| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 2 | 78,573 | A→G | I33T (ATC→ACC) | unknown ← | 2‑C‑methyl‑D‑erythritol 2,4‑cyclodiphosphate synthase (EC 4.6.1.12) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 2 | 78,573 | 0 | A | G | 98.5% | 320.9 / NA | 132 | I33T (ATC→ACC) | unknown | 2‑C‑methyl‑D‑erythritol 2,4‑cyclodiphosphate synthase (EC 4.6.1.12) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (66/64); minor base T (0/2); total (66/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.96e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
CGCATGGCGTCAATATGTGGGCGCATTTTCGGCGCTTGGGCGATGATGGTGACATCTACGTTGCCTACGCAATAGCCCTTTTCCTGAACCTGACGGTAGGCTTCGCGCAACAATACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGATAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGCCCCGCCACCAAGTGCGGTCGAAATCCCGCGAGTTCCATGGCGGAAGCTTCGTCG > 2/78330‑78799 | cgcATGGCGTCAATATGTGGGCGCATTTTCGGCGCTTGGGCGATGATGGTGACATCTACGTTGCCTACGCAATATCCCTTTTCCTGAACCTGACGGTAGGCTTCGCGCAACAATACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCGTCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGc > 1:486484/1‑250 (MQ=255) gTCAATATGTGGGCGCATTTTCGGCGCTTGGGCGATGATGGTGACATCTACGTTGCCTACGCAATATCCCTTTTCCTGAACCTGACGGTAGGCTTCGCGCAACAATACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCaa > 1:707886/1‑251 (MQ=255) cAATATGTGGGCGCATTTTCGGCGCTTGGGCGATGATGGTGACATCTACGTTGCCTACGCAATATCCCTTTTCCTGAACCTGACGGTAGGCTTCGCGCAACAATACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAg > 1:155343/1‑251 (MQ=255) atatGTGGGCGCATTTTCGGCGCTTGGGCGATGATGGTGACATCTACGTTGCCTACGCAATATCCCTTTTCCTGAACCTGACGGTAGGCTTCGCGCAACAATACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAggg > 1:704637/1‑251 (MQ=255) atatGTGGGCGCATTTTCGGCGCTTGGGCGATGATGGTGACATCTACGTTGCCTACGCAATATCCCTTTTCCTGAACCTGACGGTAGGCTTCGCGCAACAATACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCAGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAggg > 1:89861/1‑251 (MQ=255) cATTTTCGGCGCTTGGGCGATGATGGTGACATCTACGTTGCCTACGCAATATCCCTTTTCCTGAACCTGACGGTAGGCTTCGCGCAACAATACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGacac < 1:433865/251‑1 (MQ=255) gatgGTGACATCTACGTTGCCTACGCAATATCCCTTTTCCTGAACCTGACGGTAGGCTTCGCGCAACAATACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGcc > 1:899217/1‑207 (MQ=255) atgGTGACATCTACGTTGCCTACGCAATATCCCTTTTCCTGAACCTGACGGTAGGCTTCGCGCAACAATACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATc < 1:453580/212‑1 (MQ=255) cATCTACGTTGCCTACGCAATATCCCTTTTCCTGAACCTGACGGTAGGCTTCGCGCAACAATACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCg > 1:610344/1‑251 (MQ=255) gCAATATCCCTTTTCCTGAACCTGACGGTAGGCTTCGCGCAACAATACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCaa > 1:577865/1‑251 (MQ=255) acccctttcccgaaaCCTGACGGTAGGCTTCGCGCAACAATCCGCGCCTGCCCGCCCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAACGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGTTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCTTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCa < 1:708167/238‑1 (MQ=255) cccTTTTCCTGAACCTGACGGTAGGCTTCGCGCAACAATACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATg > 1:774029/1‑251 (MQ=255) ttCCTGAACCTGACGGTAGGCTTCGCGCAACAATACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGa > 1:693606/1‑251 (MQ=255) gacccTGACGGTGGGCTGCGCGCAACAATCCGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATACCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAAGGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGcc < 1:872273/241‑1 (MQ=255) gAACCTGACGGTAGGCTTCGCGCAACAATACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGt > 1:414900/1‑214 (MQ=255) aaCCTGACGGTAGGCTTCGCGCAACAATACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTa > 1:856322/1‑251 (MQ=255) gACGGTAGGCTTCGCGCAACAATACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAAc > 1:558925/1‑231 (MQ=255) ccgtgaGGCTTCGCGAAAAAATCCGCGGCTGCCCGCGCTTTTG‑TATTGCATTCCCGTGTCGGGAAACAGTTGGCCGATGTCCCCCAAGCCCGCCGCGCCGAGCACCGCATCGGTTAGCGCGTGAAATGCCACATCGCCGGCGGAATGGGCGGAAAACCCTTTATCAAAGGAAAGGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCatat < 1:511504/246‑1 (MQ=255) ccGGTAGGCTTCGCGCAACAATACGCGACTGCCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCatat < 1:151395/250‑1 (MQ=255) ccGGTAGGCTCCGCGCAACAATCCGCGCCTGTCCGCGCCTTTT‑TATTGCATATCCGTGTGGGGGAACAGTTTGCCGATGTCCCCCAATGCCGCCGGGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGAAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGGGGTAAAGCTTTTATAAAAGGAAATGGTGCCACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCatat < 1:70880/250‑1 (MQ=255) aCGGTAGGCTTCGCGCAACAATACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTGGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTc < 1:469474/225‑1 (MQ=255) aCGGTAGGCTTCGCGCAACAATACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCatat > 1:547416/1‑251 (MQ=255) tAGGCTTCGCGCAACAATCCGCGACTGCCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGAAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGTTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAACCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTc < 1:888107/251‑1 (MQ=255) tAGGCTTCGCGAAACAATACGCGCCTGTCCGCGCCTTTT‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGTTGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCCCATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAGGGAAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTc < 1:129781/251‑1 (MQ=255) ggCTTCGCGCAAAAATCCGCGACTGTCCGCGCTTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGAAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAGGGAAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCt < 1:48447/250‑1 (MQ=255) tggcgctacatgccgcgATTGTCCGCGCTTTTG‑TATTGCATGCCCGTGTCGGGGACCAGTTTCCCGTTGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCATCGCAGCGTTTAGCGCTTCCAATGCCACATCGCCGTCGAAATGGGCGGTAAACCTTTTTTAAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTc < 1:339668/238‑1 (MQ=255) tCGCGCAACAATCCGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATACCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGCCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGGGGTAAAGCTTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATc < 1:171910/237‑1 (MQ=255) ccgcgCAACAATCCGCACCTGCCCCCGCCTTTA‑TATTGCATCTCCGTGTCGGGGAACAGTTCGCCGATGCCGCCCAATGCCCCCGCACCGACCAACGCTTCGTTTAGCGAGTGCAATGCCCCATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGAAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTc < 1:222398/250‑1 (MQ=255) ccgcgAAACAATCCGCGACTGCCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTGGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTc < 1:884873/250‑1 (MQ=255) cgaaacaaTCCGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGAATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGt < 1:466981/247‑1 (MQ=255) caacaaTACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTaa > 1:807782/1‑251 (MQ=255) acaaTACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGacac < 1:531823/165‑1 (MQ=255) acaaTACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCa > 1:638092/1‑231 (MQ=255) aTACGCGACTGTCCGGGCCTTTG‑TATTGCATGCCCGTGCGGGGGAACAGTTTGCCGATGCCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCTTGGGTTGGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGGGGTAAAGCTTTTATCAAAGGGAATGGGGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAg < 1:225617/195‑1 (MQ=255) aTACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAAc > 1:76593/1‑210 (MQ=255) aTACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTaaa > 1:800578/1‑251 (MQ=255) ccgcgACTGTCCGCG‑CTTTGATATTGCATTCCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCAATGTCCCCCAAGCCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGATGAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTGGGAGTGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACGCCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAAt < 1:321755/250‑1 (MQ=255) ccgcgACTGCCCGCGCTTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCTTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAAt < 1:515844/250‑1 (MQ=255) ccGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCatat > 1:249793/1‑219 (MQ=255) ccTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCg < 1:179258/206‑1 (MQ=255) ccTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCt > 1:877832/1‑219 (MQ=255) ccTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTa > 1:461509/1‑228 (MQ=255) tttG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAAt > 1:583161/1‑250 (MQ=255) tttG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAAt > 1:747237/1‑250 (MQ=255) tttG‑TATTGCATACCCGTGTCGGGAAACAGTTTCCCGATGCCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCC‑TTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCatat < 1:572560/211‑1 (MQ=255) g‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCg > 1:537284/1‑155 (MQ=255) g‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAAc > 1:586934/1‑188 (MQ=255) g‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGc > 1:750061/1‑194 (MQ=255) g‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTc > 1:65511/1‑219 (MQ=255) g‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCtt > 1:742943/1‑250 (MQ=255) g‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGAAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGcc < 1:738192/237‑1 (MQ=255) ttGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCcgg > 1:758553/1‑251 (MQ=255) ttGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCcgg > 1:668374/1‑251 (MQ=255) ttGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCcgg > 1:100795/1‑251 (MQ=255) ttGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCcgg > 1:830903/1‑251 (MQ=255) gCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGATTGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCcggg > 1:605990/1‑250 (MQ=255) gCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCcggg > 1:38158/1‑250 (MQ=255) cATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAAGGCCACATCGCCGTCGGAATGGGGGGTAAAGCTTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCcgggc < 1:459679/250‑1 (MQ=255) atCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCcgggcgggg > 1:185001/1‑250 (MQ=255) tgggggAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCGGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACttt < 1:491434/248‑1 (MQ=255) tCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCatat > 1:239141/1‑193 (MQ=255) gggAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATg > 1:647363/1‑251 (MQ=255) ggaccAGTTTGCCGTTGTCCCCCAACGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTGGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAGGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATg < 1:2766/246‑1 (MQ=255) ggAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCACCGAATGGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTGGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAAGGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATg < 1:545936/250‑1 (MQ=255) ggAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATg < 1:441148/250‑1 (MQ=255) gaaaCAGTTTCCCGAGGTCGCCCATTGCCGCCGCGCCGAGCAACGAATGGGTTAGCGCGTCAAATGCCACACCGCCGTCGGAAGGGGCGGTAAGGCTTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATg < 1:776302/248‑1 (MQ=255) cAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGc > 1:886862/1‑170 (MQ=255) cAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCatat > 1:649977/1‑185 (MQ=255) ttgcccGATGTCCCCCAATCCCCCCGCGCCGAGCAACGCATCGTTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTGGAAATGGGAGGTAAACCCTTTATAAAAGGGAATGGTAACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACt < 1:756767/247‑1 (MQ=255) ttGCCGATGTCGCCCAAGGCCGCCGCGCCGAGCACCGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCt < 1:616800/186‑1 (MQ=255) cccGATGCCGCCCAAGGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACACCGCCGTCGGAAGGGGCGGTAAAGCTTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACg < 1:449147/250‑1 (MQ=255) ccGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGGGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGc < 1:458684/251‑1 (MQ=255) ccGATGTCCCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCTTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGc < 1:412465/251‑1 (MQ=255) cGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTGGGAATGGGCGTTAAAGCCTTTACCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGcc < 1:566802/251‑1 (MQ=255) tGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGCTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGCCCCg > 1:897890/1‑251 (MQ=255) tCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCTTCGTTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCGGTGGGAAGGGGCGGTAAAGCTTTTATAAAGGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGCCCCGc < 1:17015/250‑1 (MQ=255) gCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTg > 1:273814/1‑97 (MQ=255) gCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGCCCCGcca > 1:139037/1‑250 (MQ=255) ccccAAGGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAAGGCCCCACCGCCGTCGGAAGGGGCGGTAAAGCTTTTATCAAAGGGAAGGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGCCCCGccac < 1:389549/250‑1 (MQ=255) cccAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGCCCCGccac > 1:163214/1‑250 (MQ=255) ccgccgCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGAAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGCCCCGCCACCAAGTGc < 1:370761/250‑1 (MQ=255) gAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGc < 1:57055/97‑1 (MQ=255) gAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGt > 1:583993/1‑214 (MQ=255) aGCAACGCATCGGTTGGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTGGAAAGGGGGGTTAAAGCTTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGCCCCGCCACCAAGTGCGGTCGAAATcc < 1:507076/250‑1 (MQ=255) aCGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGCCCCGCCACCAAGTGCGGTCGAAATCCCGCGa > 1:101392/1‑251 (MQ=255) gCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGCCCCGCCACCAAGTGCGGTCGAAATCCCGCGAGt > 1:687899/1‑251 (MQ=255) gCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGCCCCGCCACCAAGTGCGGTCGAAATCCCGCGAGt > 1:429712/1‑251 (MQ=255) cGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTTGGTTTGGGCGGTAATGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGTCACCGCCGTTAATGTTCGGGATGTAGGTGCCGAAAGCGTGCACGTctaatc > 1:43013/1‑115 (MQ=255) cGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGt > 1:101427/1‑203 (MQ=255) cGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGCCCCGCCACCAAGTGCGGTCGAAATCCCGCGAGTTCCa > 1:376978/1‑251 (MQ=255) gTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGCCCCGCCACCAAGTGCGGTCGAAATCCCGCGAGTTCCATg > 1:340905/1‑251 (MQ=255) gTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAAGGGGGGGTAAAGCTTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGCCCCGCCACCAAGTg < 1:597495/226‑1 (MQ=255) ttAGCGCGGGCAACACCACATCGCCGTCGGAAGGGGCGGTAAGGCTTTTAGAAAAGGTAAGGATGACGCCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGCCCCGCCACCAAGTGCGGTCGAAATCCCGCGAGTTCCATgg < 1:4968/251‑1 (MQ=255) tAGCGCGTGAAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATAAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGCCCCGCCACCAAGTGCGGTCGAAATCCCGCGAGTTCCATGGc < 1:509579/251‑1 (MQ=255) gTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGCCCCGCCACCAAGTGCGGTCGAAATCCCGCGAGTTCCATGGCGGAAg > 1:627635/1‑250 (MQ=255) aTGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGCCCCGCCACCAAGTGCGGTCGAAATCCCGCGAGTTCCATGGCGGAAGCTtcgt > 1:184138/1‑251 (MQ=255) ccACATCGCCGTGGAAATGGGCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTCATg < 1:572963/184‑1 (MQ=255) ccGTCGGAATGGGCGGTAAAGCTTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGccc < 1:543140/190‑1 (MQ=255) aaggggCGGTAAGGCTTTTATCAAGGAGAATGGAGCCACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATg < 1:545275/166‑1 (MQ=255) gggCGGTAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAAc > 1:370354/1‑84 (MQ=255) | CGCATGGCGTCAATATGTGGGCGCATTTTCGGCGCTTGGGCGATGATGGTGACATCTACGTTGCCTACGCAATAGCCCTTTTCCTGAACCTGACGGTAGGCTTCGCGCAACAATACGCGACTGTCCGCGCCTTTG‑TATTGCATATCCGTGTCGGGGAACAGTTTGCCGATGTCGCCCAATGCCGCCGCGCCGAGCAACGCATCGGTTAGCGCGTGCAATGCCACATCGCCGTCGGAATGGGCGATAAAGCCTTTATCAAAGGGAATGGTGACACCGCCGATAATGAGCGGGTTGTTGGTGCCGAAAGCGTGCACGTCAAAACCATGGCCGATTCGTATCATATTGTCTTCCTCGTTAAGTAAAATTCCGCCAGCGCCAAATCTTCCGGGCGGGTGACTTTAATGTTATCACTACGCCCCGCCACCAAGTGCGGTCGAAATCCCGCGAGTTCCATGGCGGAAGCTTCGTCG > 2/78330‑78799 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |