| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,583,353 | G→A | D255N (GAT→AAT) | unknown → | Alanyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.7) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,583,353 | 0 | G | A | 100.0% | 160.3 / NA | 60 | D255N (GAT→AAT) | unknown | Alanyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.7) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (35/25); total (35/25) | |||||||||||
GCGATACCGGTCCTTGCGGTCCTTGTACCGAAATTTTCTACGATCATGGCGATCACATTTGGGGCGGACCGCCGGGATCGCCGGAAGAAGATGGCGATCGTTACATTGAAATCTGGAATATCGTGTTCATGCAATTTAATCGCCATGCCGATGGCACCATGGAAAAATTGCCGAAGCCTTCTGTGGATACCGGTATGGGCTTGGAGCGAATCAGTGCGGTGTTGCAACATGTGAATTCCAACTACGATATTGATATTTTCCAAAAATTAATTGCTAAAACGGCGGAATTAACCGGTGAAAAAGATTTAACCAATAAGTCTTTACGTGTGATTGCCGACCACATTCGTTCTTGCGCCTATTTAATCGTAGACGGTGTGGTACCTTCCAACGAAGGACGTGGCTATGTGCTGCGCCGTATTATTCGCCGCGCTGTGCGTCACGGGCATTTATTGGGTGCCGCCGAAGCGTTTTTCTATAAGCTCGTGCCAAC > 1/1583108‑1583597 | gCGATACCGGTCCTTGCGGTCCTTGTACCGAAATTTTCTACGATCATGGCGATCACATTTGGGGCGGACCGCCGGGATCGCCGGAAGAAGATGGCGATCGTTACATTGAAATCTGGAATATCGTGTTCATGCAATTTAATCGCCATGCCGATGGCACCATGGAAAAATTGCCGAAGCCTTCTGTGGATACCGGTATGGGCTTGGAGCGAATCAGTGCGGTGTTGCAACATGTGAATTCCAACTACaatat < 1:879940/250‑1 (MQ=255)gCGATACCGGTCCTTGCGGTCCTTGTACCGAAATTTTCTACGATCATGGCGATCACATTTGGGGCGGACCGCCGGGATCGCCGGAAGAAGATGGCGATCGTTACATTGAAATCTGGAATATCGTGTTCATGCAATTTAATCGCCATGCCGATGGCACCATGGAAAAATTGCCGAAGCCTTCTGTGGATACCGGTATGGGCTTGGAGCGAATCAGTGCGGTGTTGCAACATGTGAATTCCAACTACaatat < 1:79612/250‑1 (MQ=255)gCGATACCGGTCCTTGCGGTCCTTGTACCGAAATTTTCTACGATCATGGCGATCACATTTGGGGCGGACCGCCGGGATCGCCGGAAGAAGATGGCGATCGTTACATTGAAATCTGGAATATCGTGTTCATGCAATTTAATCGCCATGCCGATGGCACCATGGAAAAATTGCCGAAGCCTTCTGTGGATACCGGTATGGGCTTGGAGCGAATCAGTGCGGTGTTGCAACATGTGAATTCCAACTACaatat < 1:708630/250‑1 (MQ=255) aTACCGGTCCTTGCGGTCCTTGTACCGAAATTTTCTACGATCATGGCGATCACATTTGGGGCGGACCGCCGGGATCGCCGGAAGAAGATGGCGATCGTTACATTGAAATCTGGAATATCGTGTTCATGCAATTTAATCGCCATGCCGATGGCACCATGGAAAAATTGCCGAAGCCTTCTGTGGATACCGGTATGGGCTTGGAGCGAATCAGTGCGGTGTTGCAACATGTGAATTCCAACTACaatattgat > 1:46323/1‑251 (MQ=255) 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ttCCAACTACAATATTGATATTTTCCAAAAATTAATTGCTAAAACGGCGGAATTAACCGGTGAAAAAGATTTAACCAATAAGTCTTTACGTGTGATTGCCGACCACATTCGTTCTTGCGCCTATTTAATCGTAGACGGTGTGGTACCTTCCAACGAAGGACGTGGCTATGTGCTGCGCCGTATTATTCGCCGCGCTGTGCGTCACGGGCATTTATTGGGTGCCGCCGAAGCGTTTTTCTATAAGCt > 1:321018/1‑246 (MQ=255) cAACTACAATATTGATATTTTCCAAAAATTAATTGCTAAAACGGCGGAATTAACCGGTGAAAAAGATTTAACCAATAAGTCTTTACGTGTGATTGCCGACCACACTCGTTCTTGCGCCTATTTAATCGTAGAc > 1:384947/1‑133 (MQ=255) cTACAATATTGATATTTTCCAAAAATTAATTGCTAAAACGGCGGAATTAACCGGTGAAAAAGATTTAACCAATAAGTCTTTACGTGTGATTGCCGACCACATTCGTTCTTGCGCCTATTTAATCGTAGACGGTGTGGTACCTTCCAACGAAGGACGTGGCTATGTGCTGCGCCGTATTATTCGCCGCGCTGTGCGTCACGGGCATTTATTGGGTGCCGCCGAAGCGTTTTTCTATAAGCTCGTGCCAAc > 1:809413/1‑249 (MQ=255) | GCGATACCGGTCCTTGCGGTCCTTGTACCGAAATTTTCTACGATCATGGCGATCACATTTGGGGCGGACCGCCGGGATCGCCGGAAGAAGATGGCGATCGTTACATTGAAATCTGGAATATCGTGTTCATGCAATTTAATCGCCATGCCGATGGCACCATGGAAAAATTGCCGAAGCCTTCTGTGGATACCGGTATGGGCTTGGAGCGAATCAGTGCGGTGTTGCAACATGTGAATTCCAACTACGATATTGATATTTTCCAAAAATTAATTGCTAAAACGGCGGAATTAACCGGTGAAAAAGATTTAACCAATAAGTCTTTACGTGTGATTGCCGACCACATTCGTTCTTGCGCCTATTTAATCGTAGACGGTGTGGTACCTTCCAACGAAGGACGTGGCTATGTGCTGCGCCGTATTATTCGCCGCGCTGTGCGTCACGGGCATTTATTGGGTGCCGCCGAAGCGTTTTTCTATAAGCTCGTGCCAAC > 1/1583108‑1583597 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |