| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,584,781 | A→G | I731V (ATT→GTT) | unknown → | Alanyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.7) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,584,781 | 0 | A | G | 100.0% | 238.3 / NA | 83 | I731V (ATT→GTT) | unknown | Alanyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.7) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (53/30); total (53/30) | |||||||||||
CCGATCAAGTACGCGTACTAACTATGGGAGATTTTTCCATTGAATTATGTGGTGGGATCCATGCGAAACGTACCGGCGACATCGGGCTGTTTAAAATAGTAACGGAAACGGCAGTGGCGGCAGGCATTCGTCGTATTGAGGCGATTACCGGTGAAACTGCAATCGAATGGTTACAAAACCAACAATCTTTATTAAATCAAAGCGCCGAATTACTGAAATCGGATGTTAATTCCATTACGGATAAGATTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACAAACATTAAAAGAAAAAGCTGCGCTGCAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTGTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAAT > 1/1584536‑1585026 | ccGATCAAGTACGCGTACTAACTATGGGAGATTTTTCCATTGAATTATGTGGTGGGATCCATGCGAAACGTACCGGCGACATCGGGCTGTTTAAAATAGTAACGGAAACGGCAGTGGCGGCAGGCATTCGTCGTATTGAGGCGATTACCGGTGAAACTGCAATCGAATGGTTACAAAACCAACAATCTTTATTAAATCAAAGCGCCGAGTTACTGAAATCGGATGTTAATTCCATTACGGATAAGGttt > 1:762805/1‑249 (MQ=255)ccGATCAAGTACGCGTACTAACTATGGGAGATTTTTCCATTGAATTATGTGGTGGGATCCATGCGAAACGTACCGGCGACATCGGGCTGTTTAAAATAGTAACGGAAACGGCAGTGGCGGCAGGCATTCGTCGTATTGAGGCGATTACCGGTGAAACTGCAATCGAATGGTTACAAAACCAACAATCTTTATTAAATCAAAGCGCCGAGTTACTGAAATCGGATGTTAATTCCATTACGGATAAGGttt > 1:266177/1‑249 (MQ=255) cGATCAAGTACGCGTACTAACTATGGGAGATTTTTCCATTGAATTATGTGGTGGGATCCATGCGAAACGTACCGGCGACATCGGGCTGTTTAAAATAGTAACGGAAACGGCAGTGGCGGCAGGCATTCGTCGTATTGAGGCGATTACCGGTGAAACTGCAATCGAATGGTTACAAAACCAACAATCTTTATTAAATCAAAGCGCCGAGTTACTGAAATCGGATGTTAATTCCATTACGGATAAGGTTtctc < 1:34293/251‑1 (MQ=255) gATCAAGTACGCGTACTAACTATGGGAGATTTTTCCATTGAATTATGTGGTGGGATCCATGCGAAACGTACCGGCGACATCGGGCTGTTTAAAATAGTAACGGAAACGGCAGTGGCGGCAGGCATTCGTCGTATTGAGGCGATTACCGGTGAAACTGCAATCGAATGGTTACAAAACCAACAATCTTTATTAAATCAAAGCGCCGAGTTACTGAAATCGGATGTTAATTCCATTACGGATAAGGTTtct > 1:532973/1‑249 (MQ=255) cAAGTACGCGTACTAACTATGGGAGATTTTTCCATTGAATTATGTGGTGGGATCCATGCGAAACGTACCGGCGACATCGGGCTGTTTAAAATAGTAACGGAAACGGCAGTGGCGGCAGGCATTCGTCGTATTGAGGCGATTACCGGTGAAACTGCAATCGAATGGTTACAAAACCAACAATCTTTATTAAATCAAAGCGCCGAGTTACTGAAATCGGATGTTAATTCCATTACGGATAAGGTTTCTCTGtt > 1:236098/1‑251 (MQ=255) cgTACTAACTATGGGAGATTTTTCCATTGAATTATGTGGTGGGATCCATGCGAAACGTACCGGCGACATCGGGCTGTTTAAAATAGTAACGGAAACGGCAGTGGCGGCAGGCATTCGTCGTATTGAGGCGATTACCGGTGAAACTGCAATCGAATGGTTACAAAACCAACAATCTTTATTAAATCAAAGCGCCGAGTTACTGAAATCGGATGTTAATTCCATTACGGATAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATa > 1:520729/1‑251 (MQ=255) ctaTGGGAGATTTTTCCATTGAATTATGTGGTGGGATCCATGCGAAACGTACCGGCGACATCGGGCTGTTTAAAATAGTAACGGAAACGGCAGTGGCGGCAGGCATTCGTCGTATTGAGGCGATTACCGGTGAAACTGCAATCGAATGGTTACAAAACCAACAATCTTTATTAAATCAAAGCGCCGAGTTACTGAAATCGGATGTTAATTCCATTACGGATAAGGTTTCTCTGTTGCAAGa > 1:247725/1‑241 (MQ=255) ctaTGGGAGATTTTTCCATTGAATTATGTGGTGGGATCCATGCGAAACGTACCGGCGACATCGGGCTGTTTAAAATAGTAACGGAAACGGCAGTGGCGGCAGGCATTCGTCGTATTGAGGCGATTACCGGTGAAACTGCAATCGAATGGTTACAAAACCAACAATCTTTATTAAATCAAAGCGCCGAGTTACTGAAATCGGATGTTAATTCCATTACGGATAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAg > 1:114479/1‑251 (MQ=255) ccATTGAATTATGTGGTGGGATCCATGCGAAACGTACCGGCGACATCGGGCTGTTTAAAATAGTAACGGAAACGGCAGTGGCGGCAGGCATTCGTCGTATTGAGGCGATTACCGGTGAAACTGCAATCGAATGGTTACAAAACCAACAATCTTTATTAAATCAAAGCGCCGAGTTACTGAAATCGGATGTTAATTCCATTACGGATAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAagag > 1:19069/1‑251 (MQ=255) gAATTATGTGGTGGGATCCATGCGAAACGTACCGGCGACATCGGGCTGTTTAAAATAGTAACGGAAACGGCAGTGGCGGCAGGCATTCGTCGTATTGAGGCGATTACCGGTGAAACTGCAATCGAATGGTTACAAAACCAACAATCTTTATTAAATCAAAGCGCCGAGTTACTGAAATCGGATGTTAATTCCATTACGGATAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACa > 1:539031/1‑251 (MQ=255) 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ccGGCGACATCGGGCTGTTTAAAATAGTAACGGAAACGGCAGTGGCGGCAGGCATTCGTCGTATTGAGGCGATTACCGGTGAAACTGCAATCGAATGGTTACAAAACCAACAATCTTTATTAAATCAAAGCGCCGAGTTACTGAAATCGGATGTTAATTCCATTACGGATAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACAAACATTAAAAGAAAAAGCTGCGCTGCAAGcc < 1:153561/251‑1 (MQ=255) cGGCGACATCGGGCTGTTTAAAATAGTAACGGAAACGGCAGTGGCGGCAGGCATTCGTCGTATTGAGGCGATTACCGGTGAAACTGCAATCGAATGGTTACAAAACCAACAATCTTTATTAAATCAAAGCGCCGAGTTACTGAAATCGGATGTTAATTCCATTACGGATAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACAAACATTAAAAGAAAAAGCTGCGCTGCAAGCCg > 1:246682/1‑251 (MQ=255) aCATCGGGCTGTTTAAAATAGTAACGGAAACGGCAGTGGCGGCAGGCATTCGTCGTATTGAGGCGATTACCGGTGAAACTGCAATCGAATGGTTACAAAACCAACAATCTTTATTAAATCAAAGCGCCGAGTTACTGAAATCGGATGTTAATTCCATTACGGATAAGGTTTCTCTGTTGCAAGa > 1:820480/1‑184 (MQ=255) aCATCGGGCTGTTTAAAATAGTAACGGAAACGGCAGTGGCGGCAGGCATTCGTCGTATTGAGGCGATTACCGGTGAAACTGCAATCGAATGGTTACAAAACCAACAATCTTTATTAAATCAAAGCGCCGAGTTACTGAAATCGGATGTTAATTCCATTACGGATAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACaaa > 1:14172/1‑216 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1:338756/1‑251 (MQ=255) cGGATAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACAAACATTAAAAGAAAAAGCTGCGCTGCAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGtt > 1:283252/1‑251 (MQ=255) ggATAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACAAACATTAAAAGAAAAAGCTGCGCTGCAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGAtttta < 1:324187/223‑4 (MQ=255) gATAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACAAACATTAAAAGAAAAAGCTGCGCTGCAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTAt > 1:212736/1‑155 (MQ=255) gATAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACAAACATTAAAAGAAAAAGCTGCGCTGCAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTaa > 1:441755/1‑251 (MQ=255) tAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACAAACATTAAAAGAAAAAGCTGCGCTGCAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCgtagt < 1:187825/234‑1 (MQ=255) tAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACAAACATTAAAAGAAAAAGCTGCGCTGCAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGtagtag > 1:241347/1‑236 (MQ=255) tAAGGTTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACAAACATTAAAAGAAAAAGCTGCGCTGCAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTTTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAAt > 1:744794/1‑250 (MQ=255) | CCGATCAAGTACGCGTACTAACTATGGGAGATTTTTCCATTGAATTATGTGGTGGGATCCATGCGAAACGTACCGGCGACATCGGGCTGTTTAAAATAGTAACGGAAACGGCAGTGGCGGCAGGCATTCGTCGTATTGAGGCGATTACCGGTGAAACTGCAATCGAATGGTTACAAAACCAACAATCTTTATTAAATCAAAGCGCCGAATTACTGAAATCGGATGTTAATTCCATTACGGATAAGATTTCTCTGTTGCAAGATAAATTTAAGAAAGTTGAAAAAGAGCTACAAACATTAAAAGAAAAAGCTGCGCTGCAAGCCGGTAATGACCTGGCACAAAGTGCGGTGAAAATTAATGGTGTTTCTGTCATTGCGCAACAACTTGATGGTATTGAAGCGAAGTCTTTACGTTCAATGGTCGATAGCCTGAAAAATCAATTAGGTTCGGCAGTGATTGTATTTGCTTCCGTAGTAGATGAAAAAGTTAAT > 1/1584536‑1585026 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |