| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 331,479 | G→T | R323L (CGT→CTT) | unknown → | Aspartyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.12) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 331,479 | 0 | G | T | 100.0% | 167.5 / NA | 62 | R323L (CGT→CTT) | unknown | Aspartyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.12) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (37/25); total (37/25) | |||||||||||
GGTACGTGAAATCATGGAACGTATGGTGCACGGTTTGTGGCAGCATACTTTAGGTGTCGATTTGGGCAAATTCCCGGTGATAACCTGGCAAGAAGCGATGCGCCGTTTTGGTTCCGATAAACCGGATTTGCGCAATCCGTTAGAACTGGTGGACGTGGCAGATATTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCGTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTAAACAAATTGATGAATATACCCAATTTGTCGGCATTTATGGTGCTAAAGGCTTGGCTTGGTTAAAAGTGAATGACGTAAACGCCGGTCTTGAAGGCGTCCAAAGCCCTATTGCAAAATTCTTAAATGAAGACGTGCTAAAAGCCTTGTTTGAACGCGTGGGCGCGCAAACTGGCGATATTTTATTCTTCGGTGCCGACAAATGGCAAACCGC > 1/331243‑331719 | ggTACGTGAAATCATGGAACGTATGGTGCACGGTTTGTGGCAGCATACTTTAGGTGTCGATTTGGGCAAATTCCCGGTGATAACCTGGCAAGAAGCGATGCGCCGTTTTGGTTCCGATAAACCGGATTTGCGCAATCCGTTAGAACTGGTGGACGTGGCAGATATTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGa > 1:883421/1‑251 (MQ=255)ggTACGTGAAATCATGGAACGTATGGTGCACGGTTTGTGGCAGCATACTTTAGGTGTCGATTTGGGCAAATTCCCGGTGATAACCTGGCAAGAAGCGATGCGCCGTTTTGGTTCCGATAAACCGGATTTGCGCAATCCGTTAGAACTGGTGGACGTGGCAGATATTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGa > 1:842137/1‑251 (MQ=255) aCGTGAAATCATGGAACGTATGGTGCACGGTTTGTGGCAGCATACTTTAGGTGTCGATTTGGGCAAATTCCCGGTGATAACCTGGCAAGAAGCGATGCGCCGTTTTGGTTCCGATAAACCGGATTTGCGCAATCCGTTAGAACTGGTGGACGTGGCAGATATTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATg > 1:527951/1‑251 (MQ=255) aCGTGAAATCATGGAACGTATGGTGCACGGTTTGTGGCAGCATACTTTAGGTGTCGATTTGGGCAAATTCCCGGTGATAACCTGGCAAGAAGCGATGCGCCGTTTTGGTTCCGATAAACCGGATTTGCGCAATCCGTTAGAACTGGTGGACGTGGCAGATATTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATg > 1:362655/1‑251 (MQ=255) aCGTGAAATCATGGAACGTATGGTGCACGGTTTGTGGCAGCATACTTTAGGTGTCGATTTGGGCAAATTCCCGGTGATAACCTGGCAAGAAGCGATGCGCCGTTTTGGTTCCGATAAACCGGATTTGCGCAATCCGTTAGAACTGGTGGACGTGGCAGATATTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATg > 1:6384/1‑251 (MQ=255) ggAACGTATGGTGCACGGTTTGTGGCAGCATACTTTAGGTGTCGATTTGGGCAAATTCCCGGTGATAACCTGGCAAGAAGCGATGCGCCGTTTTGGTTCCGATAAACCGGATTTGCGCAATCCGTTAGAACTGGTGGACGTGGCAGATATTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTa > 1:186910/1‑251 (MQ=255) aaCGTATGGTGCACGGTTTGTGGCAGCATACTTTAGGTGTCGATTTGGGCAAATTCCCGGTGATAACCTGGCAAGAAGCGATGCGCCGTTTTGGTTCCGATAAACCGGATTTGCGCAATCCGTTAGAGCTGGTGGACGTGGCAGATATTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAGGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATg < 1:633027/237‑1 (MQ=255) 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gTTTGTGGCAGCATACTTTAGGTGTCGATTTGGGCAAATTCCCGGTGATAACCTGGCAAGAAGCGATGCGCCGTTTTGGTTCCGATAAACCGGATTTGCGCAATCCGTTAGAACTGGTGGACGTGGCAGATATTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATGAAAt > 1:534789/1‑226 (MQ=255) gTTTGTGGCAGCATACTTTAGGTGTCGATTTGGGCAAATTCCCGGTGATAACCTGGCAAGAAGCGATGCGCCGTTTTGGTTCCGATAAACCGGATTTGCGCAATCCGTTAGAACTGGTGGACGTGGCAGATATTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTAAACAAATTGATGAatat > 1:344313/1‑251 (MQ=255) gTTTGTGGCAGCATACTTTAGGTGTCGATTTGGGCAAATTCCCGGTGATAACCTGGCAAGAAGCGATGCGCCGTTTTGGTTCCGATAAACCGGATTTGCGCAATCCGTTAGAACTGGTGGACGTGGCAGATATTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTAAACAAATTGATGAatat > 1:338642/1‑251 (MQ=255) 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ttCCCGGTGATAACCTGGCAAGAAGCGATGCGCCGTTTTGGTTCCGATAAACCGGATTTGCGCAATCCGTTAGAACTGGTGGACGTGGCAGATATTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTAAACAAATTGATGAATATACCCAATTTGTCGGCATTTATGGTGCTAAAg > 1:737020/1‑244 (MQ=255) cagggTGATAACCTGGCAAGAAGCGATGCGCCGTTTTGGTTCCGATAAACCGGATTTGCGCAATCCGTTAGAACTGGTGGACGTGGCAGATATTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTAAACAAATTGATGAATATACCCAATTTGTCGGCATTTATGGTGCTAAAggcttggctt > 1:557973/4‑251 (MQ=255) gTGATAACCTGGCAAGAAGCGATGCGCCGTTTTGGTTCCGATAAACCGGATTTGCGCAATCCGTTAGAACTGGTGGACGTGGCAGATATTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGc < 1:532801/166‑1 (MQ=255) gTGATAACCTGGCAAGAAGCGATGCGCCGTTTTGGTTCCGATAAACCGGATTTGCGCAATCCGTTAGAACTGGTGGACGTGGCAGATATTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTAAACAAATTGATGAATATACCCAATTTGTCGGCATTTATGGTGCTAAAgg < 1:609406/239‑1 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ttGGTTCCGATAAACCGGATTTGCGCAATCCGTTAGAACTGGTGGACGTGGCAGATATTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTAAACAAATTGATGAATATACCCAATTTGTCGGCATTTATGGTGCTAAAGGCTTGGCTTGGTTAAAAGTGAATGACGTAAACGCCGGTCTTGaa < 1:887259/251‑1 (MQ=255) ccGATAAACCGGATTTGCGCAATCCGTTAGAACTGGTGGACGTGGCAGATATTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTAAACAAATTGATGAATATACCCAATTTGTCGGCATTTATgg < 1:376628/193‑1 (MQ=255) ccGTTAGAACTGGTGGACGTGGCAGATATTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTAAACAAATTGATGAATATACCCAATTTGTCGGCATTTATGGTGCTAAAGGCTTGGCTTGGTTAAAAGTGAATGACGTAAACGCCGGTCTTGAAGGCGTCCAAAGCCCTATTGCAAAATTCtt > 1:715648/1‑251 (MQ=255) cGTTAGAACTGGTGGACGTGGCAGATATTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTAAACAAATTGATGAATATAcc < 1:113217/149‑1 (MQ=255) 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atatTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTAAACAAATTGATGAATATACCCAATTTGTCGGCATTTATGGTGCTAAAGGCTTGGCTTGGTTAAAAGTGAATGACGTAAACGCCGGTCTTGAAGGCGTCCAAAGCCCTATTGCAAAATTCTTAAATGAAGACGTGCTAAAAGcc < 1:190797/248‑1 (MQ=255) aaaaCGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTAAACAAATTGATGAATATACCCAATTTGTCGGCATTTATGGTGCTAAAGGCTTGGCTTGGTTAAAAGTGAATGACGTAAACGCCGGTCTTGAAGGCGTCCAAAGc > 1:333948/1‑200 (MQ=255) cGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTAAACAAATTGATGAATATACCCAATTTGTCGGCATTTATGGTGCTAAAGGCTTGGCTTGGTTAAAAGTGAATGACGTAAACGCCGGTCTTGAAGGCGTCCAAAGCCCTATTGCAAAATTCTTAAATGAAGAc < 1:846561/223‑1 (MQ=255) gTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTAAACAAATTGATGAATATACCCAATTTGTCGGCATTTATGGTGCTAAAGGCTTGGCTTGGTTAAAAGTGAATGACGTAAACGc < 1:224308/173‑1 (MQ=255) 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1:608615/1‑251 (MQ=255) ttCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTAAACAAATTGATGAATATACCCAATTTGTCGGCATTTATGGTGCTAAAGGCTTGGCTTGGTTAAAAGTGAATGACGTAAACGCCGGTCTTGAAGGCGTCCAAAGCCCTATTGCAAAATTCTTAAATGAAGACGTGCTAAAAGCCTTGTTTGAACGCGTGGGCGCGCAAACTGGCGa > 1:851856/1‑251 (MQ=255) ccGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTAAACAAATTGATGAATATACCCAATTTGTCGGCATTTATGGTGCTAAAGGCTTGGCTTGGTTAAAAGTGAATGACg < 1:616811/142‑1 (MQ=255) cGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTAAACAAATTGATGAATATACCCAATTTGTCGGCATTTATGGTGCTAAAGGCTTGGCTTGGTTAAAAGTGAATGACGTAAACGCCGGTCTTGAAGGCGTCCAAAGCCCTATTGCAAAATTCTTAAATGAAGACGTGCTAAAAGCCTTGTTTGAACGCGTGGGCGCGCAAACTGGCGATATTTTAttc < 1:836301/251‑1 (MQ=255) gCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTAAACAAATTGATGAATATACCCAATTTGTCGGCATTTATGGTGCTAAAGGCTTGGCTTGGTTAAAAGTGAATGACGTAAACGCCGGTCTTGAAGGCGTCCAAAGCCCTATTGc < 1:675440/176‑1 (MQ=255) 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ccTTAATTCTTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTAAACAAATTGATGAATATACCCAATTTGTCGGCATTTATGGTGCTAAAGGCTTGGCTTGGTTAAAAGTGAATGACGTAAACGCCGGTCTTGAAGGCGTCCAAAGCCCTATTGCAAAATTCTTAAATGAAGACGTGCTAAAAGCCTTGTTTGAACGCGTGGGCGCGCAAACTGGCGATATTTTATTCATCGGTGCCGACAAATGGCAAACCGc > 1:484931/1‑250 (MQ=255) | GGTACGTGAAATCATGGAACGTATGGTGCACGGTTTGTGGCAGCATACTTTAGGTGTCGATTTGGGCAAATTCCCGGTGATAACCTGGCAAGAAGCGATGCGCCGTTTTGGTTCCGATAAACCGGATTTGCGCAATCCGTTAGAACTGGTGGACGTGGCAGATATTGTCAAAAACGTAGATTTCAAGATATTCCAAGGTCCGGCAAATGACCCGAATGGTCGTGTCACCTTAATTCGTGTGCCGCAGGGGAATGAAATCACCCGTAAACAAATTGATGAATATACCCAATTTGTCGGCATTTATGGTGCTAAAGGCTTGGCTTGGTTAAAAGTGAATGACGTAAACGCCGGTCTTGAAGGCGTCCAAAGCCCTATTGCAAAATTCTTAAATGAAGACGTGCTAAAAGCCTTGTTTGAACGCGTGGGCGCGCAAACTGGCGATATTTTATTCTTCGGTGCCGACAAATGGCAAACCGC > 1/331243‑331719 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |