| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 2 | 21,392 | 0 | A | G | 100.0% | 211.5 / NA | 73 | S214P (TCA→CCA) | unknown | COG0859: ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (31/42); total (31/42) | |||||||||||
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aTTTTCTACAATCGTTGGGGAAAGTGGATTTAATAATTCGGCAAATTCGCTTGCCGGAATTTTTCTGGTACTGCCTTCAGGTGCCAATAAAATTCTCACTTTATCGCCCCAAAGCACTTCAAATCTAATGGTTTCCTGATTTATTAAAGCATATT‑CCACAGCCTTTGGATCTAAATAAGCAGAAATGGCAGAATCATTCAAATATTCAGAAATAtgtgttgtgt < 1:602960/224‑1 (MQ=255) ttCTACAATCGTTGGGGAAAGTGGATTTAATAATTCGGCAAATTCGCTTGCCGGAATTTTTCTGGTACTGCCTTCAGGTGCCAATAAAATTCTCACTTTATCGCCCCAAAGCACTTCAAATCTAATGGTTTCCTGa < 1:173931/136‑1 (MQ=255) ttCTACAATCGTTGGGGAAAGTGGATTTAATAATTCGGCAAATTCGCTTGCCGGAATTTTTCTGGTACTGCCTTCAGGTGCCAATAAAATTCTCACTTTATCGCCCCAAAGCACTTCAAATCTAATGGTTTCCTGATTTATTAAAGCATATT‑CCACAGCCTTTGGATCTAAATAAg < 1:77900/176‑1 (MQ=255) ttCTACAATCGTTGGGGAAAGTGGATTTAATAATTCGGCAAATTCGCTTGCCGGAATTTTTCTGGTACTGCCTTCAGGTGCCAATAAAATTCTCACTTTATCGCCCCAAAGCACTTCAAATCTAATGGTTTCCTGATTTATTAAAGCATATT‑CCACAGCCTTTGGATCTAAATAAGCAGAAATGGCAGAATCATTCAAATATTCAGaaa < 1:873141/209‑1 (MQ=255) ttCTACAATCGTTGGGGAAAGTGGATTTAATAATTCGGCAAATTCGCTTGCCGGAATTTTTCTGGTACTGCCTTCAGGTGCCAATAAAATTCTCACTTTATCGCCCCAAAGCACTTCAAATCTAATGGTTTCCTGATTTATTAAAGCATATT‑CCACAGCCTTTGGATCTAAATAAGCAGAAATGGCAGAATCATTCAAATATTCAGAAATAtgtgttgtgt > 1:728300/1‑221 (MQ=255) cTACAATCGTTGGGGAAAGTGGATTTAATAATTCGGCAAATTCGCTTGCCGGAATTTTTCTGGTACTGCCTTCAGGTGCCAATAAAATTCTCACTTTATCGCCCCAAAGCACTTCAAATCTAATGGTTTcc > 1:613100/1‑131 (MQ=255) gAAAGTGGATTTAATAATTCGGCAAATTCGCTTGCCGGAATTTTTCTGGTACTGCCTTCAGGTGCCAATAAAATTCTCACTTTATCGCCCCAAAGCACTTCAAATCTAATGGTTTCCTGATTTATTAAAGCATATT‑CCACAGCCTTTGGATCTAAATAAGCAGAAATGGCAGAATCATTCAAATATTCAGAAATATGTGTTGTGTCATTTTGTGGACAAGCGAAATTATAATTTTTGATTGTATCTAAAt < 1:77232/250‑1 (MQ=255) | CGCATAAAATGCCAAGACTTTTTTCTGCAGGGCTGTAGCAAGATGAACCGTTCCGCTATCAACACTAATAATTAAATCCGCAGAAGAAACAAGCTGGATATATTCCTGAATTGTGGTTTTAGGTGATAATTTTATCTGAATTTTGTTATCACATAATGAAATTAATTCTTCGAAATAAGTGGCACTTTCTTTCGTATTTGTTAGCACAAAAAGTACATTTTCTACAATCGTTGGGGAAAGTGAATTTAATAATTCGGCAAATTCGCTTGCCGGAATTTTTCTGGTACTGCCTTCAGGTGCCAATAAAATTCTCACTTTATCGCCCCAAAGCACTTCAAATCTAATGGTTTCCTGATTTATTAAAGCATATT‑CCACAGCCTTTGGATCTAAATAAGCAGAAATGGCAGAATCATTCAAATATTCAGAAATATGTGTTGTGTCATTTTGTGGACAAGCGAAATTATAATTTTTGATTGTATCTAAAT > 2/21150‑21634 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |