| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,569,282 | A→G | C213R (TGT→CGT) | unknown ← | Uncharacterized protein YjgR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,569,282 | 0 | A | G | 100.0% | 216.4 / NA | 80 | C213R (TGT→CGT) | unknown | Uncharacterized protein YjgR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (45/35); total (45/35) | |||||||||||
CGCCTTTGGAGCGAATCAGGCGCACAACCTGTTCCACTTTATCCACCAATACACTTGGCGCGCCGTCGAACAGCAAGTGAGCTTCGTCAAAGAACATGACGAATTTCGGTTTGTCGGGGTCGCCCACTTCCGGCAATTGCTCAAATAATTCCGCCATTAACCAAAGCAGGAAGGCGCTGTACATGCGCGGAGAATTGATCAGTTTTTCCGAATTTAACACATTGATGACACCACGACCGTCACAGGTTTGCAACCAGTCTTCCAGATTCAGCGCCGGTTCGCCGAATAAATTTGCCGCGCCTTCATTTTCCAGCGTTAATAATGCCCGTTGGATGGCTCCCACGCTGGCAGCGGATACATTACCGTATTCCACTTGGAAGGTTTTGGCATTTTCCGCCACATATTTCAACATGGCGCGCAGATCTTTTAAGTCGATAAGCAATAAGCCTTTGTCGTCGGCTACGCGGAACACCAGATTGAGCAAGCC > 1/1569039‑1569525 | cGCCTTTGGAGCGAATCAGGCGCACAACCTGTTCCACTTTATCCACCAATACACTTGGCGCGCCGTCGAACAGCAAGTGAGCTTCGTCAAAGAACATGACGAATTTCGGTTTGTCGGGGTCGCCCACTTCCGGCAATTGCTCAAATAATTCCGCCATTAACCAAAGCAGGAAGGCGCTGTACATGCGCGGAGAATTGATCAGTTTTTCCGAATTTAACACATTGATGACACCACGACCGTCACGGGTTTg > 1:185898/1‑250 (MQ=255) 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1:83342/1‑229 (MQ=255) gTACATGCGCGGAGAATTGATCAGTTTTTCCGAATTTAACACATTGATGACACCACGACCGTCACGGGTTTGCAACCAGTCTTCCAGATTCAGCGCCGGTTCGCCGAATAAATTTGCCGCGCCTTCATTTTCCAGCGTTAATAATGCCCGTTGGATGGCTCCCACGCTGGCAGCGGATACATTACCGTATTCCACTTGGAAGGTTTTGGCATTTTCCGCCACATATTTCAACATGGCGCGCAGATCTTTTa > 1:278712/1‑251 (MQ=255) gTACATGCGCGGAGAATTGATCAGTTTTTCCGAATTTAACACATTGATGACACCACGACCGTCACGGGTTTGCAACCAGTCTTCCAGATTCAGCGCCGGTTCGCCGAATAAATTTGCCGCGCCTTCATTTTCCAGCGTTAATAATGCCCGTTGGATGGCTCCCACGCTGGCAGCGGATACATTACCGTATTCCACTTGGAAGGTTTTGGCATTTTCCGCCACATATTTCAACATGGCGCGCAGATCTTTTa > 1:104539/1‑251 (MQ=255) cATGCGCGGAGAATTGATCAGTTTTTCCGAATTTAACACATTGATGACACCACGACCGTCACGGGTTTGCAACCAGTCTTTTAGATTCAGCGCCGGTTCGCCGAATAAATTTGCCGCGCCTTCATTTTCCAGCGTTAATAATGCCCGTTGGATGGCTCCCACGCTGGCAGCGGATACATTACCGTATTCCACTTGGAAGGTTTTGGCATTTTCCGCCACATATTTCAACATGGCGCGCAGATCTTTTAAGt < 1:439852/251‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ccGTCACGGGTTTGCAACCAGTCTTCCAGATTCAGCGCCGGTTCGCCGAATAAATTTGCCGCGCCTTCATTTTCCAGCGTTAATAATGCCCGTTGGATGGCTCCCACGCTGGCAGCGGATACATTACCGTATTCCACTTGGAAGGTTTTGGCATTTTCCGCCACATATTTCAACATGGCGCGCAGATCTTTTAAGTCGATAAGCAATAAGCCTTTGTCGTCGGCTACGCGGAACACCAGATTGAGCAAGcc < 1:201059/251‑1 (MQ=255) cGTCACGGGTTTGCAACCAGTCTTCCAGATTCAGCGCCGGTTCGCCGAATAAATTTGCCGCGCCTTCATTTTCCAGCGTTAATAATGCCCGTTGGATGGCTCCCACGCTGGCAGCGGATACATTACCGTATTCCACTTGGAAGGTTTTGGCATTTTCCGCCACATATTTCAACATGGCGCGCAGATCTTTTAAGTCGATAAGCAATAAGCCTTTGTCGTCGGCTACGCGGAACACCAGATTGAGCAAGc > 1:301014/1‑249 (MQ=255) | CGCCTTTGGAGCGAATCAGGCGCACAACCTGTTCCACTTTATCCACCAATACACTTGGCGCGCCGTCGAACAGCAAGTGAGCTTCGTCAAAGAACATGACGAATTTCGGTTTGTCGGGGTCGCCCACTTCCGGCAATTGCTCAAATAATTCCGCCATTAACCAAAGCAGGAAGGCGCTGTACATGCGCGGAGAATTGATCAGTTTTTCCGAATTTAACACATTGATGACACCACGACCGTCACAGGTTTGCAACCAGTCTTCCAGATTCAGCGCCGGTTCGCCGAATAAATTTGCCGCGCCTTCATTTTCCAGCGTTAATAATGCCCGTTGGATGGCTCCCACGCTGGCAGCGGATACATTACCGTATTCCACTTGGAAGGTTTTGGCATTTTCCGCCACATATTTCAACATGGCGCGCAGATCTTTTAAGTCGATAAGCAATAAGCCTTTGTCGTCGGCTACGCGGAACACCAGATTGAGCAAGCC > 1/1569039‑1569525 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |