| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 329,144 | T→C | S188G (AGC→GGC) | unknown ← | Carboxy‑S‑adenosyl‑L‑methionine synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 329,144 | 0 | T | C | 100.0% | 191.3 / NA | 70 | S188G (AGC→GGC) | unknown | Carboxy‑S‑adenosyl‑L‑methionine synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (36/34); total (36/34) | |||||||||||
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1:542556/156‑1 (MQ=255) tCTAATTCACTGTAGCCGTTGGCACGTTTGAATTGGTGGTGCAGGTCGATCAGCAATTCGTCAATTTTCCCATCTTCAAAACGGAATTTTTCCGATAGCACCAACACGCCATTGGGATTTAATCCTTGATAAATTTTCTCCAGTAACGCAATGCGATCCTGCGGCAGTAAAAATTGCAGGGTGAAATTTAAAATCACCATGGATGCGTTTTTg > 1:169921/1‑213 (MQ=255) cTAATTCACTGTAGCCGTTGGCACGTTTGAATTGGTGGTGCAGGTCGATCAGCAATTCGTCAATTTTCCCATCTTCAAAACGGAATTTTTCCGATAGCACCAACACGCCATTGGGATTTAATCCTTGATAAATTTTCTCCAGTAACGCAATGCGATCCTGCGGCAGTAAAAATTGCAGGGTGAAATTTAAAATCACCATGGATGCGTTTTTGATCCCAATATGACGAATGTCATCACATAAAATTTCCAc > 1:390768/1‑250 (MQ=255) cACTGTAGCCGTTGGCACGTTTGAATTGGTGGTGCAGGTCGATCAGCAATTCGTCAATTTTCCCATCTTCAAAACGGAATTTTTCCGATAGCACCAACACGCCATTGGGATTTAATCCTTGATAAATTTTCTCCAGTAACGCAATGCGATCCTGCGGCAGTAAAAATTGCAGGGTGAAATTTAAAATCACCATGGATGCGTTTTTGATCCCAATATGACGAATGt < 1:198751/225‑1 (MQ=255) cTGTAGCCGTTGGCACGTTTGAATTGGTGGTGCAGGTCGATCAGCAATTCGTCAATTTTCCCATCTTCAAAACGGAATTTTTCCGATAGCACCAACACGCCATTGGGATTTAATCCTTGATAAATTTTCTCCAGTAACGCAATGCGATCCTGCGGCAGTAAAAATTGCAGGGTGAAATTTAAAATCACCATGGATGCGTTTTTGATCCCAATATGACGAATGTCATCACATAAAATTTCCAc > 1:23714/1‑242 (MQ=255) gTAGCCGTTGGCACGTTTGAATTGGTGGTGCAGGTCGATCAGCAATTCGTCAATTTTCCCATCTTCAAAACGGAATTTTTCCGATAGCACCAACACGCCATTGGGATTTAATCCTTGATAAATTTTCTCCAGTAACGCAATGCGATCCTGCGGCAGTAAAAATTGCAGGGTGAAATTTAAAAt > 1:333039/1‑183 (MQ=255) tAGCCGTTGGCACGTTTGAATTGGTGGTGCAGGTCGATCAGCAATTCGTCAATTTTCCCATCTTCAAAACGGAATTTTTCCGATAGCACCAACACGCCATTGGGATTTAATCCTTGATAAATTTTCTCCAGTAACGCAATGCGATCCTGCGGCAGTAAAAATTGCAGGGTGAAATTTAAAATCACCATGGATGCGTTTTTGATCCCAATATGACGAATGTCATCACATAAAATTTCCACCGGGATGTTGc < 1:687593/250‑1 (MQ=255) | AAAAGGCGTTCAACAAAAAGTGCGGTGGATTTTTAAAATGTTTTTTAAATCCACCGCACTTTTCTCTTGGAAGAACGCATTATTTGATGGCGATCATCGAACCGAAATTAAAGCACTGGAACCACAGTTCCACATGGGAAAATCCCACATTTTTTAACCGCACTTTATGGGTTTCAATACTGTCCGTACGCATAACCTTTTCCAAGGCAGTGCGTTTCTGGCTCACTTCTAATTCACTGTAGCTGTTGGCACGTTTGAATTGGTGGTGCAGGTCGATCAGCAATTCGTCAATTTTCCCATCTTCAAAACGGAATTTTTCCGATAGCACCAACACGCCATTGGGATTTAATCCTTGATAAATTTTCTCCAGTAACGCAATGCGATCCTGCGGCAGTAAAAATTGCAGGGTGAAATTTAAAATCACCATGGATGCGTTTTTGATCCCAATATGACGAATGTCATCACATAAAATTTCCACCGGGATGTTGC > 1/328901‑329389 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |