| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 2 | 113,470 | T→C | intergenic (+32/+29) | unknown → / ← unknown | Spermidine/putrescine import ABC transporter substrate‑binding protein PotD (TC 3.A.1.11.1)/ATP synthase epsilon chain (EC 3.6.3.14) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 2 | 113,470 | 0 | T | C | 100.0% | 171.1 / NA | 62 | intergenic (+32/+29) | unknown/unknown | Spermidine/putrescine import ABC transporter substrate‑binding protein PotD (TC 3.A.1.11.1)/ATP synthase epsilon chain (EC 3.6.3.14) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (31/31); total (31/31) | |||||||||||
CGTCCGGAAAACGCCAAAGTGGTTTTGGAACGCTTGGGCTATTCCATGCCAAACAACGGCGTAAAAGCCTTAATCTCACCGGAAATGGCAAACAACCCGACCTTATTCCCGCCGGAGGAACAAGTGAAAAAAGGCATTATTCAAGGTGACGTAGGTAACGCCATTGATATTTATGAAAAATATTGGAATAAGTTGAAAACTAATTAATTAGGGATAATAAAAAAGTGCGGTGGTTTTTTACCGCACTTTTCATGATTACCGATAAAATCAGCGCTTAGATTTGACTAATTGTTCTGTCAGTTCATAAGCACGAAGTTTTGCCAATTCTTTAGAAAGTTTGGACATTAATACTTCGTAATCTGCATCGTGGTGATGCTGACGAATGTTTTCTTCAGCACGTTTCTTCGCAGCAAGAATGCGTTCGCTGTCAAGTTCTTGGCCTCGAATAGCGATATCCGCAAGGACAATAACCGCTGTCGGTTGT > 2/113232‑113715 | cGTCCGGAAAACGCCAAAGTGGTTTTGGAACGCTTGGGCTATTCCATGCCAAACAACGGCGTAAAAGCCTTAATCTCACCGGAAATGGCAAACAACCCGACCTTATTCCCGCCGGAGGAACAAGTGAAAAAAGGCATTATTCAAGGTGACGTAGGTAACGCCATTGATATTTATGAAAAATATTGGAATAAGTTGAAAACTAATTAATTAGGGATAATAAAAAAGTGCGGTGGTTTTTCACCGCACTTTTc < 1:609010/251‑1 (MQ=255) 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ataaAAAAGTGCGGTGGTTTTTCACCGCACTTTTCATGATTACCGATAAAATCAGCGCTTAGATTTGACTAATTGTTCTGTCAGTTCATAAGCACGAAGTTTTGCCAATTCTTTAGAAAGTTTGGACATTAATACTTCGTAATCTGCATCGTGGTGATGCTGACGAATGTTTTCTTCAGCACGTTTCTTCGCAGCAAGAATGCGTTCGCTGTCAAGTTCTTGGCCTCGAATAGCGATATCCGCAAGGACaa > 1:290684/1‑251 (MQ=255) ataaAAAAGTGCGGTGGTTTTTCACCGCACTTTTCATGATTACCGATAAAATCAGCGCTTAGATTTGACTAATTGTTCTGTCAGTTCATAAGCACGAAGTTTTGCCAATTCTTTAGAAAGTTTGGACATTAATACTTCGTAATCTGCATCGTGGTGATGCTGACGAATGTTTTCTTCAGCACGTTTCTTCGCAGCAAGAATGCGTTCGCTGTCAAGTTCTTGGCCTCGAATAGCGATATCCGCAAGGACaa > 1:595087/1‑251 (MQ=255) ataaAAAAGTGCGGTGGTTTTTCACCGCACTTTTCATGATTACCGATAAAATCAGCGCTTAGATTTGACTAATTGTTCTGTCAGTTCATAAGCACGAAGTTTTGCCAATTCTTTAGAAAGTTTGGACATTAATACTTCGTAATCTGCATCGTGGTGATGCTGACGAATGTTTTCTTCAGCACGTTTCTTCGCAGCAAGAATGCGTTCGCTGTCAAGTTCTTGGCCTCGAATAGCGATATCCGCAAGGACaa > 1:428638/1‑251 (MQ=255) 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tttttcACCGCACTTTTCATGATTACCGATAAAATCAGCGCTTAGATTTGACTAATTGTTCTGTCAGTTCATAAGCACGAAGTTTTGCCAATTCTTTAGAAAGTTTGGACATTAATACTTCGTAATCTGCATCGTGGTGATGCTGACGAATGTTTTCTTCAGCACGTTTCTTCGCAGCAAGAATGCGTTCGCTGTCAAGTTCTTGGCCTCGAATAGCGATATCCGCAAGGACAATAACCGCTGTCGGTTGt < 1:122891/251‑1 (MQ=255) | CGTCCGGAAAACGCCAAAGTGGTTTTGGAACGCTTGGGCTATTCCATGCCAAACAACGGCGTAAAAGCCTTAATCTCACCGGAAATGGCAAACAACCCGACCTTATTCCCGCCGGAGGAACAAGTGAAAAAAGGCATTATTCAAGGTGACGTAGGTAACGCCATTGATATTTATGAAAAATATTGGAATAAGTTGAAAACTAATTAATTAGGGATAATAAAAAAGTGCGGTGGTTTTTTACCGCACTTTTCATGATTACCGATAAAATCAGCGCTTAGATTTGACTAATTGTTCTGTCAGTTCATAAGCACGAAGTTTTGCCAATTCTTTAGAAAGTTTGGACATTAATACTTCGTAATCTGCATCGTGGTGATGCTGACGAATGTTTTCTTCAGCACGTTTCTTCGCAGCAAGAATGCGTTCGCTGTCAAGTTCTTGGCCTCGAATAGCGATATCCGCAAGGACAATAACCGCTGTCGGTTGT > 2/113232‑113715 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |