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gaatgaatTTGAGACGTAAACAACAAAAAGTGCGGTCGAATTTCCAGATGTTTTTTAGCTGTGAATCAAGAAAAATAACAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACCCTATAAGGGCCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAgg > 1:461475/1‑202 (MQ=255) gaatTTGAGACGTAAACAACAAAAAGTGCGGTCGAATTTCCAGATGTTTTTTAGCTGTGAATCAAGAAAAATAACAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACCCTATAAGGGCCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACata < 1:642302/208‑1 (MQ=255) aatTTGAGACGTAAACAACAAAAAGTGCGGTCGAATTTCCAGATGTTTTTTAGCTGTGAATCAAGAAAAATAACAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACCCTATAAGGGCCTAGTACTTCACATGcc < 1:475590/136‑1 (MQ=255) agaCGTAAACAACAAAAAGTGCGGTCGAATTTCCAGATGTTTTTTAGCTGTGAATCAAGAAAAATAACAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACCCTATAAGGGCCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATTCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTc < 1:404344/250‑1 (MQ=255) 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1:704376/1‑234 (MQ=255) gTTTTTTAGCTGTGAATCAAGAAAAATAACAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACCCTATAAGGGCCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCCTAAAGGGGTCCACATATTCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATACTCCTACACTACCTTTGTAt < 1:705038/240‑1 (MQ=255) ttttttAGCTGTGAATCAAGAAAAATAACAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACCCTATAAGGGCCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGAc < 1:163679/138‑1 (MQ=255) ttttAGCTGTGAATCAAGAAAAATAACAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACCCTATAAGGGCCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACGTATTCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATAc < 1:649152/218‑1 (MQ=255) gCTGTGAATCAAGAAAAATAACAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACCCTATAAGGGCCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATTCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTcc < 1:728366/198‑1 (MQ=255) gtgAATCAAGAAAAATAACAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACCCTATaa > 1:168824/1‑60 (MQ=255) cAAGAAAAATAACAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACCCTATAAGGGCCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATTCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATACTCCTACACTACCTTTGTATTTAGCCCTACCGTGCTTACATAATAGcc < 1:719766/251‑1 (MQ=17) cAAGAAAAATAACAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACCCTATAAGGGCCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATTCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATACTCCTACACTACCTTTGTATTTAGCCCTACCGTGCTTACATAATAGcc < 1:262100/251‑1 (MQ=17) atcataaaaTAACAATCCGCACGTAAAACGTGCAGTTTTTAGGCTACTCTATAAAGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATTCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATACTCCTACACTACCTTTGTATTTAGCCCTACCGTGCTTACATAATAGcc < 1:203148/246‑1 (MQ=2) gAAAAATAACAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACCCTATAAGGGCCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCaacaac < 1:114875/100‑1 (MQ=255) | TATTAGTGCTCCGTTAAATTAAAAAACCACCCTTGCGGGACGAACCTACCCATAATGGATAGAGTGCGGATTCTAGCACAAAAAACATAACGAAAGCAATAAGCTTTTAAATAACTTATACGCTTTCATGAAAAGAATGAATTTGAGACGTAAACAACAAAAAGTGCGGTCGAATTTCCAGATGTTTTTTAGCTGTGAATCAAGAAAAATAACAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATTCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATACTCCTACACTACCTTTGTATTTAGCCCTACCGTGCTTACATAATAGCC > 1/1656684‑1657134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |