| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,643,645 | C→T | intergenic (+155/‑165) | unknown → / → unknown | tRNA 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine synthesis sulfur carrier protein TusA/NadR transcriptional regulator / Nicotinamide‑nucleotide adenylyltransferase, NadR family (EC 2.7.7.1) / Ribosylnicotinamide kinase (EC 2.7.1.22) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,643,645 | 0 | C | T | 100.0% | 235.2 / NA | 85 | intergenic (+155/‑165) | unknown/unknown | tRNA 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine synthesis sulfur carrier protein TusA/NadR transcriptional regulator / Nicotinamide‑nucleotide adenylyltransferase, NadR family (EC 2.7.7.1) / Ribosylnicotinamide kinase (EC 2.7.1.22) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (46/39); total (46/39) | |||||||||||
ATTTATGGATCATACTTTGCTACATAGCGAAACAACTCAGATCCCCTATCGTTACTGGGTTAAAAAAGGGAAATCAGTTTAAACAGACAAAAATTGAAGCATCTATGCTAAATCCAAAAAAATAGAGCATGTTATACAACAAATTCAAGACAGCCTTCCTAAAGACATTAAAGACTTAGGGCTGGATGTGGAAGCCAAAATTAAACAGGTTTTACAAACCAATTATCCAAACCGGACATTGCATCCCGCGAAGAATTTGATTTACAAACACAAGTGTTAATACGTATCCGTGAAAAATTAAGTGAACTTGAAAAACGCGTGGAAGAGCTCTCTGCGGCAAAAACAAAATAAATTTCGACCGCACTTTTGCTTAACGCGTCGATTAAAATGAGGAAATAGGTATGTCAGCATTCCAATATTTACAAGAAAAACGTAAAAAATTGAATCTCAAAGTAAATGATGTTTGCCAAAGAGCGAAT > 1/1643409‑1643887 | aTTTATGGATCATACTTTGCTACATAGCGAAACAACTCAGATCCCCTATCGTTACTGGGTTAAAAAAGGGAAATCAGTTTAAACAGACAAAAATTGAAGCATCTATGCTAAATCCAAAAAAATAGAGCATGTTATACAACAAATTCAAGACAGCCTTCCTAAAGACATTAAAGACTTAGGGCTGGATGTGGAAGCCAAAATTAAACAGGTTTTACAAACCAATTATCCAAACCGGATATTGCATCCCGCga > 1:605591/1‑251 (MQ=255) 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(MQ=255) cATTAAAGACTTAGGGCTGGATGTGGAAGCCAAAATTAAACAGGTTTTACAAACCAATTATCCAAACCGGATATTGCATCCCGCGAAGAATTTGATTTACAAACACAAGTGTTAATACGTATCCGTGAAAAATTAAGTGAACTTGAAAAACGCGTGGAAGAGCTCTCTGCGGCAAAAACAAAATAAATTTCGACCGCACTTTTGCTTAACGCGTCGATTAAAATGAGGAAATAGGTa < 1:221644/237‑1 (MQ=255) cATTAAAGACTTAGGGCTGGATGTGGAAGCCAAAATTAAACAGGTTTTACAAACCAATTATCCAAACCGGATATTGCATCCCGCGAAGAATTTGATTTACAAACACAAGTGTTAATACGTATCCGTGAAAAATTAAGTGAACTTGAAAAACGCGTGGAAGAGCTCTCTGCGGCAAAAACAAAATAAATTTCGACCGCACTTTTGCTTAACGCGTCGATTAAAATGAGGAAATAGGTATGTc > 1:241055/1‑241 (MQ=255) cATTAAAGACTTAGGGCTGGATGTGGAAGCCAAAATTAAACAGGTTTTACAAACCAATTATCCAAACCGGATATTGCATCCCGCGAAGAATTTGATTTACAAACACAAGTGTTAATACGTATCCGTGAAAAATTAAGTGAACTTGAAAAACGCGTGGAAGAGCTCTCTGCGGCAAAAACAAAATAAATTTCGACCGCACTTTTGCTTAACGCGTCGATTAAAATGAGGAAATAGGTATGTCAGCATTCCaa > 1:355529/1‑251 (MQ=255) 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aTCCAAACCGGATATTGCATCCCGCGAAGAATTTGATTTACAAACACAAGTGTTAATACGTATCCGTGAAAAATTAAGTGAACTTGAAAAACGCGTGGAAGAGCTCTCTGCGGCAAAAACAAAATAAATTTCGACCGCACTTTTGCTTAACGCGTCGATTAAAATGAGGAAATAGGTATGTCAGCATTCCAATATTTACAAGAAAAACGTAAAAAATTGAATCTCAAAGTAAATGATGTTTGCCAAag > 1:348610/1‑248 (MQ=255) aaaCCGGATATTGCATCCCGCGAAGAATTTGATTTACAAACACAAGTGTTAATACGTATCCGTGAAAAATTAAGTGAACTTGAAAAACGCGTGGAAGAGCTCTCTGCGGCAAAAACAAAATAAATTTCGACCGCACTTTTGCTTAACGCGTCGATTAAAATGAGGAAATAGGTATGTCAGCATTCCAATATTTACAAGAAAAACGTAAAAAATTGAATCTCAAAGTAAATGATGTTTGCCAAAGAGCGAat > 1:523483/1‑251 (MQ=255) | ATTTATGGATCATACTTTGCTACATAGCGAAACAACTCAGATCCCCTATCGTTACTGGGTTAAAAAAGGGAAATCAGTTTAAACAGACAAAAATTGAAGCATCTATGCTAAATCCAAAAAAATAGAGCATGTTATACAACAAATTCAAGACAGCCTTCCTAAAGACATTAAAGACTTAGGGCTGGATGTGGAAGCCAAAATTAAACAGGTTTTACAAACCAATTATCCAAACCGGACATTGCATCCCGCGAAGAATTTGATTTACAAACACAAGTGTTAATACGTATCCGTGAAAAATTAAGTGAACTTGAAAAACGCGTGGAAGAGCTCTCTGCGGCAAAAACAAAATAAATTTCGACCGCACTTTTGCTTAACGCGTCGATTAAAATGAGGAAATAGGTATGTCAGCATTCCAATATTTACAAGAAAAACGTAAAAAATTGAATCTCAAAGTAAATGATGTTTGCCAAAGAGCGAAT > 1/1643409‑1643887 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |