| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,641,023 | T→C | H45R (CAC→CGC) | unknown ← | Protoporphyrinogen IX oxidase, oxygen‑independent, HemG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,641,023 | 0 | T | C | 100.0% | 233.0 / NA | 85 | H45R (CAC→CGC) | unknown | Protoporphyrinogen IX oxidase, oxygen‑independent, HemG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (31/54); total (31/54) | |||||||||||
ACCATAGCGCGGATAAAGCAATGCACCGGCAAACACCGCGGAGATCGTCGGTTGCCAAGTGATACGTTGCAAAAATTTACGCACATAAACATTCGTTTCAGGCGTTGCCTTGTCGGCTTTTCGCGCTGTCAGGTTCACGCCAAAAAAGGCGGTGGTCTTTTGATTCAAAAGTGCGGTGTGTTTTTCCAGCGTTTTATAAAGCTGTTTATTGAAATGTCCGTAGCGGATCGAAGCTCCGATAATAATGTGCTCGTAATCGGCAAAATTCACTTCTGCGTTAATCGATTTCACCTCCACATTGGTGGTGATTAGTTCGGCAATATAGTCGGCTATTTTCTTGGTCTGTCCATCATGAGTTGAATATAAAATAAGTGTTTTCATTAGGATTTCCAAAATGCAGGAGTGAATAATACCAATAAGGAGAAAATTTCCAAACGACCGCAAACCATGGCTAAGGTCAGGATCCATTTTGCGCTATCAGGGATGCCA > 1/1640776‑1641264 | aCCATAGCGCGGATAAAGCAATGCACCGGCAAACACCGCGGAGATCGTCGGTTGCCAAGTGATACGTTGCAAAAATTTACGCACATAAACATTCGTTTCAGGCGTTGCCTTGTCGGCTTTTCGCGCCGTCAGGTTCACGCCAAAAAAGGCGGTGGTCTTTTGATTCAAAAGTGCGGTGTGTTTTTCCAGCGTTTTATAAAGCTGTTTATTGAAATGTCCGTAGCGGATCGAAGCTCCGATAATAATGCGCt < 1:843842/251‑1 (MQ=255) 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1:643171/1‑244 (MQ=255) ttATTGAAATGTCCGTAGCGGATCGAAGCTCCGATAATAATGCGCTCGTAATCGGCAAAATTCACTTCTGCGTTAATCGATTTCACCTCCACATTGGTGGTGATTAGTTCGGCAATATAGTCGGCTa < 1:165086/127‑1 (MQ=255) ttATTGAAATGTCCGTAGCGGATCGAAGCTCCGATAATAATGCGCTCGTAATCGGCAAAATTCACTTCTGCGTTAATCGATTTCACCTCCACATTGGTGGTGATTAGTTCGGCAATATAGTCGGCTATTTTCTTGGTCTGTCCATCATGAGTTGAATATAAAATAAGTGTTTTCATTAGGATTTCCAAAATGCAg < 1:139251/195‑1 (MQ=255) gAAATGTCCGTAGCGGATCGAAGCTCCGATAATAATGCGCTCGTAATCGGCAAAATTCACTTCTGCGTTAATCGATTTCACCTCCACATTGGTGGTGATTAGTTCGGCAATATAGTCGGCTATTTTCTTGGTCTGTCCATCATGAGTTGAATATAAAATAAGTGTTTTCATTAGGATTTCCAAAATGCAGGAGTGAATAATACCAATAAGGAGAAAATTTCCAAACGACCGCAAACCATGGCTAAGGTCAg > 1:641918/1‑251 (MQ=255) gTCCGTAGCGGATCGAAGCTCCGATAATAATGCGCTCGTAATCGGCAAAATTCACTTCTGCGTTAATCGATTTCACCTCCACATTGGTGGTGATTAGTTCGGCAATATAGTCGGCTATTTTCTTGGTCTGTCCATCATGAGTTGAATATAAAATAAGTGTTTTCATTAGGATTTCCAAAATGCAGGAGTGaataa < 1:391473/195‑1 (MQ=255) gTCCGTAGCGGATCGAAGCTCCGATAATAATGCGCTCGTAATCGGCAAAATTCACTTCTGCGTTAATCGATTTCACCTCCACATTGGTGGTGATCAGTTCGGCAatat > 1:722729/1‑108 (MQ=255) ccGTAGCGGATCGAAGCTCCGATAATAATGCGCTCGTAATCGGCAAAATTCACTTCTGCGTTAATCGATTTCACCTCCACATTGGTGGTGATTAGTTCGGCAATATAGTCGGCTATTTTCTTGGTCTGTCCATCATGAGTTGAat > 1:156573/1‑145 (MQ=255) tAGCGGATCGAAGCTCCGATAATAATGCGCTCGTAATCGGCAAAATTCACTTCTGCGTTAATCGATTTCACCTCCACATTGGTGGTGATTAGTTCGGCAATATAGTCGGCTATTTTCTTGGTCTGTCCATCATGAGTTGAATATAAAATAAGTGTTTTCATTAGGATTTCCAAAATGCAGGAGTGAATAATACCAATAAGGAGAAAATTTCCAAACGACCGCAAACCATGGCTAAGGTCAGGATCCAttt < 1:152447/250‑1 (MQ=255) tCGAAGCTCCGATAATAATGCGCTCGTAATCGGCAAAATTCACTTCTGCGTTAATCGATTTCACCTCCACATTGGTGGTGATTAGTTCGGCAATATAGTCGGCTATTTTCTTGGTCTGTCCATCATGAGTTGAATATAAAATAAGTGTTTTCATTAGGATTTCCAAAATACAGGAGTGAATAATACCAATAAGGAGAAAATTTCCAAACGACCGCAAACCATGGCTAAGGTCAGGATCCATTTTGCGCTAt > 1:455430/1‑251 (MQ=255) 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cGATAATAATGCGCTCGTAATCGGCAAAATTCACTTCTGCGTTAATCGATTTCACCTCCACATTGGTGGTGATTAGTTCGGCAATATAGTCGGCTATTTTCTTGGTCTGTCCATCATGAGTTGAATATAAAATAAGTGTTTTCATTAGGATTTCCAAAATGCAGGAGTGAATAATACCAATAAGGAGAAAATTTCCAAACGACCGCAAACCATGGCTAAGGTCAGGATCCATTTTGCGCTATCAGGGATGc < 1:327295/251‑1 (MQ=255) ataataATGCGCTCGTAATCGGCAAAATTCACTTCTGCGTTAATCGATTTCACCTCCACATTGGTGGTGATTAGTTCGGCAATATAGTCGGCTATTTTCTTGGTCTGTCCATCATg < 1:430060/116‑1 (MQ=255) ataataATGCGCTCGTAATCGGCAAAATTCACTTCTGCGTTAATCGATTTCACCTCCACATTGGTGGTGATTAGTTCGGCAATATAGTCGGCTATTTTCTTGGTCTGTCCATCATGAGTTGAATATAAAATAAGTGTTTTCATTAGGATTTCCAAAATGCAGGAGTGAATAATACCAATAAGGAGAAAATTTCCAAACGACCGCAAACCATGGCTAAGGTCAGGATCCATTTTGCGCTATCAGGGATGCca > 1:719249/1‑251 (MQ=255) | ACCATAGCGCGGATAAAGCAATGCACCGGCAAACACCGCGGAGATCGTCGGTTGCCAAGTGATACGTTGCAAAAATTTACGCACATAAACATTCGTTTCAGGCGTTGCCTTGTCGGCTTTTCGCGCTGTCAGGTTCACGCCAAAAAAGGCGGTGGTCTTTTGATTCAAAAGTGCGGTGTGTTTTTCCAGCGTTTTATAAAGCTGTTTATTGAAATGTCCGTAGCGGATCGAAGCTCCGATAATAATGTGCTCGTAATCGGCAAAATTCACTTCTGCGTTAATCGATTTCACCTCCACATTGGTGGTGATTAGTTCGGCAATATAGTCGGCTATTTTCTTGGTCTGTCCATCATGAGTTGAATATAAAATAAGTGTTTTCATTAGGATTTCCAAAATGCAGGAGTGAATAATACCAATAAGGAGAAAATTTCCAAACGACCGCAAACCATGGCTAAGGTCAGGATCCATTTTGCGCTATCAGGGATGCCA > 1/1640776‑1641264 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |