| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 322,890 | T→C | V523V (GTA→GTG) | unknown ← | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 322,890 | 0 | T | C | 100.0% | 241.8 / NA | 88 | V523V (GTA→GTG) | unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (43/45); total (43/45) | |||||||||||
GTTTCCATGTGACGTAGAAATCGTTCACACCATAGCCAGGGCGTTTAGTGGTGGTTGAACCGCCACCACGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCTACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAGTTGAAGCCGACTTCCGTATTGCGTGACTTTTCAGGTTTAATATTGCCGGCAATGGA > 1/322646‑323132 | gTTTCCATGTGACGTAGAAATCGTTCACACCATAGCCAGGGCGTTTAGTGGTGGTTGAACCGCCACCACGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACAcc < 1:762815/250‑1 (MQ=255)gTTTCCATGTGACGTAGAAATCGTTCACACCATAGCCAGGGCGTTTAGTGGTGGTTGAACCGCCACCACGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCa > 1:311678/1‑251 (MQ=255) gACGTAGAAATCGTTCACACCATAGCCAGGGCGTTTAGTGGTGGTTGAACCGCCACCACGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTaa < 1:652751/249‑1 (MQ=255) aaaTCGTTCACACCATAGCCAGGGCGTTTAGTGGTGGTTGAACCGCCACCACGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAAcc < 1:853354/251‑1 (MQ=255) aaaTCGTACACACAATAGCCAGGGCGTTTAGTGGTGGTTGAACCGCCACCACGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAAc < 1:673068/250‑1 (MQ=255) cGTTCACACCATAGCCAGGGCGTTTAGTGGTGGTTGAACCGCCACCACGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCa > 1:294834/1‑251 (MQ=255) ttCACACCATAGCCAGGGCGTTTAGTGGTGGTTGAACCGCCACCACGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCata > 1:48053/1‑251 (MQ=255) cacCATAGCCAGGGCGTTTAGTGGTGGTTGAACCGCCACCACGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAAc < 1:406933/240‑1 (MQ=255) cacCATAGCCAGGGCGTTTAGTGGTGGTTGAACCGCCACCACGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTta > 1:241735/1‑251 (MQ=255) acCATAGCCAGGGCGTTTAGTGGTGGTTGAACCGCCACCACGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACAcc < 1:835955/222‑1 (MQ=255) aGCCAGGGCGTTTAGTGGTGGTTGAACCGCCACCACGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAg < 1:396817/228‑1 (MQ=255) tttAGTGGTGGTTGAACCGCCACCACGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAAtt < 1:271637/251‑1 (MQ=255) tttAGTGGTGGTTG‑ACCGCCACCACGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAAtt < 1:512046/250‑1 (MQ=255) gtggtgGTTGAACCGCCACCACGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAg > 1:476034/1‑205 (MQ=255) gtggtgGTTGAACCGCCACCACGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAAcc < 1:235381/221‑1 (MQ=255) gtggtTGAACCGCCACCACGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAAc < 1:687590/250‑1 (MQ=255) caccacGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAAc < 1:190902/251‑1 (MQ=255) caccacGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAAc < 1:201888/251‑1 (MQ=255) acGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCatat < 1:545863/208‑1 (MQ=255) cGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCatat < 1:344611/207‑1 (MQ=255) cGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTAc > 1:257767/1‑250 (MQ=255) ttCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCAtt > 1:175189/1‑251 (MQ=255) tGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAAtt < 1:130634/251‑1 (MQ=255) gTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAAttt > 1:67705/1‑250 (MQ=255) aTAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAAt < 1:865397/251‑1 (MQ=255) cTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGc > 1:703459/1‑191 (MQ=255) cTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTaa < 1:652473/207‑1 (MQ=255) cTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTtctc < 1:832065/219‑1 (MQ=255) cTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAAc > 1:22236/1‑250 (MQ=255) cTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAAc > 1:765783/1‑250 (MQ=255) cTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAAc > 1:217256/1‑250 (MQ=255) gCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTa > 1:858856/1‑251 (MQ=255) gCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTa > 1:725393/1‑251 (MQ=255) gTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTAcc > 1:900561/1‑217 (MQ=255) tACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAAttt < 1:851238/251‑1 (MQ=255) tACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAAtt < 1:759322/250‑1 (MQ=255) tACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAAtt < 1:204362/250‑1 (MQ=255) ctctCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAAcgcg > 1:154537/1‑251 (MQ=255) ctcCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGt < 1:181416/146‑1 (MQ=255) ctcCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTg > 1:629269/1‑251 (MQ=255) ctcCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTg > 1:406822/1‑251 (MQ=255) gCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGt > 1:255377/1‑141 (MQ=255) cAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATcc < 1:707865/251‑1 (MQ=255) aTTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTAt > 1:566152/1‑247 (MQ=255) tCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGTATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAAt < 1:733232/251‑1 (MQ=255) tCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGAACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAAt < 1:581427/251‑1 (MQ=255) ggTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCAc < 1:57336/118‑1 (MQ=255) gttCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGc < 1:245870/142‑1 (MQ=255) gttCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAAtt > 1:69017/1‑212 (MQ=255) gttCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGaaa > 1:886805/1‑251 (MQ=255) gCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGc < 1:196295/135‑1 (MQ=255) gTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAAtt > 1:130818/1‑143 (MQ=255) aGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTa > 1:480803/1‑251 (MQ=255) tACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAAt > 1:294556/1‑250 (MQ=255) tACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATg < 1:888676/251‑1 (MQ=255) cGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAgg < 1:682550/251‑1 (MQ=255) gtCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGa > 1:605304/1‑242 (MQ=255) ccAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCgg > 1:530670/1‑251 (MQ=255) aCCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTtat < 1:492592/251‑1 (MQ=255) cAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCCGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCtg > 1:432321/1‑169 (MQ=255) cAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAg < 1:109869/251‑1 (MQ=255) cAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAg > 1:457014/1‑251 (MQ=255) cAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAg < 1:657579/251‑1 (MQ=255) cAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGCTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAg < 1:446827/251‑1 (MQ=255) cAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAGTTGAAGCCGa > 1:193106/1‑249 (MQ=255) gTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTtat > 1:433860/1‑235 (MQ=255) gTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAGTTGAAGCCGACtt > 1:443411/1‑250 (MQ=255) aCCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAGTTGAAGCCGACTTCCGt < 1:553494/251‑1 (MQ=255) ccGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAAttt > 1:211009/1‑156 (MQ=255) ccGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAGTTGAAGCCGACTTCCGTa > 1:378378/1‑251 (MQ=255) cGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAGTTGAAGCCGACTTCCGTAt < 1:872571/251‑1 (MQ=255) cGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAGTTGAAGCCGACTTCCGTAt < 1:796091/251‑1 (MQ=255) tACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCt > 1:4298/1‑196 (MQ=255) gTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAGTTGAAGCCGACTTCCGTATTGCGTg > 1:144554/1‑251 (MQ=255) gTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAGTTGAAGCCGACTTCCGTATTGCGTGACtttt > 1:522903/1‑250 (MQ=255) cTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAGTTGAAGCCGACTTCCGTATTGCGTGACTTTTCAgg < 1:85019/251‑1 (MQ=255) gCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCg > 1:386543/1‑79 (MQ=255) tAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAGTTGAAGCCGACTTCCGTATTGCGTGACTTTTCAGGTTTAatat < 1:81925/251‑1 (MQ=255) tAATTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAGTTGAAGCCGACTTCCGTATTGCGTGACTTTTCAGGTTTAatat < 1:198622/251‑1 (MQ=255) aTTCAGGCTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAg > 1:849312/1‑206 (MQ=255) cTTGCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAGTTGAAGCCGACTTCCGTATTGCGTGACTTTTCAGGTTTAATATTGCCGGCaa > 1:250472/1‑251 (MQ=255) gCTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAGTTGAAGCCGACTTCCGTATTg > 1:388756/1‑217 (MQ=255) cTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGc < 1:478195/47‑1 (MQ=255) cTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTg > 1:844808/1‑131 (MQ=255) cTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGt < 1:200611/134‑1 (MQ=255) cTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAGTTGAAGCCGACTTCCGTAt < 1:359942/214‑1 (MQ=255) cTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAGTTGAAGCCGACTTCCGTATTGCGTGACTTTTCAGGTTTAATATTGCCGGCAATgg < 1:505858/250‑1 (MQ=255) cTATAGGCCACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAGTTGAAGCCGACTTCCGTATTGCGTGACTTTTCAGGTTTAATATTGCCGGCAATGGa > 1:296866/1‑251 (MQ=255) | GTTTCCATGTGACGTAGAAATCGTTCACACCATAGCCAGGGCGTTTAGTGGTGGTTGAACCGCCACCACGGTTATTCGTGCTGGTATCATAACTCGTATGCTGTACGAAACGTCCTCTCCAGCCAATTTCCACATCAGGTTGTTCAAAGCGGTAAGATACGCCGGTGGTCCAAGTACGACCAATTGGAATGGCAGTAACCGTACTGTCGACGGTTCTGCCATCTAATTCAGGCTTGCTATAGGCTACACCAGCACGTAAAGTTAAACCTTCATATTTATATGCCGCACCTAATTCGTAACCGCTATTTCTCAACTTACCTGCATTTTGAATTTCAAAATAACCCGGTCTAATTTGAGTGAACGCGTGAGTATCCTGAATCGTTTGCCAGAAATAGCTACCGTTTAATGAAAGGCTATCGGCTAATTTATAGTTGAAGCCGACTTCCGTATTGCGTGACTTTTCAGGTTTAATATTGCCGGCAATGGA > 1/322646‑323132 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |