| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,585,883 | C→G | P111R (CCT→CGT) | unknown → | Phosphomannomutase (EC 5.4.2.8) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,585,883 | 0 | C | G | 100.0% | 183.2 / NA | 67 | P111R (CCT→CGT) | unknown | Phosphomannomutase (EC 5.4.2.8) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (30/37); total (30/37) | |||||||||||
GGTCATGCATTCGGGCAGTTTTTAACGCCCAAAACGATTATCGTTGGTGGCGATGTTCGCTTAACGAGTAAAGAGTTAAAAAGTGCGGTAACAAATGGATTATTGGATTCAGGTGTTAATGTAATTGATTTAGGTGAAACGGGGACAGAGGAAGTCTATTTTGCTACATCATTTTTGAAAACTGACGGTGGTATTGAAGTGACCGCAAGCCACAACCCGATGGACTACAACGGCTTAAAATTAGTGCCTGAAGGGTCCCGTCCGATTAGCGCGGATACCGGGTTGGCGGATATTCAACGTCTGGCGGAGGAAAATAATTTCCCGCCGGTGACCAAACGCGGCGAGTATAAACAACTTTCCGTACTTGATGATTATGTTGAGCACCTCTTATCTTATATTAATCTCGATTCGCTAAAACCGTTGAAGTTAGTGATTAACTCAGGTAATGGCGCCGCAGGGCACGTGATTGATGC > 1/1585636‑1586108 | ggTCATGCATTCGGGCAGTTTTTAACGCCCAAAACGATTGTCGTTGGTGGCGATGTTCGCTTAACGAGTAAAGAGTTAAAAAGTGCGGTAACAAATGGATTATTGGATTCAGGTGTTAATGTAATTGATTTAGGTGAAACGGGGACAGAGGAAGTCTATTTTGCTACATCATTTTTGAAAACTGACGGTGGTATTGAAGTGACCGCAAGCCACAACCCGATGGACTACAACGGCTTAAAATTAGTGCGTGa > 1:789648/1‑251 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aaCCCGATGGACTACAACGGCTTAAAATTAGTGCGTGAAGGGTCCCGTCCGATTAGCGCGGATACCGGGTTGGCGGATATTCAACGTCTGGCGGAGGAAAATAATTTCCCGCCGGTGACCAAACGCGGCGAGTATAAACAACTTTCCGTACTTGATGATTATGTTGAGCACCtcttatc > 1:804596/1‑179 (MQ=255) aCCCGATGGACTACAACGGCTTAAAATTAGTGCGTGAAGGGTCCCGTCCGATTAGCGCGGATACCGGGTTGGCGGATATTCAACGTCTGGCGGAGGAAAATAATTTCCCGCCGGTGACCAAACGCGGCGAGTATAAACAACtt > 1:868936/1‑143 (MQ=255) aCCCGATGGACTACAACGGCTTAAAATTAGTGCGTGAAGGGTCCCGTCCGATTAGCGCGGATACCGGGTTGGCGGATATTCAACGTCTGGCGGAGGAAAATAATTTCCCGCCGGTGACCAAACGCGGCGAGTATAAACAACTTTCCGTACTTGATGATTATGTTGAGCACCTCTTATCTTATATTAATCTCGATTCGCTAAAACCGTTGAAGTTAGTGATTAACTCAGGTAATGGCGCCGCAGGGCACGtg > 1:481279/1‑251 (MQ=255) cccGATGGACTACAACGGCTTAAAATTAGTGCGTGAAGGGTCCCGTCCGATTAGCGCGGATACCGGGTTGGCGGATATTCAACGTCTGGCGGAGGAAAATAATTTCCCGCCGGTGACCAAACGCGGCGAGTATAAACAACTTTCCGTACTTGATGATTATGTTGAGc < 1:65097/167‑1 (MQ=255) ggACTACAACGGCTTAAAATTAGTGCGTGAAGGGTCCCGTCCGATTAgcgc < 1:873480/51‑1 (MQ=255) ggACTACAACGGCTTAAAATTAGTGCGTGAAGGGTCCCGTCCGATTAGCGCGGATACCGGGTTGGCGGATATTCAACGTCTGGCGGAGGAAAATAATTTCCCGCCGGTGACCAAACGCGGCGAGTATAAACAACTTTCCGTACTTGATGATTATGTTGAGCACCTCTTATCTTATATTAATCTCGATTCGCTAAAACCGTTGAAGTTAGTGATTAACTCAGGTAATGGCGCCGCAGGGCACGTGATTGATg > 1:750729/1‑251 (MQ=255) gACTACAACGGCTTAAAATTAGTGCGTGAAGGGTCCCGTCCGATTAGCGCGGATACCGGGTTGGCGGATATTCAACGTCTGGCGGAGGAAAATAATTTCCCGCCGGTGACCAAACGCGGCGAGTATAAACAACTTTCCGTACTTGATGATTATGTTGAGCACCTCTTATCTTatat < 1:758925/176‑1 (MQ=255) aCTACAACGGCTTAAAATTAGTGCGTGAAGGGTCCCGTCCGATTAGCGCGGATACCGGGTTGGCGGATATTCAACGTCTGGCGGAGGAAAATAATTTCCCGCCGGTGACCAAACGCGGCGAGTATAAACAACTTTCCGTACTTGATGATTATGTTGAGCACCTCTTATCTTATATTAATCTCGATTCGCTAAAACCGTTGAAGTTAGTGATTAACTCAGGTAATGGCGCCGCAGGGCACGTGATTGATGc < 1:222596/250‑1 (MQ=255) gCTTAAAATTAGTGCGTGAAGGGTCCCGTCCGATTAGCGCGGATACCGGGTTGGCGGATATTCAACGTCTGGCGGAGGAAAATAATTTCCCGCCGGTGACCAAACGCGGCGAGTATAAACAACTTTCCGTACTTGATGATTATGTTGAGCAc < 1:624163/152‑1 (MQ=255) | GGTCATGCATTCGGGCAGTTTTTAACGCCCAAAACGATTATCGTTGGTGGCGATGTTCGCTTAACGAGTAAAGAGTTAAAAAGTGCGGTAACAAATGGATTATTGGATTCAGGTGTTAATGTAATTGATTTAGGTGAAACGGGGACAGAGGAAGTCTATTTTGCTACATCATTTTTGAAAACTGACGGTGGTATTGAAGTGACCGCAAGCCACAACCCGATGGACTACAACGGCTTAAAATTAGTGCCTGAAGGGTCCCGTCCGATTAGCGCGGATACCGGGTTGGCGGATATTCAACGTCTGGCGGAGGAAAATAATTTCCCGCCGGTGACCAAACGCGGCGAGTATAAACAACTTTCCGTACTTGATGATTATGTTGAGCACCTCTTATCTTATATTAATCTCGATTCGCTAAAACCGTTGAAGTTAGTGATTAACTCAGGTAATGGCGCCGCAGGGCACGTGATTGATGC > 1/1585636‑1586108 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |