| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,584,994 | G→T | V802L (GTA→TTA) | unknown → | Alanyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.7) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,584,994 | 0 | G | T | 100.0% | 196.2 / NA | 73 | V802L (GTA→TTA) | unknown | Alanyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.7) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (37/36); total (37/36) | |||||||||||
CTGAAATCGGATGTTAATTCCATTACGGATAAGATTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACAAACATTAAAAGAAAAAGCTGCGCTGCAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTGTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAATCTTATTGTAGGGGTAACTCAGGATCTGACAGGGAAAGTAAAAGCCGGCGAATTAGTGAATTTGATGGCTCAACAAGTTGGCGGTAAAGGCGGTGGTCGTCCTGATATGGCCATGGCCGGCGGTACTCAGCCGGAAAATGTAAACAAAGCGTTATCGGTTTGCTCCGATTGGTTGAAAGCGAATTTATAAGCTTTTTATATC > 1/1584748‑1585227 | cTGAAATCGGATGTTAATTCCATTACGGATAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACAAACATTAAAAGAAAAAGCTGCGCTGCAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTAtt < 1:668654/251‑1 (MQ=255) gTTAATTCCATTACGGATAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACAAACATTAAAAGAAAAAGCTGCGCTGCAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCgtagt > 1:628774/1‑251 (MQ=255) ttCCATTACGGATAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACAAACATTAAAAGAAAAAGCTGCGCTGCAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTACCgtag < 1:284032/245‑1 (MQ=255) cATTACGGATAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACAAACATTAAAAGAAAAAGCTGCGCTGCAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGaaa > 1:641016/1‑251 (MQ=255) 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tAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACAAACATTAAAAGAAAAAGCTGCGCTGCAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCgtagt < 1:187825/234‑1 (MQ=255) tAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACAAACATTAAAAGAAAAAGCTGCGCTGCAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGtagtag > 1:241347/1‑236 (MQ=255) tAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACAAACATTAAAAGAAAAAGCTGCGCTGCAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAAt > 1:744794/1‑250 (MQ=255) 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1:850445/1‑164 (MQ=255) aaaGCTGCGCTGCAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAATCTTATTGTAGGGGTAACTCAGGATCTGACAGGGAAAGTAAAAGCCGGCGAATTAGTGAATTTGAt < 1:861924/251‑1 (MQ=255) aaGCTGCGCTGCAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAATCTTATTGTAGGGGTAACTCAGGa < 1:756111/208‑1 (MQ=255) gcgctgcAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAATCTTATTGTAGGGGTAACTCAGGATCTGAc < 1:161211/209‑1 (MQ=255) gctgcAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAATc < 1:256782/179‑1 (MQ=255) 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< 1:267105/168‑1 (MQ=255) aaTTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAATCTTATTGTAGGGGTAACTCAGGATCTGACAGGGAAAGTAAAAGCCGGCGAATTAGTGAATTTGATGGCTCAACAAg < 1:544477/215‑1 (MQ=255) aaTTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAATCTTATTGTAGGGGTAACTCAGGATCTGACAAGGAAAGTAAAAGCCGGCGAATTAGTGAATTTGATGGCTCAACAAGTTGGCGGTAAAGGCGGTGGTCGTCCTGATatggcca > 1:424586/1‑251 (MQ=255) ggTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAATCTTATTGTAGGGGTAACTCAGGATCTGACAGGGAAAGTAAAAGCCGGCGAATTAGTGAATTTGATGGCTCAACAAGTTGGCGGTAAAGGCGGTGGTCGTCCTGATatgg > 1:122049/1‑241 (MQ=255) gtgtTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAATCTTATTGTAGGGGTAACTCAGGAt < 1:670141/155‑1 (MQ=255) 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1:686297/1‑251 (MQ=255) cAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAATCTTATTGTAGGGGTAACTCAGGATCTGACAGGGAAAGTAAAAGCCGGCGAATTAGTGAATTTGATGGCTCAACAAGTTGGCGGTAAAGGCGGTGGTCGTCCTGATATGGCCATGGCCGGCGGTACTCAGCCGGAAAATGTAAACAAAGCGTTATCGGTTTGCTCCGATTGGTTg < 1:525866/251‑1 (MQ=255) ggTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAATCTTATTGTAGGGGTAACTCAGGATCTGACAGGGAAAGTAAAAGCCGGCGAATTAGTGAATTTGAt < 1:891165/138‑1 (MQ=255) ccTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAATCTTATTGTAGGGGTAACTCAGGATCTGACAGGGAAAGTAAAAGCCGGCGAATTAGTGAATTTGATGGCTCAACAAGTTGGCGGTAAAGGCGGTGGTCGTCCTGATATGGCCATGGCCGGCGGTACTCAGCCGGAAAATGTAAACAAAGCGTTATCGGTTTGCTCCGATTGGTTGAAAGCGAATTta < 1:108188/250‑1 (MQ=255) aaaaaTCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAATCTTATTGTAGGGGTAACTCAGGATCTGACAGGGAAAGTAAAAGCCGGCGAATTAGTGAATTTGATGGCTCAACAAGTTGGCGGTAAAGGCGGTGGTCGTCCTGATATGGCCATGGCCGGCGGTACTCAGCCGGAAAATGTAAACAAAGCGTTATCGGTTTGCTCCGATTGGTTGAAAGCGAATTTATAAGc < 1:282646/251‑1 (MQ=255) aTCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAATCTTATTGTAGGGGTAACTCAGGATCTGACAGGGAAAGTAAAAGCCGGCGAATTAGTGAATTTGATGGCTCAACAAGTTGGCGGTAAAGGCGGTGGTCGTCCTGATATGGCCATGGCCGGCGGTACTCAGCCGGAAAATGTAAACAAAGCGTTATCGGTTTGCTCCGATTGGTTGAAAGCGAATTTATAAGCtttt > 1:123760/1‑251 (MQ=255) cAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAATCTTATTGTAGGGGTAACTCAGGATCTGACAGGGAAAGTAAAAGCCGGCGAATTAGTGAATTTGATGGCTCAACAAGTTGGCGGTAAAGGCGGTGGTCGTCCTGATATGGCCATGGCCGGCGGTACTCAGCCGGAAAATGTAAACAAAGCGTTATCGGTTTGCTCCGATTGGTTGAAAGCGAATTTATAAGCTTTTta > 1:147275/1‑251 (MQ=255) tAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAATCTTATTGTAGGGGTAACTCAGGATCTGACAGGGAAAGTAAAAGCCGGCGAATTAGTGAATTTGATGGCTCAACAAGTTGGCGGTAAAGGCGGTGGTCGTCCTGATATGGCCATGGCCGGCGGTACTCAGCCGGAAAATGTAAACAAAGCGTTATCGGTTTGCTCCGATTGGTTGAAAGCGAATTTATAAGCTTTTTATATc < 1:721581/251‑1 (MQ=255) tAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAATCTTATTGTAGGGGTAACTCAGGATCTGACAGGGAAAGTAAAAGCCGGCGAATTAGTGAATTTGATGGCTCAACAAGTTGGCGGTAAAGGCGGTGGTCGTCCTGATATGGCCATGGCCGGCGGTACTCAGCCGGAAAATGTAAACAAAGCGTTATCGGTTTGCTCCGATTGGTTGAAAGCGAATTTATAAGCTTTTTATATc < 1:118349/251‑1 (MQ=255) tAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAATCTTATTGTAGGGGTAACTCAGGATCTGACAGGGAAAGTAAAAGCCGGCGAATTAGTGAATTTGATGGCTCAACAAGTTGGCGGTAAAGGCGGTGGTCGTCCTGATATGACCATGGCCGGCGGTACTCAGCCGGAAAATGTAAACAAAGCGTTATCGGTTTGCTCCGATTGGTTGAAAGCGAATTTATAAGCTTTTTATATc < 1:407122/251‑1 (MQ=255) aGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAATCTTATTGTAGGGGTAACTCAGGATCTGACAGGGAAAGTAAAAGCCGGCGAATTAGTGAATTTGATGGCTCAACAAGTTGGCGGTAAAGGCGGTGGTCGTCCTGATATGGCCATGGCCGGCGGTACTCAGCCGGAAAATGTAAACAAAGCGTTATCGGTTTGCTCCGATTGGTTGAAAGCGAATTTATAAGCTTTTTatat > 1:644846/1‑249 (MQ=255) cAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAATCTTATTGTAGGGGTAACTCAGGATCTGACAGGGAAAGTAAAAGcc > 1:382658/1‑86 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |