| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,630,127 | G→A | intergenic (+181/‑1) | unknown → / → unknown | Aspartate ammonia‑lyase (EC 4.3.1.1)/ADP‑heptose‑‑lipooligosaccharide heptosyltransferase II |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,630,127 | 0 | G | A | 100.0% | 209.6 / NA | 78 | intergenic (+181/‑1) | unknown/unknown | Aspartate ammonia‑lyase (EC 4.3.1.1)/ADP‑heptose‑‑lipooligosaccharide heptosyltransferase II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (36/42); total (36/42) | |||||||||||
ATGATATTCTGTCCGTGGAAAACTTGATGAACCCGACTTACAAAGCGAAATTAAATAAGTGAACAAAGCGACCAATAAAGTGTCAAAAAACTAACTTGTTTATTTTAGTCAAAATCAGCGTCTTAACGGATTAGGGCGCTGATTTTTTATTTGTCGCTTTTTAATGGACGATGGTCGGGCTAGAATAAGCAAAATTTTTTCCGGCGGACCTTAAGCCGAAACCTTGGATAGGAACAACAGACGATGAAAAAAGTATTGGTTATTCGTAACGATAAACTGGGTGATTTTATGTTGGCATGGCCGGCGTTTGCCATGTTGAAAGCATCGGATCCGTCGCTAAAACTTACCGCACTTGTGCCGACGTATACGGCGGAAATCGCCCGCGCCTGCCCTTATTTAGATGAGGTCATCATTGACGTGCCGAAGGGGGATAAAGCGGCGTTTCAACGTCTCGTGAATGACATCAAGGCGCAGCGATTTGATGC > 1/1629885‑1630369 | atgatATTCTGTCCGTGGAAAACTTGATGAACCCGACTTACAAAGCGAAATTAAATAAGTGAACAAAGCGACCAATAAAGTGTCAAAAAACTAACTTGTTTATTTTAGTCAAAATCAGCGTCTTAACGGATTAGGGCGCTGATTTTTTATTTGTCGCTTTTTAATGGACGATGGTCGGGCTAGAATAAGCAAAATTTTTTCCGGCGGACCTTAAGCCGAAACCTTGGATAGGAACAACAGACAATGaaaaa > 1:84117/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |