 (MQ=255) aTTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGat < 1:288418/185‑1 (MQ=255) gAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGAc < 1:76665/212‑1 (MQ=255) gAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTatga > 1:321125/1‑227 (MQ=255) gTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAAt > 1:162419/1‑127 (MQ=255) gCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAgg > 1:657172/1‑203 (MQ=255) gCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGCTGATAAATACGGTCg > 1:817716/1‑250 (MQ=255) aGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGCTGATAAATACGGTCGCCAACAg > 1:273980/1‑251 (MQ=255) gCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACatta < 1:108402/116‑1 (MQ=255) gCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTAttt < 1:809410/119‑1 (MQ=255) gCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGa < 1:864746/162‑1 (MQ=255) gCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAgg > 1:301608/1‑181 (MQ=255) gCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGCTGATAAATACGGTCGCCAACAGCaaaaa > 1:88736/1‑251 (MQ=255) cTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGCTGATAAATACGGTCGCCAACAGCAAAAAAt > 1:239743/1‑251 (MQ=255) ggCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTAc < 1:666210/117‑1 (MQ=255) ggCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACg < 1:855874/118‑1 (MQ=255) ggCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTg > 1:541510/1‑172 (MQ=255) tatTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAAc > 1:672550/1‑178 (MQ=255) tCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGCTGATAAATACGGTCGCCAACAGCAAAAAATGGATTGCGATTAATGTATTGTGGAAc < 1:195722/251‑1 (MQ=255) gggAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGCTGATAAATACGGTCGCCAACAGCAAAAAATGGATTGCGATTAATGTATTGTGGAACTGGGTTGCATTAATTggcggaat > 1:482340/1‑248 (MQ=255) gAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGc < 1:695042/170‑1 (MQ=255) gAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGCTGATAAATACGGTCGCCAACAGCAAAAAATGGATTGCGATTAATGTATTGTGGAACTGGGt < 1:464934/231‑1 (MQ=255) gAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGCTGATAAATACGGTCGCCAACAGCAAAAAATGGATTGCGATTAATGTATTGTGGAACTGGGTTGCATTAATTGGCGGAatta > 1:451298/1‑251 (MQ=255) aaataatAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGc < 1:481519/114‑1 (MQ=255) tATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAgg < 1:597742/124‑1 (MQ=255) gcgcTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGCTGATAAATACGGTCGCCAACAGCAAAAAATGGATTGCGATTAATGTATTGTGGAACTGGGTTGCATTAATTGGCGGAATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGc < 1:898619/248‑1 (MQ=255) tttatttaACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGCTGATAAATACGGTCGCCAACAGCAAAAAATGGATTGCGATTAATGTATTGTGGAACTGGGTTGCATTAATTGGCGGAATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGCCGTTTGTTTGCaa < 1:462610/251‑1 (MQ=255) | GGTAAACGGTTATTTCTTCATTCCGAACTACGGTCCGATCATTGCCTCTATCGACTTTGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTA‑TTTTTTATTTAACCGTTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGCTGATAAATACGGTCGCCAACAGCAAAAAATGGATTGCGATTAATGTATTGTGGAACTGGGTTGCATTAATTGGCGGCATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGCCGTTTGTTTGCAA > 2/132038‑132517 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |