| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,592,066 | G→A | intergenic (‑310/+143) | unknown ← / ← unknown | hypothetical protein/tRNA‑specific 2‑thiouridylase MnmA (EC 2.8.1.13) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,592,066 | 0 | G | A | 100.0% | 251.0 / NA | 94 | intergenic (‑310/+143) | unknown/unknown | hypothetical protein/tRNA‑specific 2‑thiouridylase MnmA (EC 2.8.1.13) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (50/44); total (50/44) | |||||||||||
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1:300821/251‑1 (MQ=255) atctatctGTGCGGAGGAATGGTTTTTAATACGACTTCACAAGACTTTCACCGACATGGATCAGCTATTTAATCACTGAACTGCAAAACATACTTCGTATATTACAACCAAAAACGGTTTAAACCGGATTCAAAAAGATTGAGATCTACACAATATAGAATAGGACTCAGTATCTAGTTTACCGGCCTATCCAACTTTTAGGGGCAAGCCACTTTTAATTCAAATCGTATTTATTTTAATTGCTTTTCAat < 1:90423/251‑1 (MQ=255) gtgCGGAGGAATGGTTTTTAATACGACTTTACAAGACTTTCACCGACATGGATCAGCTATTTAATCACTGAACTGCAAAACATACTTCGTATATTACAACCAAAAACGGTTTAAACCGGATTCAAAAAGATTGAGATCTgcac < 1:560190/143‑1 (MQ=255) gtgCGGAGGAATGGTTTTTAATACGACTTTACAAGACTTTCACCGACATGGATCAGCTATTTAATCACTGAACTGCAAAACATACTTCGTATATTACAACCAAAAACGGTTTAAACCGGATTCAAAAAGATTGAGATCTACACAATATAGAATAGGACTCAGTATCTAGt > 1:239785/1‑170 (MQ=255) gtgCGGAGGAATGGTTTTTAATACGACTTTACAAGACTTTCACCGACATGGATCAGCTATTTAATCACTGAACTGCAAAACATACTTCGTATATTACAACCAAAAACGGTTTAAACCGGATTCAAAAAGATTGAGATCTACACAATATAGAATAGGACTCAGTATCTAGTTTACCGGCCTATCCAACTTTTAGGGGCAAGCCACTTTTAATTCAAATCGTATTTATTTTAATTGCTTTTCAATGATgcca > 1:153110/1‑249 (MQ=255) gaggaATGGTTTTTAATACGACTTTACAAGACTTTCACCGACATGGATCAGCTATTTAATCACTGAACTGCAAAACATACTTCGTATATTACAACCAAAAACGGTTTAAACCGGATTCAAAAAGATTGAGATCTACACAATATAGAAt > 1:654898/1‑148 (MQ=255) gaggaATGGTTTTTAATACGACTTTACAAGACTTTCACCGACATGGATCAGCTATTTAATCACTGAACTGCAAAACATACTTCGTATATTACAACCAAAAACGGTTTAAACCGGATTCAAAAAGATTGAGATCTACACAATATAGAATAGGACTCAGTATCTAGt > 1:193832/1‑165 (MQ=255) ggaATGGTTTTTAATACGACTTTACAAGACTTTCACCGACATGGATCAGCTATTTAATCACTGAACTGCAAAACATACTTCGTATATTACAACCAAAAACGGTTTAAACCGGATTCAAAAAGATTGAGATCTACACAATATAGAATAGGACTCAGTATCTAGt > 1:800725/1‑163 (MQ=255) gTTTTTAATACGACTTTACAAGACTTTCACCGACATGGATCAGCTATTTAATCACTGAACTGCAAAACATACTTCGTATATTACAACCAAAAACGGTTTAAACCGGATTCAAAAAGATTGAGATCTACACAATATAGAATAGGAc > 1:744923/1‑145 (MQ=255) gTTTTTAATACGACTTTACAAGACTTTCACCGACATGGATCAGCTATTTAATCACTGAACTGCAAAACATACTTCGTATATTACAACCAAAAACGGTTTAAACCGGATTCAAAAAGATTGAGATCTACACAATATAGAATAGGACTCAGTATCTAGTTTACCGGCCTATCCAACTTTTAGGGGCAAGCCACTTTTAATTCAAATCGTATTTATTTTAATTGCTTTTCAATGATGCCACCGCCAAGGCAAAt > 1:170547/1‑251 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1:260340/251‑1 (MQ=255) tggttaaGCTATTTAATCGCTGAACTGCAAAACATACTTCGTATATTACAACAAAAACCGGTTTAAACCGATTTCAAAAAGATTGAGATCTAAACAATAAAAAATAGAACTCAGTATCTATTTTACCGGCCTATCCAACTTTTAGGGGCAAGCCACTTTTAATTCAAATCGTATTTATTTTAATTGCTTTTCAATGATGCCACCGCCAAGGCAAATTTCGTCTAAATAAAACACCGCCGATTGTCCCGGAg < 1:424373/245‑1 (MQ=255) tGGATCAGCTATTTAATCACTGAACTGCAAAACATACTTCGTATATTACAACCAAAAACGGTTTAAACCGGATTCAAAAAGATTGAGATCTACACAATATAGAATAGGACTCAGTATCTAGTTTACCGGCCTATCCAACTTTTAGGGGCAAGCCACTTTTAATTCAAATCGTATTTATTTTAATTGCTTTTCAATGATGCCACCGCCAAGGCAAATTTCGTCTAAATAAAACACCGCCGATTGTCCCGGAg < 1:458830/251‑1 (MQ=255) gATCAGCTATTTAATCACTGAACTGCAAAACATACTTCGTATATTACAACCAAAAAc > 1:203525/1‑57 (MQ=255) gATCAGCTATTTAATCACTGAACTGCAAAACATACTTCGTATATTACAACCAAAAACGGTTTAAACCGGATTCAAAAAGATTGAGATCTACACAATATAGAAt > 1:313745/1‑103 (MQ=255) gATCAGCTATTTAATCACTGAACTGCAAAACATACTTCGTATATTACAACCAAAAACGGTTTAAACCGGATTCAAAAAGATTGAGATCTACACAATATAGAATAGGACTCAGTATCTAGTTTACCGGCCTATCCAACTTTTAggg > 1:103579/1‑145 (MQ=255) 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AAATTCTCAATATCTTGCGGTCTAGGCGGTCTCTCTGGCTTGCGTTGGAAAAATATGCCCGTAGGCAACGGAAGAAGAGCGTAATGACAGCACGGACAATTTCTTCTGCGTTGTGGGTGGAAACACTAAGATACAACTCCGCATGTTGGATCGCAATCAAATCTATCTGTGCGGAGGAATGGTTTTTAATACGACTTTACAAGACTTTCACCGACATGGATCAGCTATTTAATCACTGAACTGCAAAGCATACTTCGTATATTACAACCAAAAACGGTTTAAACCGGATTCAAAAAGATTGAGATCTACACAATATAGAATAGGACTCAGTATCTAGTTTACCGGCCTATCCAACTTTTAGGGGCAAGCCACTTTTAATTCAAATTGTATTTATTTTAATTGCTTTTCAATGATGCCGCCGCCAAGGCAAATTTCGTCTAAATAAAACACCGCCGATTGTCCCGGAGTGACCGCAATTTGTGGTTCGT > 1/1591819‑1592306 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |