| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 2 | 119,604 | C→T | A125T (GCC→ACC) | unknown ← | ATP synthase F0 sector subunit a (EC 3.6.3.14) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 2 | 119,604 | 0 | C | T | 100.0% | 227.1 / NA | 83 | A125T (GCC→ACC) | unknown | ATP synthase F0 sector subunit a (EC 3.6.3.14) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (45/38); total (45/38) | |||||||||||
AGATTAATTCGCCCGCATACATGTTACCGAACAAACGGAAGCCGAGAGAAATCGGTTTAGCCAGTAAAGTAACAGTTTCGAGAATAAAGTTAACAGGGATAAATGCCCAGTAATTAAACGGATGTAAGGTATATTCCTTAACTAAACCGCTAACCCCTTTGGATTTAACCGTATAGAAAAGAATCAGGAAGAAGACGCAAATCGACATCCCCAAAGTAGCGCTAATATCTGCCGTAGGGACGGCTCTTAAATAGTGAATACCGAATAATCCGGCAAGTTGCGGAAGGAAATCAACAGGGATTAAGTCGATGGCATTCATAATGAATACCCAACAGAAAATGGTCAGGGCAATCGGTGCCACCACCTCGCGCGGACCATGGAAATTTTCTTTAACGATGCCGTTAACCCAACCTACCAGGATTTCCACCAGACATTGTAATTTTCCCGGTACACCCGGCGTTGCCTTTTTAGCAAC > 2/119361‑119835 | aGATTAATTCGCCCGCATACATGTTACCGAACAAACGGAAGCCGAGAGAAATCGGTTTAGCCAGTAAAGTAACAGCTTCGAGAATAAAGTTAACAGGGATAAATGCCCAGTAATTAAACGGATGTAAGGTATATTCCTTAACTAAACCGCTAACCCCTTTGGATTTAACCGTATAGAAAAGAATCAGGAAGAAGACGCAAATCGACATCCCCAAAGTAGCGCTAATATCTGCCGTAGGGACGGTTCTTaaa > 1:514861/1‑251 (MQ=255) 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(MQ=255) tAACCGTATAGAAAAGAATCAGGAAGAAGACGCAAATCGACATCCCCAAAGTAGCGCTAATATCTGCCGTAGGGACGGTTCTTAAATAGTGAATACCGAATAATCCGGCAAGTTGCGGAAGGAAATCAACAGGGATTAAGTCGATGGCATTCATAATGAATACCCAACAGAAAATGGTCAGGGCAATCGGTGCCACCACCTCGCGCGGACCATGGAAATTTTCTTTAACGATGCCGTTAACCCAAcc > 1:795513/1‑247 (MQ=255) gTATAGAAAAGAATCAGGAAGAAGACGCAAATCGACATCCCCAAAGTAGCGCTAATATCTGCCGTAGGGACGGTTCTTAAATAGTGAATACCGAATAATCCGGCAAGTTGCGGAAGGAAATCAACAGGGATTAAGTCGATGGCATTCATAATGAATAccc > 1:581644/1‑160 (MQ=255) gTATAGAAAAGAATCAGGAAGAAGACGCAAATCGACATCCCCAAAGTAGCGCTAATATCTGCCGTAGGGACGGTTCTTAAATAGTGAATACCGAATAATCCGGCAAGTTGCGGAAGGAAATCAACAGGGATTAAGTCGATGGCATTCATAATGAATACCCAACAGAAAATGGTCAGGGCAATCGGTGCCACCACCTCGCGCGGACCATGGAAATTTTCTTTAACGATGCCGTTAACCCAACCTACCAg > 1:517179/1‑248 (MQ=255) gTATAGAAAAGAATCAGGAAGAAGACGCAAATCGACATCCCCAAAGTAGCGCTAATATCTGCCGTAGGGACGGTTCTTAAATAGTGAATACCGAATAATCCGGCAAGTTGCGGAAGGAAATCAACAGGGATTAAGTCGATGGCATTCATAATGAATACCCAACAGAAAATGGTCAGGGCAATCGGTGCCACCACCTCGCGCGGACCATGGAAATTTTCTTTAACGATGCCGTTAACCCAACCTACCAGGAt > 1:37221/1‑251 (MQ=255) gTATAGAAAAGAATCAGGAAGAAGACGCAAATCGACATCCCCAAAGTAGCGCTAATATCTGCCGTAGGGACGGTTCTTAAATAGTGAAAACCGAATAATCCGGCAAGTTGCGGAAGGAAATCAACAGGGATTAAGTCGATGGCATTCATAATGAATACCCAACAGAAAATGGTCAGGGCAATCGGTGCCACCACCTCGCGCGGACCATGGAAATTTGCTTTAACGATGCCGTTAACCCAACCTACCAGGAt > 1:304112/1‑251 (MQ=255) tataGAAAAGAATCAGGAAGAAGACGCAAATCGACATCCCCAAAGTAGCGCTAATATCTGCCGTAGGGACGGTTCTTAAATAGTGAATACCGAATAATCCGGCAAGTTGCGGAAGGAAATCAACAGGGATTAAGTCGATGGCATTCATAATGAATACCCAACAGAAAATGGTCAGGGCAATCGGTGCCACCACCTCGCGCGGACCATGGAAATTTTCTTTAACGATGCCGTTAACCCAACCTACCAGGAtt < 1:587641/251‑1 (MQ=255) aaaaGAATCAGGAAGAAGACGCAAATCGACATCCCCAAAGTAGCGCTAATATCTGCCGTAGGGACGGTTCTTAAATAGTGAATACCGAATAATCCGGCAAGTTGCGGAAGGAAATCAACAGGGATTAAGTCGATGGCATTCATAATGAATACCCAACAGAAAATGGTCAGGGCAATCGGTGCCACCACCTCGCGCGGACCATGGAAATTTTCTTTAACGATGCCGTTAACCCAACCTACCAGGATTTccac < 1:17989/251‑1 (MQ=255) 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tatCTGCCGTAGGGACGGTTCTTAAATAGTGAATACCGAATAATCCGGCAAGTTGCGGAAGGAAATCAACAGGGATTAAGTCGATGGCATTCATAATGAATACCCAACAGAAAATGGTCAGGGCAATCGGTGCCACCACCTCGCGCGGACCATGGAAATTTTCTTTAACGATGCCGTTAACCCAACCTACCAGGATTTCCACCAGACATTGTAATTTTCCCGGTACACCCGGCGTTGCCTTTTTAGCAAc > 1:806990/1‑250 (MQ=255) | AGATTAATTCGCCCGCATACATGTTACCGAACAAACGGAAGCCGAGAGAAATCGGTTTAGCCAGTAAAGTAACAGTTTCGAGAATAAAGTTAACAGGGATAAATGCCCAGTAATTAAACGGATGTAAGGTATATTCCTTAACTAAACCGCTAACCCCTTTGGATTTAACCGTATAGAAAAGAATCAGGAAGAAGACGCAAATCGACATCCCCAAAGTAGCGCTAATATCTGCCGTAGGGACGGCTCTTAAATAGTGAATACCGAATAATCCGGCAAGTTGCGGAAGGAAATCAACAGGGATTAAGTCGATGGCATTCATAATGAATACCCAACAGAAAATGGTCAGGGCAATCGGTGCCACCACCTCGCGCGGACCATGGAAATTTTCTTTAACGATGCCGTTAACCCAACCTACCAGGATTTCCACCAGACATTGTAATTTTCCCGGTACACCCGGCGTTGCCTTTTTAGCAAC > 2/119361‑119835 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |