| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 2 | 95,929 | G→A | intergenic (‑184/+94) | unknown ← / ← unknown | hypothetical protein/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 2 | 95,929 | 0 | G | A | 100.0% | 239.8 / NA | 87 | intergenic (‑184/+94) | unknown/unknown | hypothetical protein/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (41/46); total (41/46) | |||||||||||
ACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAGTTTTTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCGGGTTTTGGGGGGCAGATCATAGGTGTTTATAAGGAAAATAACCGTTTTTCATTAATTCAAAGTTTAGCAATAGCCTACCTGTCGCCCGTTGCCATCAACAAAATGGGTGAATGGATTCAAATGCCAAATGTAACCATGCGATGGCTTCTATCGGGTGGCAACGCTGCAACCGAAGCTGATAGTCGGCAATCAATTTCGGTCAAAAGTGCGGTCATTTTATGAAGTGTTTTTTAAAAATAAAATTGAGTGGCGGAAGATCGTAGGAGTTGAACCTACCCGAGACTGCTGGCAGCCTCAACAGGATTTGAAGTCCTGCCGCCTCACCGGAAACGACGATCTTCCTCTTGGAAATTGATGCGAACTTTAGCGCAAAAGCCCGTGCGATTCAAGTG > 2/95683‑96163 | aCCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTTTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCGGGTTTTGGGGGGCAGATCATAGGTGTTTATAAGGAAAATAACCGTTTTTCATTAATTCAAAGTTTAGCAATAGCCTACCTGTCGCCCGTTGCCATCAACAAAATGGGTGAATGGATTCAAATGCCAAATGTAACCATGCGATGGCTTCTATCGGGTGACAAc < 1:442439/251‑1 (MQ=255) 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1:764833/211‑1 (MQ=255) gCCTACCTGTCGCCCGTTGCCATCAACAAAATGGGTGAATGGATTCAAATGCCAAATGTAACCATGCGATGGCTTCTATCGGGTGACAACGCTGCAACCGAAGCTGATAGTCGGCAATCAATTTCGGTCAAAAGTGCGGTCATTTTATGAAGTGTTTTTTAAAAATAAAATTGAGTGGCGGAAGATCGTAGGAGTTGAACCTACCCGAGACTGCTGGCAGCCTCAAc > 1:178246/1‑227 (MQ=255) ccTACCTGTCGCCCGTTGCCATCAACAAAATGGGTGAATGGATTCAAATGCCAAATGTAACCATGCGATGGCTTCTATCGGGTGACAACGCTGCAACCGAAGCTGATAGTCGGCAATCAATTTCGGTCAAAAGTGCGGTCATTTTATGAAGTGTTTTTTAAAAATAAAATTGAGTGGCGGAAGATCGTAGGAGTTGAACCTACCCGAGACTGCTGGCAGCCTCAACAGGATTTGAAGTCCTGCCGCCTc < 1:307493/249‑1 (MQ=255) ccTGTCGCCCGTTGCCATCAACAAAATGGGTGAATGGATTCAAATGCCAAATGTAACCATGCGATGGCTTCTATCGGGTGACAACGCTGCAACCGAAGCTGATAGTCGGCAATCAATTTCGGTCAAAAGTGCGGTCAttt > 1:237746/1‑140 (MQ=255) ccTGTCGCCCGTTGCCATCAACAAAATGGGTGAATGGATTCAAATGCCAAATGTAACCATGCGATGGCTTCTATCGGGTGACAACGCTGCAACCGAAGCTGATAGTCGGCAATCAATTTCGGTCAAAAGTGCGGTCATTTTATGAAGTGTTTTTTAAAAATAAAATTGAGTGGCGGAAGATCGTAGGAGTTGAACCTACCCg < 1:693858/202‑1 (MQ=255) 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aCCATGCGATGGCTTCTATCGGGTGACAACGCTGCAACCGAAGCTGATAGTCGGCAATCAATTTCGGTCAAAAGTGCGGTCATTTTATGAAGTGTTTTTTAAAAATAAAATTGAGTGGCGGAAGATCGTAGGAGTTGAACCTACCCGAGACTGCTGGCAGCCTCAACAGGATTTGAAGTCCTGCCGCCTCACCGGAAACGACGATCTTCCTCTTGGAAATTGATGCGAACTTTAACGCAAAAGCTCGTGCg > 1:492526/1‑251 (MQ=255) ccATGCGATGGCTTCTATCGGGTGACAACGCTGCAACCGAAGCTGATAGTCGGCAATCAATTTCGGTCAAAAGTGCGGTCATTTTATGAAGTGTTTTTTAAAAATAAAATTGAGTGGCGGAAGATCGTAGGAGTTGAACCTACCCGAGACTGCTGGCAGCCTCAACAGGATTTGAAGTCCTGCCGCCTCACCGGAAACGACGATCTTCCTCTTGGAAATTGATGCGAACTTTAGCGCAAAAGCTCGTGCGa > 1:42914/1‑251 (MQ=255) tGCGATGGCTTCTATCGGGTGACAACGCTGCAACCGAAGCTGATAGTCGGCAATCAATTTCGGTCAAAAGTGCGGTCATTTTATGAAGTGTTTTTTAAAAATAAAATTGAGTGGCGGAAGATCGTAGGAGTTGAACCTACCCGAGACTGCTGGCAGCCTCAACAGGATTTGAAGTCCTGCCGCCTCACCGGAAACGACGATCTTCCTCTTGGAAATTGATGCGAACTTTAGCGCAAAAGCTCGTGCGATTc < 1:139282/251‑1 (MQ=255) gCGATGGCTTCTATCGGGTGACAACGCTGCAACCGAAGCTGATAGTCGGCAATCAATTTCGGTCAAAAGTGCGGTCATTTTATGAAGTGTTTTTTAAAAATAAAATTGAGTGGCGGAAGATCGTAGGAGTTGAACCTACCCGAGACTGCTGGCAGCCTCAACAGGATTTGAAGTCCTGCCGCCTCACCGGAAACGACGATCTTCCTCTTGGa > 1:278482/1‑212 (MQ=255) ggCTTCTATCGGGTGACAACGCTGCAACCGAAGCTGATAGTCGGCAATCAATTTCGGTCAAAAGTGCGGTCATTTTATGAAGTGTTTTTTAAAAATAAAATTGAGTGGCGGAAGAt < 1:259388/116‑1 (MQ=255) gCTTCTATCGGGTGACAACGCTGCAACCGAAGCTGATAGTCGGCAATCAATTTCGGTCAAAAGTGCGGTCATTTTATGAAGTGTTTTTTAAAAATAAAATTGAGTGGCGGAAGATCGTAGGAGTTGAACCTACCCGAGACTGCTGGCAGCCTCAACAGGATTTGAAGTCCTGCCGCCTCACCGGAAACGACGATCTTCCTCTTGGAAATTGATGCGAACTTTAGCGCAAAAGCTCGTGCGATTCAAGTg < 1:404451/249‑1 (MQ=255) tCTATCGGGTGACAACGCTGCAACCGAAGCTGATAGTCGGCAATCAATTTCGGTCAAAAGTGCGGTCATTTTATGAAGTGTTTTTTAAAAATAAAATTGAGTGGCGGAAg < 1:769188/110‑1 (MQ=255) | ACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAGTTTTTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCGGGTTTTGGGGGGCAGATCATAGGTGTTTATAAGGAAAATAACCGTTTTTCATTAATTCAAAGTTTAGCAATAGCCTACCTGTCGCCCGTTGCCATCAACAAAATGGGTGAATGGATTCAAATGCCAAATGTAACCATGCGATGGCTTCTATCGGGTGGCAACGCTGCAACCGAAGCTGATAGTCGGCAATCAATTTCGGTCAAAAGTGCGGTCATTTTATGAAGTGTTTTTTAAAAATAAAATTGAGTGGCGGAAGATCGTAGGAGTTGAACCTACCCGAGACTGCTGGCAGCCTCAACAGGATTTGAAGTCCTGCCGCCTCACCGGAAACGACGATCTTCCTCTTGGAAATTGATGCGAACTTTAGCGCAAAAGCCCGTGCGATTCAAGTG > 2/95683‑96163 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |