| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,640,500 | C→A | intergenic (‑189/+144) | unknown ← / ← unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/Protoporphyrinogen IX oxidase, oxygen‑independent, HemG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,640,500 | 0 | C | A | 100.0% | 130.4 / NA | 50 | intergenic (‑189/+144) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/Protoporphyrinogen IX oxidase, oxygen‑independent, HemG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (27/23); total (27/23) | |||||||||||
AAGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATCATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACATTTGCATTAAGCAAGGCCGCAAATTATAGATGAAGATCTTATTTGCCGTCAAGAAAATATTTTGTTTATTTTCCTTTAGTTACTGCCCTTGCAGTGCGGATGCGTATTATAGGGATCTCTATGATAGGATCAAGCGGATTTTTACA‑TTTTTTGTCGATAGCTTAGAAAAAATACAACTTACTTATTTCAACTGCAAAAACGCTTCTGAAAACGACCGCACTTTTTGCCAATCCGTATATTCGATTTCTTTTGTAAGATCCGTTTCTCCGCCTGTGATACGCAT > 1/1640260‑1640745 | aaGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATCATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACATTTGCATTAAGCAAGGCCGCAAATTATAGATGAAGATATTATTTGCCg < 1:235485/251‑1 (MQ=255) 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AAGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATCATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACATTTGCATTAAGCAAGGCCGCAAATTATAGATGAAGATCTTATTTGCCGTCAAGAAAATATTTTGTTTATTTTCCTTTAGTTACTGCCCTTGCAGTGCGGATGCGTATTATAGGGATCTCTATGATAGGATCAAGCGGATTTTTACA‑TTTTTTGTCGATAGCTTAGAAAAAATACAACTTACTTATTTCAACTGCAAAAACGCTTCTGAAAACGACCGCACTTTTTGCCAATCCGTATATTCGATTTCTTTTGTAAGATCCGTTTCTCCGCCTGTGATACGCAT > 1/1640260‑1640745 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |