| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 338,450 | A→G | intergenic (‑53/‑399) | unknown ← / → unknown | Chromosome segregation ATPases/Cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I (EC 1.10.3.‑) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 338,450 | 0 | A | G | 100.0% | 182.2 / NA | 67 | intergenic (‑53/‑399) | unknown/unknown | Chromosome segregation ATPases/Cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I (EC 1.10.3.‑) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (31/36); total (31/36) | |||||||||||
GGGTATGTGTACCGGGCTGTCTTTCCGCTTCGGCAATTAAATTTTCGGCTTCACTAAATAAATCTTTGCACTGCTTTGGCATTTCTACTGCTTTTTTATCGTTTTGAGCAGCATTTGCAACGTTGTTGACAGTGATTGCCATGCAAAGTGCGGTTAGAATTCCGGTTATTTTGTTTGTCATCTGAGAGACCTACGTTTGTTAAGTTGGAAGAAATCAATAAAACTGGGCGAGAAGTTATCAGAATTTATGTGTGATGTCTAGTTTTTAATCTCAACTGTTAGAACTGAATCATACCGGGTCAAGGGCGCTATGCTTTGTGTTGCAAAGATGTTATTGAAATTTATAATTTGATCTTGAGCAAAATAGTAAAAAACACCTATGTTTGATTATTTTTGATTTATATCTAAAAATGTGATCAGCTTGGCATAATTTACTATTTTTTATCCTTACGTTTAATAGTAGAATATGCCACCT > 1/338217‑338691 | gggTATGTGTACCGGGCTGTCTTTCCGCTTCGGCAATTAAATTTTCGGCTTCACTAAATAAATCTTTGCACTGCTTTGGCATTTCTACTGCTTTTTTATCGTTTTGAGCAGCATTTGCAACGTTGTTGACAGTGATTGCCATGCAAAGTGCGGTTAGAATTCCGGTTATTTTGTTTGTCATCTGAGAGACCTACGTTTGTTAAGTTGGAAGAAATCAATAAAACTGGGCGAGAGGTTATCAGAATTTAtgt > 1:487385/1‑251 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aCCTACGTTTGTTAAGTTGGAAGAAATCAATAAAACTGGGCGAGAGGTTATCAGAATTTATGTGTGATGTCTAGTTTTTAATCTCAACTGTTAGAACTGAATCATACCGGGTCAAGGGCGCTATGCTTTGTGTTGCAAAGATGTTATTGAAATTTATAATTTGATCTTGAGCAAAATAGTAAAAAACACCTATGTTTGATTATTTTTGATTTATATCTAAAAAtgtg > 1:373143/1‑227 (MQ=255) aCCTACGTTTGTTAAGTTGGAAGAAATCAATAAAACTGGGCGAGAGGTTATCAGAATTTATGTGTGATGTCTAGTTTTTAATCTCAACTGTTAGAACTGAATCATACCGGGTCAAGGGCGCTATGCTTTGTGTTGCAAAGATGTTATTGAAATTTATAATTTGATCTTGAGCAAAATAGTAAAAAACACCTATGTTTGATTATTTTTGATTTATATCTAAAAATGTGATCAGc < 1:613522/233‑1 (MQ=255) ccTACGTTTGTTAAGTTGGAAGAAATCAATAAAACTGGGCGAGAGGTTATCAGAATTTATGTGTGATGTCTAGTTTTTAATCTCAACTGTTAGAACTGAATCATACCGGGTCAAGGGCGCTATGCTTTGTGTTGCaa < 1:829972/137‑1 (MQ=255) aCGTTTGTTAAGTTGGAAGAAATCAATAAAACTGGGCGAGAGGTTATCAGAATTTATGTGTGATGTCTAGTTTTTAATCTCAACTGTTAGAACTGAATCATACCGGGTCAAGGGCGCTATGCTTTGTGTTGCaa > 1:735348/1‑134 (MQ=255) aCGTTTGTTAAGTTGGAAGAAATCAATAAAACTGGGCGAGAGGTTATCAGAATTTATGTGTGATGTCTAGTTTTTAATCTCAACTGTTAGAACTGAATCATACCGGGTCAAGGGCGCTATGCTTTGTGTTGCAAAGATGTTATTGaaa > 1:154452/1‑148 (MQ=255) aCGTTTGTTAAGTTGGAAGAAATCAATAAAACTGGGCGAGAGGTTATCAGAATTTATGTGTGATGTCTAGTTTTTAATCTCAACTGTTAGAACTGAATCATACCGGGTCAAGGGCGCTATGCTTTGTGTTGCAAAGATGTTATTGAAATTTATAATTTGATCTTGAGCAAAATAGTAAAAAACACCTATGTTTGATTATTTTTGATTTATATCTAAAAATGTGATCAGc > 1:596719/1‑229 (MQ=255) tttGTTAAGTTGGAAGAAATCAATAAAACTGGGCGAGAGGTTATCAGAATTTATGTGTGATGTCTAGTTTTTAATCTCAACTGTTAGAACTGAATCATACCGGGTCAAGGGCGCTATGCTTTGTGTTGCAAAGATGTTATTGAAATTTATAATTTGATCTTGAGCAAAATAGTAAAAAACACCTATGttt > 1:800328/1‑190 (MQ=255) aaGTTGGAAGAAATCAATAAAACTGGGCGAGAGGTTATCAGAATTTATGTGTGATGTCTAGTTTTTAATCTCAACTGTTAGAACTGAATCATACCGGGTCAAGGGCGCTATGCTTTGTGTTGCAAAGATGTTATTGAAATTTATAATTTGATCTTGAGCAAAATAGTAAAAAACACCTATGTTTGat > 1:651836/1‑187 (MQ=255) tGGGCGAGAGGTTATCAGAATTTATGTGTGATGTCTAGTTTTTAATCTCAACTGTTAGAACTGAATCATACCGGGTCAAGGGCGCTATGCTTTGTGTTGCAAAGATGTTATTGAAATTTATAATTTGATCTTGAGCAAAATAGTAAAAAACACCTATGTTTGATTATTTTTGATTTATATCTAAAAATGTGATCAGCTTGGCATAATTTACTATTTTTTATCCTTACGTTTAATAGTAGAATATGCCACCt < 1:804082/251‑1 (MQ=255) | GGGTATGTGTACCGGGCTGTCTTTCCGCTTCGGCAATTAAATTTTCGGCTTCACTAAATAAATCTTTGCACTGCTTTGGCATTTCTACTGCTTTTTTATCGTTTTGAGCAGCATTTGCAACGTTGTTGACAGTGATTGCCATGCAAAGTGCGGTTAGAATTCCGGTTATTTTGTTTGTCATCTGAGAGACCTACGTTTGTTAAGTTGGAAGAAATCAATAAAACTGGGCGAGAAGTTATCAGAATTTATGTGTGATGTCTAGTTTTTAATCTCAACTGTTAGAACTGAATCATACCGGGTCAAGGGCGCTATGCTTTGTGTTGCAAAGATGTTATTGAAATTTATAATTTGATCTTGAGCAAAATAGTAAAAAACACCTATGTTTGATTATTTTTGATTTATATCTAAAAATGTGATCAGCTTGGCATAATTTACTATTTTTTATCCTTACGTTTAATAGTAGAATATGCCACCT > 1/338217‑338691 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |