| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,652,411 | T→C | S73G (AGC→GGC) | unknown ← | Protein translocase subunit SecY |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,652,411 | 0 | T | C | 100.0% | 197.4 / NA | 71 | S73G (AGC→GGC) | unknown | Protein translocase subunit SecY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (35/36); total (35/36) | |||||||||||
AATCCCAAATTAGGAACCAAGCCAGGTAACATATTAGGCAAGCCAGTTGAAATACCTACCGCCTGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCTCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTAAAACAAATAACAATCTGCTCTTTAGCTCACTTGTACCACCTTGAGTACTTCTTGTTTGATAGCCTGGTTGTTTAGCCATTAATTATTCCTCGATTGAA > 1/1652173‑1652646 | aaTCCCAAATTAGGAACCAAGCCAGGTAACATATTAGGCAAGCCAGTTGAAATACCTACCGCCTGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGcaccac < 1:541136/250‑1 (MQ=255)aaTCCCAAATTAGGAACCAAGCCAGGTAACATATTAGGCAAGCCAGTTGAAATACCTACCGCCTGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGcaccac > 1:56367/1‑250 (MQ=255)aaTCCCAAATTAGGAACCAAGCCAGGTAACATATTAGGCAAGCCAGTTGAAATACCTACCGCCTGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGcaccac < 1:65468/250‑1 (MQ=255) aaTTAGGAACCAAGCCAGGTAACATATTAGGCAAGCCAGTTGAAATACCTACCGCCTGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAAc < 1:436763/251‑1 (MQ=255) ccAAGCCAGGTAACATATTAGGCAAGCCAGTTGAAATACCTACCGCCTGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAAc < 1:794686/251‑1 (MQ=255) ccAAGCCAGGTAACATATTAGGCAAGCCAGTTGAAATACCTACCGCCTGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAAc < 1:199021/251‑1 (MQ=255) aGGTAACATATTAGGCAAGCCAGTTGAAATACCTACCGCCTGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCaa > 1:257117/1‑251 (MQ=255) ggTAACATATTAGGCAAGCCAGTTGAAATACCTACCGCCTGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAAc > 1:436664/1‑234 (MQ=255) ggTAACATATTAGGCAAGCCAGTTGAAATACCTACCGCCTGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAAc < 1:81156/243‑1 (MQ=255) gTAACATATTAGGCAAGCCAGTTGAAATACCTACCGCCTGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAAc < 1:668970/242‑1 (MQ=255) cATATTAGGCAAGCCAGTTGAAATACCTACCGCCTGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAAc < 1:898897/229‑1 (MQ=255) atatTAGGCAAGCCAGTTGAAATACCTACCGCCTGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCagag > 1:709648/1‑225 (MQ=255) atatTAGGCAAGCCAGTTGAAATACCTACCGCCTGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGt > 1:34173/1‑251 (MQ=255) aGGCAAGCCAGTTGAAATACCTACCGCCTGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCtt > 1:680663/1‑251 (MQ=255) aGCCAGTTGAAATACCTACCGCCTGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTttgt > 1:602143/1‑251 (MQ=255) cGCCTGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAatga > 1:755412/1‑218 (MQ=255) cGCCTGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTa > 1:399381/1‑251 (MQ=255) ccTGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAAc < 1:86119/206‑1 (MQ=255) tGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATAc < 1:762369/251‑1 (MQ=255) gTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACa > 1:274267/1‑195 (MQ=255) gTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAatga > 1:673085/1‑208 (MQ=255) gcaCAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAGTTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAAc < 1:336197/191‑1 (MQ=255) cacaACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATAc < 1:645546/251‑1 (MQ=255) cacaACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATAc < 1:513513/251‑1 (MQ=255) cacaACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATAc < 1:132795/251‑1 (MQ=255) ccGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAAc < 1:571502/176‑1 (MQ=255) ccGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAatgat > 1:272050/1‑196 (MQ=255) aTAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGgaa < 1:665940/251‑1 (MQ=255) aaCGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGgaatg < 1:506205/251‑1 (MQ=255) ggTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTaa < 1:64707/170‑1 (MQ=255) gTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACATTTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACTACCAGAGAACATATTAAACATATCAatga > 1:549337/1‑181 (MQ=255) gTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAGGCCCGGCCCAACGCACCGCCAGAGAACATATTAAACAGATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGaatgaatg < 1:577099/250‑1 (MQ=255) gTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAAc > 1:582812/1‑171 (MQ=255) atatTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATAc > 1:461225/1‑216 (MQ=255) ttACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGa > 1:347057/1‑231 (MQ=255) ttACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAAt > 1:445871/1‑251 (MQ=255) ttACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAAt > 1:350441/1‑251 (MQ=255) tACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAAtt > 1:736974/1‑251 (MQ=255) aTCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATAtt > 1:381478/1‑155 (MQ=255) aTCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGaa > 1:500568/1‑251 (MQ=255) tCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGc < 1:168907/136‑1 (MQ=255) tCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATAc < 1:270803/205‑1 (MQ=255) tCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGaaa > 1:350964/1‑251 (MQ=255) acCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTg > 1:207253/1‑251 (MQ=255) gACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATAc < 1:675036/191‑1 (MQ=255) tcttttcttAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATAc < 1:304167/196‑1 (MQ=255) tttcttAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATgg < 1:607795/145‑1 (MQ=255) tttcttAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTAAAACAAATaa > 1:402643/1‑251 (MQ=255) aCCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTAAAACAAATAACAATCTGCTCTTTAGCTCACTTGTac > 1:592413/1‑250 (MQ=255) gCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGc < 1:438712/140‑1 (MQ=255) cAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTAAAACAAATAACAATCTGCTCTTTAGCTCACTTGTACCACCTTGAGTAc < 1:205891/251‑1 (MQ=255) ttGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTAAAACAAATAACAATCTGCTCTTTAGCTCACTTGTACCACCTTGAGTActtc < 1:332580/251‑1 (MQ=255) ggATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGACCCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTAAAACAAATAACAATCTGCTCTTTAGCTCACTTGTACCACCTTGAGTActtctt > 1:450112/1‑251 (MQ=255) gATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCaccacc < 1:76558/72‑1 (MQ=255) taatTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTAAAACAAATAACAATCTGCTCTTTAGCTCACTTGTac > 1:739183/1‑228 (MQ=255) atatAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTAAAACAAATAAc > 1:216781/1‑189 (MQ=255) atatAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTAAAACAAATAACAATCTGCTCTTTAGCTCACTTGTACCACCTTGAGt > 1:577203/1‑224 (MQ=255) atatAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTAAAACAAATAACAATCTGCTCTTTAGCTCACTTGTACCACCTTGAGTACTTCTTGTTTGATAGCCTGGTTGttt < 1:2678/251‑1 (MQ=255) ataAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATAc < 1:720763/114‑1 (MQ=255) gCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAg < 1:801871/126‑1 (MQ=255) gCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTg < 1:416714/165‑1 (MQ=255) gCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTACAACAAATAACAATCTGCTCTTTAGCTCACTTGTACCACCTTGAGTACTTCTTGTTTGATAGCCTGGTTGTTTAGCCatt > 1:480313/1‑251 (MQ=255) gCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTAAAACAAATAAc < 1:200681/182‑1 (MQ=255) gCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTAAAACAAATAACAATCTGCTCTTTAGCTCACTTGTACCACCTTGAGTACTTCTTGTTTGATAGCCTGGTTGTTTAGCCatt > 1:18972/1‑251 (MQ=255) ataataCCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTAAAACAAATAACAATCTGCTCTTTAGCTCACTTGTac < 1:728487/205‑1 (MQ=255) ataataCCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTAAAACAAATAACAATCTGCTCTTTAGCTCACTTGTACCACCTTGAGTACTTCTTGTTTGATAGCCTGGTTGTTTAGCCattaa > 1:611214/1‑251 (MQ=255) taataCCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTAAAACAAATAACAATCTGCTCTTTAGCTCACTTGTACCACCTTGAGTACTTCTTGTTTGATAGCCTGGTTGTTTAGCCattaat < 1:710964/251‑1 (MQ=255) ataCCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTAAAACAAATAACAATc > 1:667894/1‑181 (MQ=255) gcgcAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTAAAAc < 1:370122/163‑1 (MQ=255) gcgcAAAAATTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTAAAACAAATAACAATCTGCTCTTTAGCTCACTTGTACCACCTTGAGTACTTCTTGTTTGATAGCCTGGTTGTTTAGCCATTAATTATTCCTCg > 1:147557/1‑251 (MQ=255) aaTTGAAGCCCGGCCCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTAAAACAAATAACAATCTGCTCTTTAGCTCACTTGTACCACCTTGAGTACTTCTTGTTTGATAGCCTGGTTGTTTAGCCATTAATTATTCCTCGATTGaa > 1:129691/1‑250 (MQ=255) | AATCCCAAATTAGGAACCAAGCCAGGTAACATATTAGGCAAGCCAGTTGAAATACCTACCGCCTGTAGAGTAGCAAGCACAACCGTTGAATAACGGGTATATTTACTAATCTTACGACGACCTGACTCACCTTCTTTTCTTAATTCCGCAAGTGCCGGATGAACCGAAGCTAACAATTGGATAATAATTGATGCCGAAATATAAGGCATAATACCAAGCGCAAAAATTGAAGCCCGGCTCAACGCACCACCAGAGAACATATTAAACATATCAATGATGGTGCCTTTTTGTTGTTCAATCAACTGAGCTAATACAGCCGCGTCTATACCAGGAACCGGAATGAATGAACCAATTCGGAAAACAATAAGTGCACCTAAAACAAATAACAATCTGCTCTTTAGCTCACTTGTACCACCTTGAGTACTTCTTGTTTGATAGCCTGGTTGTTTAGCCATTAATTATTCCTCGATTGAA > 1/1652173‑1652646 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |