| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 2 | 127,283 | C→T | intergenic (+215/+426) | unknown → / ← unknown | Fructose‑1,6‑bisphosphatase, GlpX type (EC 3.1.3.11)/Serine acetyltransferase (EC 2.3.1.30) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 2 | 127,283 | 0 | C | T | 100.0% | 172.4 / NA | 64 | intergenic (+215/+426) | unknown/unknown | Fructose‑1,6‑bisphosphatase, GlpX type (EC 3.1.3.11)/Serine acetyltransferase (EC 2.3.1.30) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (37/27); total (37/27) | |||||||||||
CTTTATCGTTTAATTAATGCTTAATTATAAAAATAAAGCCGGCAATTAAACCGGCTTTTATTTATTTTACTTTGAGTGAATATCGTTTTTTAAATAATTTCGGCGAATAACTCATATTTCCATAGATTCCCCATTGAAGGTCTATATAAATGTCACCCTGAAGTTGCGGTTTTCCTTCAATTATCACAAGGTTTTGCGTTAAATTAGCCTGTTCATTGAACAGGTATATTCCTGTTACCCCTGAATTTTCCGGTGAAATCGCTATTTTTACCGAAGTTTCAATAGCCTTTCCGTTGGCTAATTTATCAATATCGATGACATAGCGGTATTCACTATTCGTTTGTATTTCGCCAAGATATTCATCTTCTAATTTATCCGTATTATTTCTGCAGGAAAAACAAAAAATAAACTGATAAAAAGGGCAAATAGAAATTTTCTATTTGAAAATAGAGATTGATTTTGCATTATAAGTC > 2/127045‑127517 | cTTTATCGTTTAATTAATGCTTAATTATAAAAATAAAGCCGGCAATTAAACCGGCTTTTATTTATTTTACTTTGAGTGAATATCGTTTTTTAAATAATTTCGGCGAATAACTCATATTTCCATAGATTCCCCATTGAAGGTCTATATAAATGTCACCCTGAAGTTGCGGTTTTCCTTCAATTATCACAAGGTTTTGCGTTAAATTAGCCTGTTCATTGAACAGGTATATTCCTGTTACTCCTGAATTTTc > 1:380474/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |