| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 2 | 125 | G→T | intergenic (‑43/+29) | unknown ← / ← unknown | hypothetical protein/Excinuclease ABC subunit A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 2 | 125 | 0 | G | T | 100.0% | 227.0 / NA | 83 | intergenic (‑43/+29) | unknown/unknown | hypothetical protein/Excinuclease ABC subunit A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (32/51); total (32/51) | |||||||||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTTCGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAGTTTTTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTCGGAAAATGCAGCGTTTTTAGCCTTTTGCCAAAATCTCTTTGAGGAAGCGGGCGGTGTGCGAGCCCTCCATTTTGGCAACCTGTTCCGGTGTGCCGGTCGCGATAATTTGTCCGCCGCCGCTGCCGCCTTCAGGGCCGAGATCTACAATCCAGTCGGCGGTTTTAATCACGTCTAAATTATGCTCAATGACCACGATGGTGTTGCCTTGATCGCGTAAACGGTGTAACAC > 2/1‑366 | ctattttagggcgttgagggtttatataaggggattttacgccattaagccctctttcacgaaaggcttttccaataaatgacttgagaacgagaaatctgatgaagtttcgccacctcacggataccaaaatcctgctcggtgacctgtttgatagtttttaaacgaaattggtaagagtaagacataatctgcacctcaaattaggtgtccGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCAAAGTg < 1:516002‑M2/31‑1 (MQ=255) attttagggcgttgagggtttatataaggggattttacgccattaagccctctttcacgaaaggcttttccaataaatgacttgagaacgagaaatctgatgaagtttcgccacctcacggataccaaaatcctgctcggtgacctgtttgatagtttttaaacgaaattggtaagagtaagacataatctgcacctcaaattaggtgtccGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCAAAGTGCGGTCGGaa > 1:828780‑M2/212‑251 (MQ=255) attttagggcgttgagggtttatataaggggattttacgccattaagccctctttcacgaaaggcttttccaataaatgacttgagaacgagaaatctgatgaagtttcgccacctcacggataccaaaatcctgctcggtgacctgtttgatagtttttaaacgaaattggtaagagtaagacataatctgcacctcaaattaggtgtccGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCAAAGTGCGGTCGGaa > 1:185103‑M2/212‑251 (MQ=255) gggtttatataaggggattttacgccattaagccctctttcacgaaaggcttttccaataaatgacttgagaacgagaaatctgatgaagtttcgccacctcacggataccaaaatcctgctcggtgacctgtttgatagtttttaaacgaaattggtaagagtaagacataatctgcacctcaaattaggtgtccGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCAAAGTg > 1:9422‑M2/197‑227 (MQ=255) 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTTCGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAGTTTTTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTCGGAAAATGCAGCGTTTTTAGCCTTTTGCCAAAATCTCTTTGAGGAAGCGGGCGGTGTGCGAGCCCTCCATTTTGGCAACCTGTTCCGGTGTGCCGGTCGCGATAATTTGTCCGCCGCCGCTGCCGCCTTCAGGGCCGAGATCTACAATCCAGTCGGCGGTTTTAATCACGTCTAAATTATGCTCAATGACCACGATGGTGTTGCCTTGATCGCGTAAACGGTGTAACAC > 2/1‑366 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |