| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 2 | 2,959 | T→C | A9A (GCA→GCG) | unknown ← | Excinuclease ABC subunit A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 2 | 2,959 | 0 | T | C | 100.0% | 262.7 / NA | 96 | A9A (GCA→GCG) | unknown | Excinuclease ABC subunit A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (44/52); total (44/52) | |||||||||||
GATTTTTGCTCAATGGAAATCGCCGGTGAAAGCCCTTCAATGTGGTCCACATCAGGCTTTTCCATTAATGACAGAAACTGGCGCGCATAGGCAGAAAGGGATTCCACATAACGGCGTTGTCCTTCCGCATACAGGGTATCAAACGCCAGCGAAGACTTGCCCGAACCGGATAAACCGGTGATAACGATAAGTTTGTCGCGTGGAATGGTTAAGTTAATATTTTTCAGATTGTGGGTTCGTGCCCCACGAATGTCGATGGTATCCATAATAGATTTTATAAATGAAAGAAGTGTAAATTTGCGATAATTATCGCATATTCTTAAATAACTGTGCAAATATCCAGTTAATTTTGTTGAAAGCGTGGATTTCTTTCTGATTTTCAGGCAGAATAAGGCAAATTTTTTACAGCAAAATCGAATAAAAGAAGAGGATATTATGGCTGGAGTAAATAAAGTGATTATTGTCGGTAATTTAGGTAACGATC > 2/2720‑3203 | gATTTTTGCTCAATGGAAATCGCCGGTGAAAGCCCTTCAATGTGGTCCACATCAGGCTTTTCCATTAATGACAGAAACTGGCGCGCATAGGCAGAAAGGGATTCCACATAACGGCGTTGTCCTTCCGCATACAGGGTATCAAACGCCAGCGAAGACTTGCCCGAACCGGATAAACCGGTGATAACGATAAGTTTGTCGCGCGGAATGGTTAAGTTAATATTTTTCAGATTGTGGGTTCGCGCCCCACGaa < 1:744162/250‑1 (MQ=255)gATTTTTGCTCAATGGAAATCGCCGGTGAAAGCCCTTCAATGTGGTCCACATCAGGCTTTTCCATTAATGACAGAAACTGGCGCGCATAGGCAGAAAGGGATTCCACATAACGGCGTTGTCCTTCCGCATACAGGGTATCAAACGCCAGCGAAGACTTGCCCGAACCGGATAAACCGGTGATAACGATAAGTTTGTCGCGCGGAATGGTTAAGTTAATATTTTTCAGATTGTGGGTTCGCGCCCCACGaa < 1:715105/250‑1 (MQ=255) aTGGAAATCGCCGGTGAAAGCCCTTCAATGTGGTCCACATCAGGCTTTTCCATTAATGACAGAAACTGGCGCGCATAGGCAGAAAGGGATTCCACATAACGGCGTTGTCCTTCCGCATACAGGGTATCAAACGCCAGCGAAGACTTGCCCGAACCGGATAAACCGGTGATAACGATAAGTTTGTCGCGCGGAATGGTTAAGTTAATATTTTTCAGATTGTGGGTTCGCGCCCCACGAATGTCGATGGTAt > 1:861539/1‑250 (MQ=255) tGGAAATCGCCGGTGAAAGCCCTTCAATGTGGTCCACATCAGGCTTTTCCATTAATGACAGAAACTGGCGCGCATAGGCAGAAAGGGATTCCACATAACGGCGTTGTCCTTCCGCATACAGGGTATCAAACGCCAGCGAAGACTTGCCCGAACCGGATAAACCGGTGATAACGATAAGTTTGTCGCGCGGAATGGTTAAGTTAATATTTTTCAGATTGTGGGCTCGCGCCCCACGAATGTCGATGGTATcc < 1:773980/251‑1 (MQ=255) 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gAATGGTTAAGTTAATATTTTTCAGATTGTGGGTTCGCGCCCCACGAATGTCGATGGTATCCATAATAGATTTTATAAATGAAAGAAGTGTAAATTTGCGATAATTATCGCATATTCTTAAATAACTGTGCAAATATCCAGTTAATTTTGTTGAAAGCGTGGATTTCTTTCTGATTTTCAGGCAGAATAAGGCAAATTTTTTACAGCAAAATCGAATAAAAGAAGAGGATATTATGGCTGGAGtaaataaa > 1:823688/1‑251 (MQ=255) gAATGGTTAAGTTAATATTTTTCAGATTGTGGGTTCGCGCCCCACGAATGTCGATGGTATCCATAATAGATTTTATAAATGAAAGAAGTGTAAATTTGCGATAATTATCGCATATTCTTAAATAACTGTGCAAATATCCAGTTAATTTTGTTGAAAGCGTGGATTTCTTTCTGATTTTCAGGCAGAATAAGGCAAATTTTTTACAGCAAAATCGAATAAAAGAAGAGGATATTATGGCTGGAGtaaat < 1:386506/248‑1 (MQ=255) aaTGGTTAAGTTAATATTTTTCAGATTGTGGGTTCGCGCCCCACGAATGTCGATGGTATCCATAATAGATTTTATAAATGAAAGAAGTGTAAATTTGCGATAATTATCGCATATTCTTAAATAACTGTGCAAATATCCAGTTAATTTTGTTGAAAGCGTGGATTTCTTTCTGATTTTCAGGCAGAATAAGGCAAATTTTTTACAGCAAAATCGAATAAAAGAAGAGGATATTATGGCTGGAGTAAATAAAg < 1:760158/251‑1 (MQ=255) 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GATTTTTGCTCAATGGAAATCGCCGGTGAAAGCCCTTCAATGTGGTCCACATCAGGCTTTTCCATTAATGACAGAAACTGGCGCGCATAGGCAGAAAGGGATTCCACATAACGGCGTTGTCCTTCCGCATACAGGGTATCAAACGCCAGCGAAGACTTGCCCGAACCGGATAAACCGGTGATAACGATAAGTTTGTCGCGTGGAATGGTTAAGTTAATATTTTTCAGATTGTGGGTTCGTGCCCCACGAATGTCGATGGTATCCATAATAGATTTTATAAATGAAAGAAGTGTAAATTTGCGATAATTATCGCATATTCTTAAATAACTGTGCAAATATCCAGTTAATTTTGTTGAAAGCGTGGATTTCTTTCTGATTTTCAGGCAGAATAAGGCAAATTTTTTACAGCAAAATCGAATAAAAGAAGAGGATATTATGGCTGGAGTAAATAAAGTGATTATTGTCGGTAATTTAGGTAACGATC > 2/2720‑3203 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |