| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 343,716 | G→A | intergenic (+11/‑6) | unknown → / → unknown | Tol biopolymer transport system, TolR protein/TolA protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 343,716 | 0 | G | A | 100.0% | 156.0 / NA | 58 | intergenic (+11/‑6) | unknown/unknown | Tol biopolymer transport system, TolR protein/TolA protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (32/26); total (32/26) | |||||||||||
TTTTAGAAGTGTCGGGAATCGGTCAGTACGCCATTTCAATCGGCGGCACCCGTACGGAAAATCTTACCGAAGAGATGGTTACCCAACTATCAAAACAAGAATTTGATAAAGATAACAATACAATGTTCTTAGTCGGCGGTGCCAAAGAAGTACCTTATGAAGAGGTCATTAAAGCACTCAATTTGCTTCATCTTGCCGGCATCAAATCCGTTGGTTTAATGACAAACCCAATTTAATTAAATAGGTGACATTGTGCAGAATAAGCGACAAAAAGGTGATGTTGATGCAGTTGTGATTTCCATCATAATGCACTTAGCGTTGTTCGGATTGTTAATTTTAAGCTCGCTCTACCATAATATTGACATTATGGGCGGCGGTGAAGGCGATAACGGTGAAGTTATCGGCGCCGTGATGGTTGATACGGGCTCGGCAGCGCAGGAATGGGGGCGAATTCAACAACAGAAAAAAGGTCAGGCGGACAGACAAAAGAAAC > 1/343470‑343962 | ttttAGAAGTGTCGGGAATCGGTCAGTACGCCATTTCAATCGGCGGCACCCGTACGGAAAATCTTACCGAAGAGATGGTTACCCAACTATCAAAACAAGAATTTGATAAAGATAACAATACAATGTTCTTAGTCGGCGGTGCCAAAGAAGTGCCTTATGAAGAGGTCATTAAAGCACTCGATTTGCTTCATCTTGCCGGCATCAAATCCGTTGGTTTAATGACAAACCCAATTTAATTAAATAGGTAACAt < 1:39588/251‑1 (MQ=255)ttttAGAAGTGTCGGGAATCGGTCAGTACGCCATTTCAATCGGCGGCACCCGTACGGAAAATCTTACCGAAGAGATGGTTACCCAACTATCAAAACAAGAATTTGATAAAGATAACAATACAATGTTCTTAGTCGGCGGTGCCAAAGAAGTACCTTATGAAGAGGTCATTAAAGCACTCAATTTGCTTCATCTTGCCGGCATCAAATCCGTTGGTTTAATGACAAACCCAATTTAATTAAATAGGTAACAt < 1:600833/251‑1 (MQ=255)ttttAGAAGTGTCGGGAATCGGTCAGTACGCCATTTCAATCGGCGGCACCCGTACGGAAAATCTTACCGAAGAGATGGTTACCCAACTATCAAAACAAGAATTTGATAAAGATAACAATACAATGTTCTTAGTCGGCGGTGCCAAAGAAGTACCTTATGAAGAGGTCATTAAAGCACTCAATTTGCTTCATCTTGCCGGCATCAAATCCGTTGGTTTAATGACAAACCCAATTTAATTAAATAGGTAACAt > 1:355341/1‑251 (MQ=255) aTCGGTCAGTACGCCATTTCAATCGGCGGCACCCGTACGGAAAATCTTACCGAAGAGATGGTTACCCAACTATCAAAACAAGAATTTGATAAAGATAACAATACAATGTTCTTAGTCGGCGGTGCCAAAGAAGTACCTTATGAAGAGGTCATTAAAGCACTCAATTTGCTTCATCTTGCCGGCATCAAATCCGTTGGTTTAATGACAAACCCAATTTAATTAAATAGGTAACATTGTGCAGAATAAGCGAc < 1:333448/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |