| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,569,978 | G→A | intergenic (‑60/‑66) | unknown ← / → unknown | Uncharacterized protein YjgR/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,569,978 | 0 | G | A | 100.0% | 178.2 / NA | 65 | intergenic (‑60/‑66) | unknown/unknown | Uncharacterized protein YjgR/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (31/34); total (31/34) | |||||||||||
CCTTTTACATCCACTAAAAATACCGGCACGCCGTCATCACTGAAGGTTTCCGCCATTTTGCGTAAGGTGACGGTTTTACCGGTTCCAGTGGCGCCGGCGATTAAGCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTGCGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAGTGCCGGTGGAGGCGGTGAAAATTCACTCACTTGGTGCGGAAGGCAATGATGTGGGATTGAAAGCCCATCATGGCGGTGTGGAT > 1/1569740‑1570220 | ccTTTTACATCCACTAAAAATACCGGCACGCCGTCATCACTGAAGGTTTCCGCCATTTTGCGTAAGGTGACGGTTTTACCGGTTCCAGTGGCGCCGGCGATTAAGCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAAt < 1:784225/251‑1 (MQ=255) tttACATCCACTAAAAATACCGGCACGCCGTCATCACTGAAGGTTTCCGCCATTTTGCGTAAGGTGACGGTTTTACCGGTTCCAGTGGCGCCGGCGATTAAGCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAg < 1:888526/251‑1 (MQ=255) ccACTAAAAATACCGGCACGCCGTCATCACTGAAGGTTTCCGCCATTTTGCGTAAGGTGACGGTTTTACCGGTTCCAGTGGCGCCGGCGATTAAGCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGtttt > 1:622778/1‑251 (MQ=255) aaaaaTACCGGCACGCCGTCATCACTGAAGGTTTCCGCCATTTTGCGTAAGGTGACGGTTTTACCGGTTCCAGTGGCGCCGGCGATTAAGCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACgg < 1:668238/251‑1 (MQ=255) cGGCACGCCGTCATCACTGAAGGTTTCCGCCATTTTGCGTAAGGTGACGGTTTTACCGGTTCCAGTGGCGCCGGCGATTAAGCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTc < 1:444978/251‑1 (MQ=255) gCCGTCATCACTGAAGGTTTCCGCCATTTTGCGTAAGGTGACGGTTTTACCGGTTCCAGTGGCGCCGGCGATTAAGCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGa > 1:504408/1‑251 (MQ=255) catcaCTGAAGGTTTCCGCCATTTTGCGTAAGGTGACGGTTTTACCGGTTCCAGTGGCGCCGGCGATTAAGCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTc > 1:477251/1‑240 (MQ=255) tcaCTGAAGGTTTCCGCCATTTTGCGTAAGGTGACGGTTTTACCGGTTCCAGTGGCGCCGGCGATTAAGCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGa < 1:713499/251‑1 (MQ=255) caCTGAAGGTTTCCGCCATTTTGCGTAAGGTGACGGTTTTACCGGTTCCAGTGGCGCCGGCGATTAAGCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATGAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTc > 1:424036/1‑237 (MQ=255) cTGAAGGTTTCCGCCATTTTGCGTAAGGTGACGGTTTTACCGGTTCCAGTGGCGCCGGCGATTAAGCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGaaaa > 1:465694/1‑251 (MQ=255) aTTTTGCGTAAGGTGACGGTTTTACCGGTTCCAGTGGCGCCGGCGATTAAGCCGTGGCGGTTTGCCCTTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTc > 1:883200/1‑220 (MQ=255) tGCGTAAGGTGACGGTTTTACCGGTTCCAGTGGCGCCGGCGATTAAGCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGc < 1:94135/251‑1 (MQ=255) gCGTAAGGTGACGGTTTTACCGGTTCCAGTGGCGCCGGCGATTAAGCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCa > 1:221680/1‑251 (MQ=255) gCGTAAGGTGACGGTTTTACCGGTTCCAGTGGCGCCGGCGATTAAGCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCa > 1:68255/1‑251 (MQ=255) cGTAAGGTGACGGTTTTACCGGTTCCAGTGGCGCCGGCGATTAAGCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCa < 1:572074/250‑1 (MQ=255) aGGTGACGGTTTTACCGGTTCCAGTGGCGCCGGCGATTAAGCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGc > 1:628715/1‑245 (MQ=255) ggTTTTACCGGTTCCAGTGGCGCCGGCGATTAAGCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAg < 1:811843/231‑1 (MQ=255) aTTAAGCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAggg < 1:776697/199‑1 (MQ=255) tAAGCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAg < 1:119699/251‑1 (MQ=255) gCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTc < 1:370072/170‑1 (MQ=255) tGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTAcc < 1:302140/250‑1 (MQ=255) gCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCtt < 1:373353/250‑1 (MQ=255) ccATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACgg < 1:868362/251‑1 (MQ=255) gAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTAt < 1:686254/250‑1 (MQ=255) gAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATg > 1:549418/1‑251 (MQ=255) aaTGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGaa < 1:830012/251‑1 (MQ=255) gAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTAcc > 1:410351/1‑194 (MQ=255) aGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTg < 1:883185/139‑1 (MQ=255) aGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCa > 1:106775/1‑145 (MQ=255) aGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAAtt > 1:580672/1‑157 (MQ=255) aGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAg > 1:115010/1‑219 (MQ=255) aGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTG‑TTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTAcc < 1:217476/192‑1 (MQ=255) atatTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGaaa < 1:805994/213‑1 (MQ=255) atatTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGaa > 1:120296/1‑212 (MQ=255) atatTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAGTGCCGGTGGAGGCGGTGAAAAtt > 1:859138/1‑251 (MQ=255) tatTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAGTGCCGGTGGAGGCGGTGAAAATtc < 1:245684/251‑1 (MQ=255) ttGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAGTGCCGGTGGAGGCGGTGAAAATtca > 1:569972/1‑250 (MQ=255) ttGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAGTGCCGGTGGAGGCGGTGAAAATtca > 1:416552/1‑250 (MQ=255) gCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAg < 1:403669/177‑1 (MQ=255) cATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAg < 1:525795/208‑1 (MQ=255) aTGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAGTGCCGGTGGAGGCGGTGAAAATtcactca > 1:836279/1‑250 (MQ=255) aTGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAGTGCCGGTGGAGGCGGTGAAAATtcactca > 1:265806/1‑250 (MQ=255) gTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTAcc > 1:874085/1‑179 (MQ=255) gTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAGTGCCGGTGGAGGCGGTGAAAATTCACTCACtt > 1:360627/1‑251 (MQ=255) gtTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAg > 1:179229/1‑166 (MQ=255) gtTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTAcc > 1:666535/1‑172 (MQ=255) gtTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTg < 1:486476/190‑1 (MQ=255) gtTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGaa < 1:21847/196‑1 (MQ=255) gtTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAGTGCCGGTGGAGGCGGTGAAAATtc < 1:530327/236‑1 (MQ=255) gtTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATCAAAGCGCCATTCGAAAAGTGCCGGTGGAGGCGGTGAAAATTCACTCACTTGGTGCgg > 1:869319/1‑251 (MQ=255) ttCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAg < 1:585660/165‑1 (MQ=255) tCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAAttt < 1:488554/135‑1 (MQ=255) ccTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAGTGCCGGTGGAGGCGGTGAAAATTCACTCACTTGGTGCGGAAg < 1:121888/251‑1 (MQ=255) atgaCGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAGTGCCGGTGGAGGCGGTGAAAATTCACTCACTTGGTGCGGAAGGCAatga < 1:170526/250‑1 (MQ=255) aTAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAGTGCCGGTGGAGGCGGTGAAAATtc < 1:12659/218‑1 (MQ=255) aTTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAGTGCCGGTGGAGGCGGTGAAAATTTACTCACTTGGTGCGGAAGGCAATGATGTGGGATTGaa > 1:390814/1‑251 (MQ=255) tttCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAGTGCCGGTGGAGGCGGTGAAAATTCACTCACTTGGTGCGGAAGGCAATGATGTGGGATTTaaa > 1:246113/1‑251 (MQ=255) atatTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACg > 1:842520/1‑45 (MQ=255) atatTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAGTGCCGGTGGAGGCGGTGAAAATTCACTCACTTTGTGCGGAAGGCAATGATGTGGGATTGAAAACCCATCATgg > 1:54565/1‑251 (MQ=255) tatTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAGTGCCGGTGGAGGCGGTGAAAATTCACTCACTTGGTGCGGAAGGCAATGATGTGGGATTGAAAGCCCATCATGGc < 1:348740/251‑1 (MQ=255) atTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTg > 1:543732/1‑82 (MQ=255) atTTAAAAATAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAGTGCCGGTg < 1:479128/184‑1 (MQ=255) aaaTAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAGTGCCGGTGGAGGCGGTGAAAATTCACTCACTTGGTGCGGAAGGCAATGATGTGGGATTGaa < 1:664873/231‑1 (MQ=255) aTAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAGTGCCGGTGGAGGCGGTGAAAATTCACTCACTTGGTGCGGAAGGCAATGATGTGGGATTGAAAGCCCATCATGGCGGTGTGGAt < 1:182136/251‑1 (MQ=255) tAGAAGTACGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAg > 1:645120/1‑167 (MQ=255) | CCTTTTACATCCACTAAAAATACCGGCACGCCGTCATCACTGAAGGTTTCCGCCATTTTGCGTAAGGTGACGGTTTTACCGGTTCCAGTGGCGCCGGCGATTAAGCCGTGGCGGTTTGCCATTTTGGCGGAAATGCCGAATTGTTGATTTTGTTCGGTTTGGGCGAGTAAATATTGCATGTTGAGTGTTCCTGATTGATGACGGATAAATTTCCCGCATGATATTTAAAAATAGAAGTGCGGTCAAAAAATAAGTTGTTTTTACGGTATAATTCCGCAGATTTTAGAAAATAACAGGGAAAGTGATGGCAACGGCAGAAATTTTGATCATTAAAATCGGCAAGGTGCAACAGCTTACCTTTGCCGACGGTTCGCTGTATGAAAGCGCCATTCGCAAAGTGCCGGTGGAGGCGGTGAAAATTCACTCACTTGGTGCGGAAGGCAATGATGTGGGATTGAAAGCCCATCATGGCGGTGTGGAT > 1/1569740‑1570220 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |