| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 2 | 116,618 | C→T | A390T (GCC→ACC) | unknown ← | ATP synthase alpha chain (EC 3.6.3.14) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 2 | 116,618 | 0 | C | T | 100.0% | 258.0 / NA | 95 | A390T (GCC→ACC) | unknown | ATP synthase alpha chain (EC 3.6.3.14) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (46/49); total (46/49) | |||||||||||
CTCAAAACTTGCTATTTTTGATAACTCCACATCTTCCAAATAACCGAACTCAACAGCAAATAACACAACAGCCTGTTCCGCAACCGAAAGCGGCGCAAATTGTTTTTGTTTTAGCAATTCAGTTACTTTTTCACCGTGAGAAAGTTGTTTACGGGTTGCATCATCAAGATCGGATGCAAACTGTGCAAACGCCGCTAATTCACGATATTGGGCAAGTGCGGTACGAATACCACCGGCTAATTTTTTGATGACTTTAGTTTGTGCCGAACCACCTACACGGGAAACGGAAATACCCGGGTTTACCGCAGGACGAATGCCGGAGTTAAATAGGTTGGATTCCAAGAAAATCTGACCGTCAGTAATCGAAATTACGTTGGTTGGAACGAAGGCGGAAACGTCACCCGCTTGTGTTTCGATAATCGGAAGTGCGGTTAAAGAACCGGTTTTACCTTTAACTTCACCGTTAGTGAATTTTTCTACAT > 2/116382‑116863 | ctcAAAACTTGCTATTTTTGATAACTCCACATCTTCCAAATAACCGAACTCAACAGCAAATAACACAACAGCCTGTTCCGCAACCGAAAGCGGCGCAAATTGTTTTTGTTTTAGCAATTCAGTTACTTTTTCACCGTGAGAAAGTTGTTTACGGGTTGCATCATCAAGATCGGATGCAAACTGTGCAAACGCCGCTAATTCACGATATTGGGCAAGTGCGGTACGAATACCACCGGTTAATTTTTtgatga > 1:827546/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |