| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,648,141 | C→A | intergenic (+108/+20) | unknown → / ← unknown | hypothetical protein/LSU ribosomal protein L17p |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,648,141 | 0 | C | A | 100.0% | 170.8 / NA | 65 | intergenic (+108/+20) | unknown/unknown | hypothetical protein/LSU ribosomal protein L17p |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (36/29); total (36/29) | |||||||||||
CAATGTGGTACTTACAGTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAACCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGTTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTGTTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAATAAAAAGGCTGAATAAATGTTATTCAGCCTTTTTAACTCTAACAGTTAACTAGTTTTTATTCCGCTGTAGCTTCTTTACTTGAAACTTCTGGACGATCTACTAACTCAATGTAAGCCATTGGAGCATTATCGCCAGCACGGAAACCACATTTAAGGATGCGGGTGTAGCCACCAGCACGTTGTGCAAAACGTGGACCTAATTCATTAAATAATTTAGCAACAGTTTCTGTGTTGCGTGTACGAGCAAAAGCTAGGCGGCGATTTGCCACACTATCTACTTT > 1/1647894‑1648385 | cgaTGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTC‑TTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTGTTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAATAAAAAGGCTGAATAAATGTTATTCAGCCTTTTTAAATCTa > 1:530057/3‑251 (MQ=14) 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cTTTTTAAATCTAACAGTTAACTAGTTTTTATTCCGCTGTAGCTTCTTTACTTGAAACTTCTGGACGATCTACTAACTCAATGTAAGCCATTGGAGCATTATCGCCAGCACGGAAACCACATTTAAGGATGCGGGTGTAGCCACCAGCACGTTGTGCAAAACGTGGACCTAATTCATTAAATAATTTAGCAACAGTTTCTGTGTTGCGTGTACGAGCAAAAGCTAGGCGGCGATTTGCCACACTATCCACt < 1:664552/251‑1 (MQ=255) ttttAAATCTAACAGTTAACTAGTTTTTATTCCGCTGTAGCTTCTTTACTTGAAACTTCTGGACGATCTACTAACTCAATGTAAGCCATTGGAGCATTATCGCCAGCACGGAAACCACATTTAAGGATGCGGGTGTAGCCACCAGCACGTTGTGCAAAACGTGGACCTAATTCATTAAATAATTTAGCAACAGTTTCTGTGTTGCGTGTACGAGCAAAAGCTAGGCGGCGATTTGCCACACTATCTACttt > 1:421981/1‑251 (MQ=255) ttttAAATCTAACAGTTAACTAGTTTTTATTCCGCTGTAGCTTCTTTACTTGAAACTTCTGGACGATCTACTAACTCAATGTAAGCCATTGGAGCATTATCGCCAGCACGGAAACCACATTTAAGGATGCGGGTGTAGCCACCAGCACGTTGTGCAAAACGTGGACCTAATTCATTAAATAATTTAGCAACAGTTTCTGTGTTGCGTGTACGAGCAAAAGCTAGGCGGCGATTTGCCACACTATCTACttt < 1:323009/251‑1 (MQ=255) | CAATGTGGTACTTACAGTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAACCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGTTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTGTTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAATAAAAAGGCTGAATAAATGTTATTCAGCCTTTTTAACTCTAACAGTTAACTAGTTTTTATTCCGCTGTAGCTTCTTTACTTGAAACTTCTGGACGATCTACTAACTCAATGTAAGCCATTGGAGCATTATCGCCAGCACGGAAACCACATTTAAGGATGCGGGTGTAGCCACCAGCACGTTGTGCAAAACGTGGACCTAATTCATTAAATAATTTAGCAACAGTTTCTGTGTTGCGTGTACGAGCAAAAGCTAGGCGGCGATTTGCCACACTATCTACTTT > 1/1647894‑1648385 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |