| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,552,909 | C→A | T19K (ACA→AAA) | unknown → | NADH pyrophosphatase (EC 3.6.1.22), decaps 5'‑NAD modified RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,552,909 | 0 | C | A | 100.0% | 158.4 / NA | 59 | T19K (ACA→AAA) | unknown | NADH pyrophosphatase (EC 3.6.1.22), decaps 5'‑NAD modified RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (30/29); total (30/29) | |||||||||||
CGCGACGGCGATAAGTACAAACTCACCTTCAGCGAGTTTGTGAAAGACTAAAATTTTATCGAAAAACAAGGCCGCCTGAATAAAAAAATTGACTTTTTATTGAAAAGTGCGATCACAAAAAACAACGTTTTTTTAAATCGGGTGAATAAAAATTTATGTATTTCTCACGCAGTTAAACAGGTGCTAAAAATGAACGCTATTCAGCCTGAAGATAAGAGCTTTTGGCTTTTCACTCAGGGATCAACAATACATTTAATTGACGGCAAGCTTCCTTTCGGCAATGCCACCGAACTGGGTTTCGTCGGGCTTCATGCTATGCGCATCGGCGAATGGCTGGAGCAACCGTTATATTTGGTGGAAACCCAACCGAACGACAACCGCACCTATTTTTCTTTACGCGATCAACTGCCGCTGCCGCAAGCGCAATTTAATCTGTTGAGCTGCGGCGTGGAGTTAAATCATTTCTATCAGACCCATCAATTC > 1/1552665‑1553147 | cgcgACGGCGATAAGTACAAACTCACCTTCAGCGAGTTTGTGAAAGACTAAAATTTTATCGAAAAACAAGGACGCCTGAATAAAAAAATTGACTTTTTATTGAAAAGTGCGATCACAAAAAACAACGTTTTTTTAAATCGGGTGAATAAAAATTTATGTATTTCTCACGCAGTTAAACAGGTGCTAAAAATGAACGCTATTCAGCCTGAAGATAAGAGCTTTTGGCTTTTCACTCAGGGATCAAAAATACa > 1:711970/1‑251 (MQ=255) 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1:891312/251‑1 (MQ=255) cTCAGGGATCAAAAATACATTTAATTGACGGCAAGCTTCCTTTCGGCAATGCCACCGAACTGGGTTTCGTCGGGCTTCATGCTATGCGCATCGGCGAATGGCTGGAGCAACCGTTATATTTGGTGGAAACCCAACCGAACGACAACCGCACCTATTTTTCTTTACGCGATCAACTGCCGCTGCCGCAAGCGCAATTTAATCTGTTGAGCTGCGGCGTGGAGTTAAATCATTTCTATCAGACCCATCAATTc < 1:250646/251‑1 (MQ=255) cTCAGGGATCAAAAATACATTTAATTGACGGCAAGCTTCCTTTCGGCAATGCCACCGAACTGGGTTTCGTCGGGCTTCATGCTATGCGCATCGGCGAATGGCTGGAGCAACCGTTATATTTGGTGGAAACCCAACCGAACGACAACCGCACCTATTTTTCTTTACGCGATCAACTGCCGCTGCCGCAAGCGCAATTTAATCTGTTGAGCTGCGGCGTGGAGTTAAATCATTTCTATCAGACCCATCAATTc < 1:225328/251‑1 (MQ=255) gATCAAAAATACATTTAATTGACGGCAAGCTTCCTTTCGGCAATGCCACCGAACTGGGTTTCGTCGGGCTTCATGCTATGCGCATCGGCGAATGGCTGGAGCAACCGTTATATTtggtgg < 1:463927/120‑1 (MQ=255) | CGCGACGGCGATAAGTACAAACTCACCTTCAGCGAGTTTGTGAAAGACTAAAATTTTATCGAAAAACAAGGCCGCCTGAATAAAAAAATTGACTTTTTATTGAAAAGTGCGATCACAAAAAACAACGTTTTTTTAAATCGGGTGAATAAAAATTTATGTATTTCTCACGCAGTTAAACAGGTGCTAAAAATGAACGCTATTCAGCCTGAAGATAAGAGCTTTTGGCTTTTCACTCAGGGATCAACAATACATTTAATTGACGGCAAGCTTCCTTTCGGCAATGCCACCGAACTGGGTTTCGTCGGGCTTCATGCTATGCGCATCGGCGAATGGCTGGAGCAACCGTTATATTTGGTGGAAACCCAACCGAACGACAACCGCACCTATTTTTCTTTACGCGATCAACTGCCGCTGCCGCAAGCGCAATTTAATCTGTTGAGCTGCGGCGTGGAGTTAAATCATTTCTATCAGACCCATCAATTC > 1/1552665‑1553147 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |