| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 2 | 120,270 | C→G | E37Q (GAA→CAA) | unknown ← | ATP synthase protein I |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 2 | 120,270 | 0 | C | G | 100.0% | 228.5 / NA | 79 | E37Q (GAA→CAA) | unknown | ATP synthase protein I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (35/44); total (35/44) | |||||||||||
ATATTATTTAGCATTAATGCTGTAAAAAAACCTGTAAAGAAAACAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTCGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATGAGATTCAACTCAAAAGCACTCAAAAAGTGGTAAATGAACTACAATAAAAGATAGTTAACAGAAATTTTACTTTTTAGTCAAAAGTATTAA > 2/120029‑120513 | atatTATTTAGCATTAATGCTGTAAAAAAACCTGTAAAGAAAACAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTgg > 1:606953/1‑250 (MQ=255) tattatTTAGCATTAATGCTGTAAAAAAACCTGTAAAGAAAACAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAGACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTgg > 1:436573/1‑249 (MQ=255) attTAGCATTAATGCTGTAAAAAAACCTGTAAAGAAAACAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTaaca > 1:99141/1‑251 (MQ=255) tttAGCATTAATGCTGTAAAAAAACCTGTAAAGAAAACAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTaacaa < 1:753312/251‑1 (MQ=255) gCATTAATGCTGTAAAAAAACCTGTAAAGAAAACAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCa > 1:591705/1‑251 (MQ=255) gCATTAATGCTGTAAAAAAACCTGTAAAGAAAACAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCa > 1:119908/1‑251 (MQ=255) gTAAAAAAACCTGTAAAGAAAACAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCaataat > 1:659961/1‑245 (MQ=255) ccTGTAAAGAAAACAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAGTCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGGACGCGGAAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATag < 1:818782/238‑1 (MQ=255) ccTGTAAAGAAAACAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGc > 1:745455/1‑221 (MQ=255) ccTGTAAAGAAAACAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGc > 1:257086/1‑221 (MQ=255) ccTGTAAAGAAAACAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTaacaa > 1:372317/1‑227 (MQ=255) ccTGTAAAGAAAACAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTaacaa > 1:495123/1‑227 (MQ=255) ccTGTAAAGAAAACAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCaat > 1:379004/1‑233 (MQ=255) ccTGTAAAGAAAACAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAg > 1:135074/1‑251 (MQ=255) ccTGTAAAGAAAACAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAg > 1:159715/1‑251 (MQ=255) tGTAAAGAAAACAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGAc < 1:67020/251‑1 (MQ=255) tGTAAAGAAAACAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGAc < 1:155844/251‑1 (MQ=255) aaaGAAAACAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATag < 1:486143/233‑1 (MQ=255) aCAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCaataat < 1:370528/224‑1 (MQ=255) cAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATagag < 1:92138/227‑1 (MQ=255) cAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAAt > 1:838082/1‑251 (MQ=255) tAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGc < 1:525969/205‑1 (MQ=255) aCCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATagag > 1:715805/1‑213 (MQ=255) ccATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTtat < 1:44413/251‑1 (MQ=255) ccATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTta < 1:892167/250‑1 (MQ=255) tttGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATAtt < 1:586294/251‑1 (MQ=255) aatCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGc < 1:379039/177‑1 (MQ=255) cAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTa > 1:186568/1‑251 (MQ=255) gTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCaataat > 1:6540/1‑178 (MQ=255) gTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTaaa > 1:432023/1‑251 (MQ=255) gTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTaaa > 1:44676/1‑251 (MQ=255) aaTCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAAc > 1:783975/1‑186 (MQ=255) aaTCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAAc < 1:173936/249‑1 (MQ=255) cGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATACTAGAGCTCAAAACAAGAc > 1:455482/1‑188 (MQ=255) tCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGAc < 1:131625/251‑1 (MQ=255) tCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGAc < 1:892533/251‑1 (MQ=255) aTACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTaac < 1:789912/155‑1 (MQ=255) aTACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATa > 1:839908/1‑251 (MQ=255) aaTGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAAc < 1:425900/251‑1 (MQ=255) aaTGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAAc < 1:352065/251‑1 (MQ=255) cTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTaa > 1:179143/1‑251 (MQ=255) caccacGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTaaaa > 1:591890/1‑250 (MQ=255) caccacGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAAc < 1:842867/251‑1 (MQ=255) ccacGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACgg > 1:388459/1‑251 (MQ=255) cGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCCAAAAc < 1:201742/218‑1 (MQ=255) aTAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCaa > 1:301463/1‑251 (MQ=255) aTAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCaa > 1:662533/1‑251 (MQ=255) aaGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATta < 1:556953/251‑1 (MQ=255) cGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATAccc < 1:628217/251‑1 (MQ=255) gTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCtt > 1:467163/1‑251 (MQ=255) gATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATta < 1:520700/232‑1 (MQ=255) gATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATAccc < 1:114510/237‑1 (MQ=255) gATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATgaga > 1:652873/1‑251 (MQ=255) aTAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAAc < 1:14989/213‑1 (MQ=255) tCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTa > 1:414000/1‑93 (MQ=255) tGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATGAGATTCAACTCAAAAg < 1:887137/251‑1 (MQ=255) tGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATGAGATTCAACTCAAAAg < 1:762402/251‑1 (MQ=255) gATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATag < 1:317806/105‑1 (MQ=255) aTAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATAccc < 1:525887/220‑1 (MQ=255) aaaaaaCAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATGAGATTCAACTCAAAAGCACTCa > 1:194646/1‑251 (MQ=255) acaacaTACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGc < 1:290474/164‑1 (MQ=255) caAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATGAGATTCAACTCAAAAGCACTCAAAAAGTGGTAAATGa < 1:831672/251‑1 (MQ=255) gATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATGAGATTCAACTCAAAAg < 1:760227/226‑1 (MQ=255) aTAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATGAGATTCAACTCAAAAGCACTCAAAAAGTGGTAAATGAACTAc < 1:693014/251‑1 (MQ=255) aaaaaaGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATGAGATTCAACTCAAAAGCACTCaaa > 1:326059/1‑230 (MQ=255) gTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCt < 1:715909/140‑1 (MQ=255) gTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATGAGATTCAACTCAAAAGCACTCAAAAAGTGGTAAATGAACTACAATAAAAg < 1:374124/249‑1 (MQ=255) tATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATGAGATTCAACTCAAAAGCACTCAAAAAGTGGTAAATGAACTACAATAAAAGAt < 1:872815/250‑1 (MQ=255) aTGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATGAGATTCAACTCAAAAGCACTCAAAAAGTGGTAAATGAACTACAATAAAAGATAg < 1:812540/251‑1 (MQ=255) gCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATGAGATTCAACTCAAAAGCACTCAAAAAGTGGTAAATGAACTACAATAAAAGATAGTTAACAGa < 1:841294/250‑1 (MQ=255) aaaaaaTCATAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATGAGATTCAACTCAAAAg > 1:667282/1‑202 (MQ=255) aaTCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATGAGATTCAACTCAAAAGCACTCAAAAAGTGGTAAATGAACTACAATAAAAGATAGTTAACAGAAATTTTa < 1:678357/251‑1 (MQ=255) aTCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATGAGATTCAACTCAAAAGCACTCAAAAAg < 1:293389/208‑1 (MQ=255) gCAGAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATGAGATTCAACTCAAAAGCACTCAAAAAGTGGTAAATg < 1:660108/210‑1 (MQ=255) gAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATAccc < 1:657405/160‑1 (MQ=255) gAAATCAACCGCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATGAGATTCAACTCAAAAGCACTCAAAAAGTGGTAAATGAACTACAATAAAAg > 1:100441/1‑221 (MQ=255) gCACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATGAGATTCAACTCAAAAGCACTCAAAAAGTGGTAAATGAACTACAATAAAAGATAGTTAACAGAAATTTTACTTTTTAGTCAAAAGTATTaa > 1:722681/1‑251 (MQ=255) cACTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATGAGATTCAAc < 1:379148/169‑1 (MQ=255) cTTTGGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATta < 1:461744/142‑1 (MQ=255) | ATATTATTTAGCATTAATGCTGTAAAAAAACCTGTAAAGAAAACAATAAAATATGTTACCGAAAGCCATTTGAACGAAAAAATAATCAGTAGAATCGTCAATACGAATTTAATGGCTTCACCACGATAAAGTGCGGTTAATTTTTTTGATAAATCCTGATTGCGATAAAAAACAACATACACAAAGATAAAAAAAGGTATGAACGCGGCAAAAAATCCTAAGCAGAAATCAACCGCACTTTCGGTATTGGCTAACAACGCAATAATAGAGCTCAAAACAAGACCGACGAAAAATTCAATGTAAATGGATTTTTTATATTTGGCTCGGGCTTGTGCTAAAACTCTGGACATAACTTTTAAACCTTAAAACGGAGCAATTATACCCTTGAAAAAATGAGATTCAACTCAAAAGCACTCAAAAAGTGGTAAATGAACTACAATAAAAGATAGTTAACAGAAATTTTACTTTTTAGTCAAAAGTATTAA > 2/120029‑120513 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |