| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 327,734 | A→G | I468V (ATT→GTT) | unknown → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 327,734 | 0 | A | G | 100.0% | 165.2 / NA | 61 | I468V (ATT→GTT) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (35/26); total (35/26) | |||||||||||
TGCCGATGTATTTGATTCTTACGGTGAGGGCGCCTTAACCTGTGATGTACCGTTATTGTTTACTGCGATAATTTCTATGCTTTATTTTTTACGCAAAGAGAACTGGCTGAGAACTCTAACTCTCGTGATTGTTTTGGGCGTGTGGCATATTTATTTAACCGATTGTTCCACAGGTGATCTTAGCCATGCCAATCGCATCGAATACAGTTATGTGCCTTTGTATTTTGTCACGATGTTGGGTTGCATTATTGCTTTCTTTGTGCAAAATATATACGGAGAAAACAGTAAAGTCAGAGTGCGGATCACGCCTGTTGCTTGGGCGTTTTTACTGTTCAGCATAGGCGGCTGGGCGTTTTCCACTGATAATTTCTTGTCTTTGTTTGTAGTCTACGTTCCCGGCACTGTGGATGCGCTACCGGAAATTGATACTTTCAGCGGCTTCTTTACGATGATCACCGCCGGGTTTTATTCTCGCGCTGTGCTCGGATT > 1/327490‑327978 | tGCCGATGTATTTGATTCTTACGGTGAGGGCGCCTTAACCTGTGATGTACCGTTATTGTTTACTGCGATAATTTCTATGCTTTATTTTTTACGCAAAGAGAACTGGCTGAAAACTCTAACTCTCGTGATTGTTTTGGGCGTGTGGCATATTTATTTAACCGATTGTTCCACAGGTGATCTTAGCCATGCCAATCGCATCGAATACAGTTATGTGCCTTTGTATTTTGTCACGATGTTGGGTTGCGTTATTg < 1:595373/251‑1 (MQ=255)tGCCGATGTATTTGATTCTTACGGTGAGGGCGCCTTAACCTGTGATGTACCGTTATTGTTTACTGCGATAATTTCTATGCTTTATTTTTTACGCAAAGAGAACTGGCTGAAAACTCTAACTCTCGTGATTGTTTTGGGCGTGTGGCATATTTATTTAACCGATTGTTCCACAGGTGATCTTAGCCATGCCAATCGCATCGAATACAGTTATGTGCCTTTGTATTTTGTCACGATGTTGGGTTGCGTTATTg > 1:468575/1‑251 (MQ=255) aTTTGATTCTTACGGTGAGGGCGCCTTAACCTGTGATGTACCGTTATTGTTTACTGCGATAATTTCTATGCTTTATTTTTTACGCAAAGAGAACTGGCTGAAAACTCTAACTCTCGTGATTGTTTTGGGCGTGTGGCATATTTATTTAACCGATTGTTCCACAGGTGATCTTAGCCATGCCAATCGCATCGAATACAGTTATGTGCCTTTGTATTTTGTCACGATGTTGGGTTGCGTTATTGCTTTCTTtg > 1:16968/1‑251 (MQ=255) tCTTAC‑GTGAAGGCGCCTTAACCTGTGATGTACCGTTATTGTTTACTGCGATAATTTCTATGCTTTATTTTTTACGCAAAGAGAACTGGCTGAAAACTCTAACTCTCGTGATTGTTTTGGGCGTGTGGCATATTTATTTAACCGATTGTTCCACAGGTGATCTTAGCCATGCCAATCGCATCGAATACAGTTATGTGCCTTTGTATTTTGTCACGATGTTGGGTTGCGTTATTGCTTTCTTTGTGCAAAat < 1:588248/251‑1 (MQ=255) cTTACGGTGAGGGCGCCTTAACCTGTGATGTACCGTTATTGTTTACTGCGATAATTTCTATGCTTTATTTTTTACGCAAAGAGAACTGGCTGAAAACTCTAACTCTCGTGATTGTTTTGGGCGTGTGGCATATTTATTTAACCGATTGTTCCACAGGTGATCTTAGCCATGCCAATCGCATCGAATACAGTTATGTGCCTTTGTATTTTGTCACGATGTTGGGTTGCGTTATTGCTTTCTTTGTGCAAAat > 1:437428/1‑251 (MQ=255) ccTTAACCTGTGATGTACCGTTATTGTTTACTGCGATAATTTCTATGCTTTATTTTTTACGCAAAGAGAACTGGCTGAAAACTCTAACTCTCGTGATTGTTTTGGGCGTGTGGCATATTTATTTAACCGATTGTTCCACAGGTGATCTTAGCCATGCCAATCGCATCGAATACAGTTATGTGCCTTTGTATTTTGTCACGATGTTGGGTTGCGTTATTGCTTTCTTTGTGCAAAATATATAc > 1:812688/1‑242 (MQ=255) ccTTAACCTGTGATGTACCGTTATTGTTTACTGCGATAATTTCTATGCTTTATTTTTTACGCAAAGAGAACTGGCTGAAAACTCTAACTCTCGTGATTGTTTTGGGCGTGTGGCATATTTATTTAACCGATTGTTCCACAGGTGATCTTAGCCATGCCAATCGCATCGAATACAGTTATGTGCCTTTGTATTTTGTCACGATGTTGGGTTGCGTTATTGCTTTCTTTGTGCAAAATATATACGGAGaaaa > 1:506997/1‑250 (MQ=255) 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TGCCGATGTATTTGATTCTTACGGTGAGGGCGCCTTAACCTGTGATGTACCGTTATTGTTTACTGCGATAATTTCTATGCTTTATTTTTTACGCAAAGAGAACTGGCTGAGAACTCTAACTCTCGTGATTGTTTTGGGCGTGTGGCATATTTATTTAACCGATTGTTCCACAGGTGATCTTAGCCATGCCAATCGCATCGAATACAGTTATGTGCCTTTGTATTTTGTCACGATGTTGGGTTGCATTATTGCTTTCTTTGTGCAAAATATATACGGAGAAAACAGTAAAGTCAGAGTGCGGATCACGCCTGTTGCTTGGGCGTTTTTACTGTTCAGCATAGGCGGCTGGGCGTTTTCCACTGATAATTTCTTGTCTTTGTTTGTAGTCTACGTTCCCGGCACTGTGGATGCGCTACCGGAAATTGATACTTTCAGCGGCTTCTTTACGATGATCACCGCCGGGTTTTATTCTCGCGCTGTGCTCGGATT > 1/327490‑327978 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |