| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,592,204 | T→C | intergenic (‑448/+5) | unknown ← / ← unknown | hypothetical protein/tRNA‑specific 2‑thiouridylase MnmA (EC 2.8.1.13) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,592,204 | 0 | T | C | 100.0% | 255.3 / NA | 91 | intergenic (‑448/+5) | unknown/unknown | hypothetical protein/tRNA‑specific 2‑thiouridylase MnmA (EC 2.8.1.13) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (44/47); total (44/47) | |||||||||||
TTGGATCGCAATCAAATCTATCTGTGCGGAGGAATGGTTTTTAATACGACTTTACAAGACTTTCACCGACATGGATCAGCTATTTAATCACTGAACTGCAAAGCATACTTCGTATATTACAACCAAAAACGGTTTAAACCGGATTCAAAAAGATTGAGATCTACACAATATAGAATAGGACTCAGTATCTAGTTTACCGGCCTATCCAACTTTTAGGGGCAAGCCACTTTTAATTCAAATTGTATTTATTTTAATTGCTTTTCAATGATGCCGCCGCCAAGGCAAATTTCGTCTAAATAAAACACCGCCGATTGTCCCGGAGTGACCGCAATTTGTGGTTCGTCAAATATAACTTTAATGGTTTCATCATCTATAGGTTCAATAATGCAAGGTACATCCGTTTGACGATAACGGGTTTTCACCGTGCAACGCAATGGCGCGCGAATCGGCAGGCAATCAACCCAATGTAATTGCTGTGCGATTA > 1/1591964‑1592447 | ttGGATCGCAATCAAATCTATCTGTGCGGAGGAATGGTTTTTAATACGACTTTACAAGACTTTCACCGACATGGATCAGCTATTTAATCACTGAACTGCAAAACATACTTCGTATATTACAACCAAAAACGGTTTAAACCGGATTCAAAAAGATTGAGATCTACACAATATAGAATAGGACTCAGTATCTAGTTTACCGGCCTATCCAACTTTTAGGGGCAAGCCACTTTTAATTCAAATCGtatttatt < 1:129555/250‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |