| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,550,411 | A→G | V468A (GTG→GCG) | unknown ← | Phosphoenolpyruvate carboxykinase [ATP] (EC 4.1.1.49) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,550,411 | 0 | A | G | 100.0% | 259.2 / NA | 93 | V468A (GTG→GCG) | unknown | Phosphoenolpyruvate carboxykinase [ATP] (EC 4.1.1.49) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (47/46); total (47/46) | |||||||||||
TCGTATAACGGGGATTTTTGTTATATAAGCCGATTACGCTTTGGGCCCGGCAGAAATTAAGGCTTTACCTTCTGCATTGGTAGCGTATTTTTCGAAATTCTTCACAAAACGACCAGCAAGATCTTTCGCTTTGGCTTCCCATTGCGCTTTATCGGCATAAGTATCACGCGGATCTAAAATAGCCGGATCAACGCCGGGTAATGCCTTAGGAATTGCCAAATTGAAGATTGGTAATTCGCTCATTTGCACTTTTTCGATAGAACCGTCTAAGATGGCGTCGATAATACCGCGCGTATCTTTAATGGAGATACGTTTGCCCGTGCCGTTCCAACCGGTGTTCACCAAATAGGCTTCCGCACCTGCCGCTTGCATACGTTTTACCAACACTTCCGCATATTGGGTTGGGTGTAAGGTTAAGAATGCCGCACCGAAACAAGCGGAGAATGTTGGGGTCGGTTCGGTAATACCACGTTCGGTACCGGCT > 1/1550164‑1550647 | tCGTATAACGGGGATTTTTGTTATATAAGCCGATTACGCTTTGGGCCCGGCAGAAATTAAGGCTTTACCTTCTGCATTGGTAGCGTATTTTTCGAAATTCTTCACAAAACGACCAGCAAGATCTTTCGCTTTGGCTTCCCATTGCGCTTTATCGGCATAAGTATCACGCGGATCTAAAATAGCCGGATCAACGCCGGGTAATGCCTTAGGAATTGCCAAATTGAAGATTGGTAATTCGCTCATTTGCGCtt > 1:840303/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |