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tCAATGGCGATTTGCTCAAT‑GGGTTTATCCAGTTCCTTAATCAGCTTTTTTATGTTGCGGACGGAGCGCGGTTCATCCTGAATCAGCAACAAATTGCTACGATCGTCGAAAGTGATACTGCCGTTAGGCGACAACAGGGAACCACTCCCCCCGGTGAGGGATTTCATCACTTCCGACGCTTTGGCAAAGTGTAAttt > 1:509836/1‑197 (MQ=255) cAATGGCGATTTGCTCAAT‑GGGTTTATCCAGTTCCTTAATCAGCTTTTTTATGTTGCGGACGGAGCGCGGTTCATCCTGAATCAGCAACAAATTGCTACGATCGTCGAAAGTGATACTGCCGTTAGGCGACAACAGGGAACCACTCCCCCCGGTGAGGGATTTCATCACTTCCGACGCTTTGGCAAAGTGTAATTTAATGGTCGCCGTGTTCAGCTGTGCCGGTTCTTCCGCCATGGGCAGAGAAAGAggg < 1:574999/251‑1 (MQ=255) cAATGGCGATTGGCTCAAT‑GGGTTTATCCAGTTCCTTAATCAGCTTTTTTATGTTGCGGACGGAGCGCGGTTCATCCTGAAGCAGCAACAAATTGCTACGATCGTCGAAAGTGATACTGCCGTTAGGCGACAACAGGGAACCACTCCCCCCGGTGAGGGATTTCATCACTTCCGACGCTTTGGCAAAGTGTAATTTAATGGTCGCCGTGTTCAGCTGTGCCGGTTCTTCCGCCATGGGCAGAGAAAGAggg < 1:455303/251‑1 (MQ=255) 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cTCAAT‑GGGTTTATCCAGTTCCTTAATCAGCTTTTTTATGTTGCGGACGGAGCGCGGTTCATCCTGAATCAGCAACAAATTGCTACGATCGTCGAAAGTGATACTGCCGTTAGGCGACAACAGGGAACCACTCCCCCCGGTGAGGGATTTCATCACTTCCGACGCTTTGGCAAAGTGTAAttt < 1:135496/183‑1 (MQ=255) gggTTTATCCAGTTCCTTAATCAGCTTTTTTATGTTGCGGACGGAGCGCGGTTCATCCTGAATCAGCAACAAATTGCTACGATCGTCGAAAGTGATACTGCCGTTAGGCGACAACAGGGAACCACTCCCCCCGGTGAGGGATTTCATCACTTCCGACGCTTTGGCAAAGTGTAATTTAATGGTCGCCGTGTTCAGCTGTGCCGGTTCTTCCGCCATGGGCAGAGAAAGAGGGAAAGGCTCTTCCATTTTg > 1:629930/1‑250 (MQ=255) gggTTTATCCAGTTCCTTAATCAGCTTTTTTATGTTGCGGACGGAGCGCGGTTCATCCTGAATCAGCAACAAATTGCTACGATCGTCGAAAGTGATACTGCCGTTAGGCGACAACAGGGAACCACTCCCCCCGGTGAGGGATTTCATCACTTCCGACGCTTTGGCAAAGTGTAATTTAATGGTCGCCGTGTTCAGCTGTGCCGGTTCTTCCGCCATGGGCAGAGAAAGAGGGAAAGGCTCTTCCATTTTg > 1:542513/1‑250 (MQ=255) ggTTTATCCAGTTCCTTAATCAGCTTTTTTATGTTGCGGACGGAGCGCGGt < 1:408433/51‑1 (MQ=255) 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ggTTTATCCAGTTCCTTAATCAGCTTTTTTATGTTGCGGACGGAGCGCGGTTCATCCTGAATCAGCAACAAATTGCTACGATCGTCGAAAGTGATACTGCCGTTAGGCGACAACAGGGAACCACTCCCCCCGGTGAGGGATTTCATCACTTCCGACGCTTTGGCAAAGTGTAATTTAATGGTCGCCGTGTTCAGCTGTGCCGGTTCTTCCGCCATGGGCAGAGAAAGAGGGAAAGGCTCTTCCATTTTGc > 1:694710/1‑250 (MQ=255) aTCCAGTTCCTTAATCAGCTTTTTTATGTTGCGGACGGAGCGCGGTTCATCCTGAATCAGCAACAAATTGCTACGATCGTCGAAAGTGATACTGCCGTTAGGCGACAACAGGGAACCACTCCCCCCGGTGAGGGATTTCATCACTTCCGACGCTTTGGCAAAGTGTAATTTAATGGTCGCCGTGTTCAGCTGTGCCGGTTCTTCCGCCATGGGCAGAGAAAGAGGGAAAGGCTCTTCCATTTTGCCGGCaa > 1:76734/1‑251 (MQ=255) gTTCCTTAATCAGCTTTTTTATGTTGCGGACGGAGCGCGGTTCATCCTGAATCAGCAACAAATTGCTACGATCGTCGAAAGTGATACTGCCGTTAGGCGACAACAGGGAACCACTCCCCCCGGTGAGGGAt > 1:115300/1‑131 (MQ=255) | CGCCCGTTGATTTTCGCAACCTGTAACGCCACAGAGCCTGCCGGTGTCGTGGTCGTGGGAAAATTTACGTTTAACTGATTGACAAGGTTATCAAAGCCGTTGCCCGCCAAACTGCCACCGATACGATGGGCGTTGTCCGTCGGGCTGAAAATGCCCCAGCGCACGCCCAGTTCTTTCAGGCTTTCATCGTTAATGGTGACAATGCGCGCTTCAATGGCGATTTGCTCAAT‑GGGTTTATCCAGTTCATTAATCAGCTTTTTTATGTTGCGGACGGAGCGCGGTTCATCCTGAATCAGCAACAAATTGCTACGATCGTCGAAAGTGATACTGCCGTTAGGCGACAACAGGGAACCACTCCCCCCGGTGAGGGATTTCATCACTTCCGACGCTTTGGCAAAGTGTAATTTAATGGTCGCCGTGTTCAGCTGTGCCGGTTCTTCCGCCATGGGCAGAGAAAGAGGGAAAGGCTCTTCCATTTTGCCGGCAA > 2/7054‑7540 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |