| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,576,852 | G→A | S233F (TCT→TTT) | unknown ← | Nucleoid‑associated protein NdpA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,576,852 | 0 | G | A | 100.0% | 186.8 / NA | 69 | S233F (TCT→TTT) | unknown | Nucleoid‑associated protein NdpA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (39/30); total (39/30) | |||||||||||
ATCCCAAATGATACGTTGATTAATTAACTCCGCATCAAAACTGATGGTCACTCCTTTGCCGGAACCGGAGAATTTCGTGAGCGACTTAAGTGCGGTGCGAACCGGCGGTATATTTTCTTCCAAGCCGTAATTTTGCGCTTGAGTAAACTCGGCAAAAGGTTGTTGGTTTAGAGTCGGCAGCTCGCCGGAAAGTTCCGTAAGTTCAATGTCTTCGCCGTTATTTATCTGTCCTTTGCAGTATTCAGACACCTGTTTTTTTACCGCTTGGGTTTGTTCACGATTTAACTCGCCTTGTGCGCAGTAATCACTCACCGCCTGTAATAAACATTGATTTTGTACTTGCGGGTTAAGCCCTTCTTCCGCACCCAGAAAATCCATAAAGAAGTCCGCGATTTTGCGCCCGACGCGCCCTTTGATGAAGGTTAAGTAACGATTGGAATTGGCATTAAGTTGCAGGTCGGTTAAATTAATACGTGCTGCCACATCAAAT > 1/1576608‑1577097 | aTCCCAAATGATACGTTGATTAATTAACTCCGCATCAAAACTGATGGTCACTCCTTTGCCGGAACCGGAGAATTTCGTGAGCGACTTAAGTGCGGTGCGAACCGGCGGTATATTTTCTTCCAAGCCGTAATTTTGCGCTTGAGTAAACTCGGCAAAAGGTTGTTGGTTTAGAGTCGGCAGCTCGCCGGAAAGTTCCGTAAGTTCAATGTCTTCGCCGTTATTTATCTGTCCTTTGCAGGATTCAAacac > 1:487813/1‑249 (MQ=255) 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gTATTCAAACACCTGTTTTTTTACCGCTTGGGTTTGTTCACGATTTAACTCGCCTTGTGCGCAGTAATCACTCACCGCCTGTAATAAACATTGATTTTGTACTTGCGGGTTAAGCCCTTCTTCCGCACCCAGAAAATCCATAAAGAAGTCCGCGATTTTGCGCCCGACGCGCCCTTTGATGAAGGTTAAGTAACGATTGGAATTGGCATTAAGTTGCAGGTCGGTTAAATTAATACGTGCTGCCACATCaa > 1:463035/1‑251 (MQ=255) tATTCAAACACCTGTTTTTTTACCGCTTGGGTTTGTTCACGATTTAACTCGCCTTGTGCGCAGTAATCACTCACCGCCTGTAATAAACATTGATTTTGTACTTGCGGGTTAAGCCCTTCTTCCGCACCCAGAAAATCCATAAAGAAGTCCGCGATTTTGCGCCCGACGCGCCCTTTGATGAAGGTTAAGTAACGATTGGAATTGGCATTAAGTTGCAGGTCGGTTAAATTAATACGTGCTGCCACATc < 1:275749/248‑1 (MQ=255) aTTCAAACCCCTTTTTTTTTACCGCTTGGGTTTGTTCACGATTTAACTCGCCTTGTGCGCAGTAATCACTCACCGCCTGTAATAAACATTGATTTTGTACTTGCGGGTTAAGCCCTTCTTCCGCACCCAGAAAATCCATAAAGAAGTCCGCGATTTTGCGCCCGACGCGCCCTTTGATGAAGGTTAAGTAACGATTGGAATTGGCATTAAGTTGCAGGTCGGTTAAATTAATACg < 1:20330/235‑1 (MQ=255) aTTCAAACACCTTTTTTTTTACCGCTTGGGTTTGTTCACGATTTAACTCGCCTTGTGCGCAGTAATCTCTCACCGCCTGTAATAAACATTGATTTTGTACTTGCGGGTTAAGCCCTTCTTCCGCACCCAGAAAATCCATAAAGAAGTCCGCGATTTTGCGCCCGACGCGCCCTTTGATGAAGGTTAAGTAACGATTGGaa < 1:229499/200‑1 (MQ=255) aTTCAAACACCTGTTTTTTTACCGCTTGGGTTTGTTCACGATTTAACTCGCCTTGTgc > 1:798279/1‑58 (MQ=255) aTTCAAACACCTGTTTTTTTACCGCTTGGGTTTGTTCACGATTTAACTCGCCTTGTGCGCAGTAATCACTCACCGCCTGTAATAAACATTGATTTTGTACTTGCGGGTTAAGCCCTTCTTCCGCACCCAGaa > 1:787350/1‑132 (MQ=255) aTTCAAACACCTGTTTTTTTACCGCTTGGGTTTGTTCACGATTTAACTCGCCTTGTGCGCAGTAATCACTCACCGCCTGTAATAAACATTGATTTTGTACTTGCGGGTTAAGCCCTTCTTCCGCACCCAGAAAATCCATAAAGAAGTCCGCGATTTTGCGCCCGACGCGCCCTTtgatga > 1:263760/1‑180 (MQ=255) aTTCAAACACCTGTTTTTTTACCGCTTGGGTTTGTTCACGATTTAACTCGCCTTGTGCGCAGTAATCACTCACCGCCTGTAATAAACATTGATTTTGTACTTGCGGGTTAAGCCCTTCTTCCGCACCCAGAAAATCCATAAAGAAGTCCGCGATTTTGCGCCCGACGCGCCCTTTGATGAAGGTTAAGTAACGATTGGAATTGGCATTAAGTTGCAGGt > 1:390060/1‑219 (MQ=255) aTTCAAACACCTGTTTTTTTACCGCTTGGGTTTGTTCACGATTTAACTCGCCTTGTGCGCAGTAATCACTCACCGCCTGTAATAAACATTGATTTTGTACTTGCGGGTTAAGCCCTTCTTCCGCACCCAGAAAATCCATAAAGAAGTCCGCGATTTTGCGCCCGACGCGCCCTTTGATGAAGGTTAAGTAACGATTGGAATTGGCATTAAGTTGCAGGTCGGTTAAATTAATACGTGCTGCCACATCAAAt > 1:798803/1‑251 (MQ=255) | ATCCCAAATGATACGTTGATTAATTAACTCCGCATCAAAACTGATGGTCACTCCTTTGCCGGAACCGGAGAATTTCGTGAGCGACTTAAGTGCGGTGCGAACCGGCGGTATATTTTCTTCCAAGCCGTAATTTTGCGCTTGAGTAAACTCGGCAAAAGGTTGTTGGTTTAGAGTCGGCAGCTCGCCGGAAAGTTCCGTAAGTTCAATGTCTTCGCCGTTATTTATCTGTCCTTTGCAGTATTCAGACACCTGTTTTTTTACCGCTTGGGTTTGTTCACGATTTAACTCGCCTTGTGCGCAGTAATCACTCACCGCCTGTAATAAACATTGATTTTGTACTTGCGGGTTAAGCCCTTCTTCCGCACCCAGAAAATCCATAAAGAAGTCCGCGATTTTGCGCCCGACGCGCCCTTTGATGAAGGTTAAGTAACGATTGGAATTGGCATTAAGTTGCAGGTCGGTTAAATTAATACGTGCTGCCACATCAAAT > 1/1576608‑1577097 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |