| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,592,236 | G→A | G375G (GGC→GGT) | unknown ← | tRNA‑specific 2‑thiouridylase MnmA (EC 2.8.1.13) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,592,236 | 0 | G | A | 100.0% | 215.9 / NA | 88 | G375G (GGC→GGT) | unknown | tRNA‑specific 2‑thiouridylase MnmA (EC 2.8.1.13) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (41/47); total (41/47) | |||||||||||
GTTTTTAATACGACTTTACAAGACTTTCACCGACATGGATCAGCTATTTAATCACTGAACTGCAAAGCATACTTCGTATATTACAACCAAAAACGGTTTAAACCGGATTCAAAAAGATTGAGATCTACACAATATAGAATAGGACTCAGTATCTAGTTTACCGGCCTATCCAACTTTTAGGGGCAAGCCACTTTTAATTCAAATTGTATTTATTTTAATTGCTTTTCAATGATGCCGCCGCCAAGGCAAATTTCGTCTAAATAAAACACCGCCGATTGTCCCGGAGTGACCGCAATTTGTGGTTCGTCAAATATAACTTTAATGGTTTCATCATCTATAGGTTCAATAATGCAAGGTACATCCGTTTGACGATAACGGGTTTTCACCGTGCAACGCAATGGCGCGCGAATCGGCAGGCAATCAACCCAATGTAATTGCTGTGCGATTAAACCGGTGGAAAGTAAAGCGGAATGGTCATGCCC > 1/1592000‑1592481 | gTTTTTAATACGACTTTACAAGACTTTCACCGACATGGATCAGCTATTTAATCACTGAACTGCAAAACATACTTCGTATATTACAACCAAAAACGGTTTAAACCGGATTCAAAAAGATTGAGATCTACACAATATAGAATAGGACTCAGTATCTAGTTTACCGGCCTATCCAACTTTTAGGGGCAAGCCACTTTTAATTCAAATCGTATTTATTTTAATTGCTTTTCAATGATGCCACCGCCAAGGCAAAt > 1:170547/1‑251 (MQ=255) 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GTTTTTAATACGACTTTACAAGACTTTCACCGACATGGATCAGCTATTTAATCACTGAACTGCAAAGCATACTTCGTATATTACAACCAAAAACGGTTTAAACCGGATTCAAAAAGATTGAGATCTACACAATATAGAATAGGACTCAGTATCTAGTTTACCGGCCTATCCAACTTTTAGGGGCAAGCCACTTTTAATTCAAATTGTATTTATTTTAATTGCTTTTCAATGATGCCGCCGCCAAGGCAAATTTCGTCTAAATAAAACACCGCCGATTGTCCCGGAGTGACCGCAATTTGTGGTTCGTCAAATATAACTTTAATGGTTTCATCATCTATAGGTTCAATAATGCAAGGTACATCCGTTTGACGATAACGGGTTTTCACCGTGCAACGCAATGGCGCGCGAATCGGCAGGCAATCAACCCAATGTAATTGCTGTGCGATTAAACCGGTGGAAAGTAAAGCGGAATGGTCATGCCC > 1/1592000‑1592481 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |