| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,646,025 | C→A | A39E (GCG→GAG) | unknown → | Tyrosine‑specific transport protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,646,025 | 0 | C | A | 100.0% | 119.0 / NA | 43 | A39E (GCG→GAG) | unknown | Tyrosine‑specific transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (26/17); total (26/17) | |||||||||||
TAAAATTCACTTTCCATTTAAAAAACGCTCTCAAAAAAGACCGCACTTTATAACAAAATCGGCGCATTAGCACTTAATCTCCGACGACTTTATGCGATAATACCAGCCTACTTTATTTAGGATTAATGTATGTTATTAAAAAATAAAACCTTCGGCAGCGCCTTAATTATCGCCGGAACCGCCATTGGTGCCGGAATGCTCGCCATGCCGTTAACCTCCGCCGGCATGGGATTCGCCTTTACCGCGGCACTTCTCATCGGACTTTGGTTACTCCTTGCTTACAGTGGACTACTTTTCGTTGAAGTTTATCAAACTGCCAAACGCAAAGATGATGGCGTAGCAACCTTGGCGGAAAAATATTTCGGTATTCCCGGACGTATTATTTCAACACTCTCACTTTTCATTTTGTTATATGCATTATCAGCCGCCTACATGGCCGGTGGTGGTACTTTACTTGCAAACGCCCTGCCGAAAGATTTCTTAGGT > 1/1645781‑1646266 | taaAATTCACTTTCCATTTAAAAAACGCTCTCAAAAAAGACCGCACTTTATAACAAAATCGGCGCATTAGCACTTAATCTCCGACGACTTTATGCGATAATACCAGCCTACTTTATTTAGGATTAATGTATGTTATTAAAAAATAAAACCTTCGGCAGCGCCTTAATTATCGCCGGAACCGCCATTGGTGCCGGAATGCTCGCCATGCCGTTAACCTCCGCCGGCATGGGATTCGCCTTTACCGAGGCa > 1:801297/1‑249 (MQ=255) cAAAAAAGACCGCACTTTATAACAAAATCGGCGCATTAGCACTTAATCTCCGACGACTTTATGCGATAATACCAGCCTACTTTATTTAGGATTAATGTATGTTATTAAAAAATAAAACCTTCGGCAGCGCCTTAATTATCGCCGGAACCGCCATTGGTGCCGGAATGCTCGCCATGCCGTTAACCTCCGCCGGCATGGGATTCGCCTTTACCGAGGCACTTCTCATCGGACTTTGGTTACTc > 1:27902/1‑242 (MQ=255) cTTTATAACAAAATCGGCGCATTAGCACTTAATCTCCGACGACTTTATGCGATAATACCAGCCTACTTTATTTAGGATTAATGTATGTTATTAAAAAATAAAACCTTCGGCAGCGCCTTAATTATCGCCGGAACCGCCATTGGTGCCGGAATGCTCGCCATGCCGTTAACCTCCGCCGGCATGGGATTCGCCTTTACCGAGGCACTTCTCATCGGACTTTGGTTACTCCTTGCTTACAGTGGACTACtttt > 1:864763/1‑251 (MQ=255) ttATAACAAAATCGGCGCATTAGCACTTAATCTCCGACGACTTTATGCGATAATACCAGCCTACTTTATTTAGGATTAATGTATGTTATTAAAAAATAAAACCTTCGGCAGCGCCTTAATTATCGCCGGAACCGCCATTGGTGCCGGAATGCTCGCCATGCCGTTAACCTCCGCCGGCATGGGATTCGCCTTTACCGAGGCACTTCTCATCGGACTTTGGTTACTc > 1:233317/1‑226 (MQ=255) tttAATCTCCGACGACTTTATGCGATAATCCCACCCTACTTTATTTAGGATTAATGTATTTTATTAAAAAATAAACCCTTCGGCAGCGCCTTAATTACCGCCGGAACCGCCATTGGTGCCGGAATGCTCGCCATGCCGTTAACCTCCGCCGGCATGGGATTCGCCTTTACCGAGGCACTTCTCATCGGACTTTGGTTACTc < 1:822253/200‑1 (MQ=255) cGATAATACCAGCCTACTTTATTTAGGATTAATGTATGTTATTAAAAAATAAAACCTTCGGCAGCGCCTTAATTATCGCCGGAACCGCCATTGGTGCCGGAATGCTCGCCATGCCGTTAACCTCCGCCGGCATGGGATTCGCCTTTACCGAGGCACTTCTCATCGGACTTTGGTTACTCCTTGCTTACAGTGGACTACTTTTCGTTGAAGTTTATCAAACTGCCAAACGCAAAGATGATGGc > 1:348393/1‑242 (MQ=255) cGATAATACCAGCCTACTTTATTTAGGATTAATGTATGTTATTAAAAAATAAAACCTTCGGCAGCGCCTTAATTATCGCCGGAACCGCCATTGGTGCCGGAATGCTCGCCATGCCGTTAACCTCCGCCGGCATGGGATTCGCCTTTACCGAGGCACTTCTCATCGGACTTTGGTTACTCCTTGCTTACAGTGGACTACTTTTCGTTGAAGTTTATCAAACTGCCAAACGCAAAGATGATGGCGTAGCAAc > 1:577101/1‑250 (MQ=255) gATAATACCAGCCTACTTTATTTAGGATTAATGTATGTTATTAAAAAATAAAACCTTCGGCAGCGCCTTAATTATCGCCGGAACCGCCATTGGTGCCGGAATGCTCGCCATGCCGTTAACCTCCGCCGGCATGGGATTCGCCTTTACCGAGGCACTTCTCATCGGACTTTGGTTACTCCTTGCTTACAg > 1:6495/1‑189 (MQ=255) 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1:157230/1‑251 (MQ=255) ggATTAATGTATGTTATTAAAAAATAAACCCTCCGCCAGCGCCTTAATTATCGCCGGAACCGCCATTGGTGCCGGAATGCTCGCCATGCCGTTAACCTCCGCCGGCATGGGATTCGCCTTTACCGAGGCACTTCTCATCGGAc < 1:190819/143‑1 (MQ=255) ggATTAATGTATGTTATTAAAAAATAAAACCTTCGGCAGCGCCTTAATTATCGCCGGAACCGCCATTGGTGCCGGAATGCTCGCCATGCCGTTAACCTCCGCCGGCATGGGATTCGCCTTTACCGAGGCACTTCTCATCGGACTTTGGTTACTCCTTGCTTACAGTGGACTACTTTTCGTTGAAGTTTATCAAACTGCCAAACGCAAAGATGATGGCGTAGc > 1:264769/1‑222 (MQ=255) aaTGTATGTTATTAAAAAATAAAACCTTCGGCAGCGCCTTAATTATCGCCGGAACCGCCATTGGTGCCGGAATGCTCGCCATGCCGTTAACCTCCGCCGGCATGGGATTCGCCTTTACCGAGGCACTTCTCATCGGACTTTGGTTACTCCTTGCTTACAGTGGACTACTTTTCGTTGAAGTTTATCAAACTGCCAAACGCAAAGATGATGGCGTAGCAACCTTGGCGGAAAAATATTTCGGTATTCCCGGa > 1:385762/1‑251 (MQ=255) atgtatgtTATTAAAAAATAAAACCTTCGGCAGCGCCTTAATTATCGCCGGAACCGCCATTGGTGCCGGAATGCTCGCCATGCCGTTAACCTCCGCCGGCATGGGATTCGCCTTTACCGAGGCACTTCTCATCGGACTTTGGTTACTCCTTGCTTACAGTGGACTACTTTTCGTTGAAGTTTATCAAACTGCCAAACGCAAAGATGATGGCGTAGCAACCTTGGCGGAAAAATATTTCGGTATTCCCGGa > 1:273558/1‑250 (MQ=255) 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attaAAAAATAAACCCTCCGGCAGCGCCTTAATTATCGCCGGAACCGCCATTGGTGCCGGAATGCTCGCCATGCCGTTAACCTCCGCCGGCATGGGATTCGCCTTTACCGAGGCACTTCTCATCGGACTTTGGTTACTCCTTGCTTACAGTGGACTACTTTTCGTTGAAGTTTATCAAACTGCCAAACGCAAAGATGATGGCGTAGCAACCTTGGCGGAAAAATATTTCGGTATTCCCGGACGTATTAttt < 1:328711/251‑1 (MQ=255) aaaaaTAAACCCTTCGGCAGCGCCTTAATTACCGCCGGAACCGCCATTGGTGCCGGAATGCTCGCCATGCCGTTAACCTCCGCCGGCATGGGATTCGCCTTTACCGAGGCACTTCTCATCGGACTTTGGTTACTCCTTGCTTACAGTGGACTACTTTTCGTTGAAGTTTATCAAACTGCCAAACGCAAAGATGATGGCGTAGCAACCTTGGCGGAAAAATATTTCGGTATTCCCGGACGTATTATTTCAac < 1:791438/251‑1 (MQ=255) aCCTTCGGCAGCGCCTTAATTATCGCCGGAACCGCCATTGGTGCCGGAATGCTCGCCATGCCGTTAACCTCCGCCGGCATGGGATTCGCCTTTACCGAGGCACTTCTCATCGGACTTTGGTTACTCCTTGCTTACAGTGGACTACTTTTCGTTGAAGTTTATCAAACTGCCAAACGCAAAGATGATGGCGTAGCAACCTTGGCGGAAAAATATTTCGGTATTCCCGGACGTATTATTTCAACACTCTCa > 1:699316/1‑249 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |