| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 327,600 | G→A | R423K (AGA→AAA) | unknown → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 327,600 | 0 | G | A | 100.0% | 151.5 / NA | 57 | R423K (AGA→AAA) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (31/26); total (31/26) | |||||||||||
TTTTAAACGTTATTGTGTTGTTTATTGCGCTGGGGTTGCATTTTGGCAATCCCCACGCGGAAAGTCATATGTCGATTATCATCGGGATTTTCTTCTTTATGGGCTACAATCTGCTTGCCGGTTATTTCCTTGCCGATGTATTTGATTCTTACGGTGAGGGCGCCTTAACCTGTGATGTACCGTTATTGTTTACTGCGATAATTTCTATGCTTTATTTTTTACGCAAAGAGAACTGGCTGAGAACTCTAACTCTCGTGATTGTTTTGGGCGTGTGGCATATTTATTTAACCGATTGTTCCACAGGTGATCTTAGCCATGCCAATCGCATCGAATACAGTTATGTGCCTTTGTATTTTGTCACGATGTTGGGTTGCATTATTGCTTTCTTTGTGCAAAATATATACGGAGAAAACAGTAAAGTCAGAGTGCGGATCACGCCTGTTGCTTGGGCGTTTTTACTGTTCAGCATAGGCGGCTGGGCG > 1/327360‑327841 | ttttAAACGTTATTGTGTTGTTTATTGCGCTGGGGTTGCATTTTGGCAATCCCCACGCGGAAAGTCATATGTCGATTATCATCGGGATTTTCTTCTTTATGGGCTACAATCTGCTTGCCGGTTATTTCCTTGCCGATGTATTTGATTCTTACGGTGAGGGCGCCTTAACCTGTGATGTACCGTTATTGTTTACTGCGATAATTTCTATGCTTTATTTTTTACGCAAAGAGAACTGGCTGAAaactctaact < 1:515548/251‑1 (MQ=255) 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1:318568/251‑1 (MQ=255) ttcttTATGGGCTACAATCTGCTTGCCGGTTATTTCCTTGCCGATGTATTTGATTCTTACGGTGAGGGCGCCTTAACCTGTGATGTACCGTTATTGTTTACTGCGATAATTTCTATGCTTTATTTTTTACGCAAAGAGAACTGGCTGAAAACTCTAACTCTCGTGATTGTTTTGGGCGTGTGGCATATTTATTTAACCGATTGTTCCACAGGTGATCTTAGCCATGCCAATCGCATCGAATACAGTTAtgt < 1:513716/251‑1 (MQ=255) cTACAATCTGCTTGCCGGTTATTTCCTTGCCGATGTATTTGATTCTTACGGTGAGGGCGCCTTAACCTGTGATGTACCGTTATTGTTTACTGCGATAATTTCTATGCTTTATTTTTTACGCAAAGAGAACTGGCTGAAAACTCTAACTCTCGTGATTGTTTTGGGCGTGTGGCATATTTATTTAACCGATTGTTCCACAGGTGATCTTAGc > 1:51839/1‑211 (MQ=255) cTACAATCTGCTTGCCGGTTATTTCCTTGCCGATGTATTTGATTCTTACGGTGAGGGCGCCTTAACCTGTGATGTACCGTTATTGTTTACTGCGATAATTTCTATGCTTTATTTTTTACGCAAAGAGAACTGGCTGAAAACTCTAACTCTCGTGATTGTTTTGGGCGTGTGGCATATTTATTTAACCGATTGTTCCACAGGTGATCTTAGCCATGCCAATCGCATCGAATACAGTTa > 1:391534/1‑237 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |